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6实验步骤 (1)每5人为一组,每人取5个02ml的PCR管,按顺序写上编号。 (2)配制RAPD扩增的反应液,各组份的用量及终浓度如下表: 如果是做多个反应,可将所用的相同组份一次取样、混合后再分装至各个反应中。 本实验中,每组用1种引物,每人做5种模板,每组共做25个反应。需另取1个0.5l 的PCR管配制混合液,然后分装到25个管中,每管分装量为22μL(由一位同学操作)。 注意:模板DNA不与其它组份混合,需预先加到5个管中。 组份 体积(1个反应) 终浓度 25个反应 ddH2O 经验值为16.6μL 10×buffer缓冲液(无Mg2*) 25uL 1× 25 nM MgCl2溶液 2.0μL 2mM 2 5mMdNTP 1.0uL 0.1mM 5M随机引物 1.0μL 0.2μM 模板DNA 3.0uL 约15ng/25μL Tag酶(3U/μL) 0.33μL IU25μL 总体积 25μL (3)RAPD扩增:配制好反应液后,放入PCR仪中进行扩增反应,扩增程序为:94℃5 (预变性):94℃40”→38℃1'→72℃1'(40个循环):72℃10'(延伸 反应)。 (4)制备1.5%的琼脂糖凝胶:称取适量琼脂糖、量取适量TBE电泳缓冲液,混合后 于微波炉中加热至溶化,补充蒸发的水分,制备得到浓度准确的琼脂糖凝胶, 适当冷却后小心倒胶,待凝胶板完全冷却后,小心拔去梳子,将胶板放入电泳 槽中,加电泳液淹没胶面。本实验中,需制作3块300ml的琼脂糖凝胶。 (5)电泳、染色及观察: 在每个反应产物中,加入适量的载样缓冲液,混合均匀,得到混合物: 于每个梳孔中,点加适量的混合物(20μL),每排梳孔中最左边的梳孔用于点 加DNA Marker(分子量标记物),以便计算分子量: 以2~3Vcm的电压进行衡压电泳,待溴酚蓝条带泳动至胶板底端时停止电泳: 将胶块没入EB染液中染色1~2h,用自来水冲洗后于凝胶成像系统上扫描成像 99 6 实验步骤 (1) 每 5 人为一组,每人取 5 个 0.2ml 的 PCR 管,按顺序写上编号。 (2) 配制 RAPD 扩增的反应液,各组份的用量及终浓度如下表: 如果是做多个反应,可将所用的相同组份一次取样、混合后再分装至各个反应中。 本实验中,每组用 1 种引物,每人做 5 种模板,每组共做 25 个反应。需另取 1 个 0.5ml 的 PCR 管配制混合液,然后分装到 25 个管中,每管分装量为 22μL(由一位同学操作)。 注意:模板 DNA 不与其它组份混合,需预先加到 5 个管中。 组份 体积(1 个反应) 终浓度 25 个反应 ddH2O 经验值为 16.6μL 10×buffer 缓冲液(无 Mg2+) 2.5μL 1× 25mM MgCl2 溶液 2.0μL 2mM 2.5mM dNTP 1.0μL 0.1mM 5μM 随机引物 1.0μL 0.2μM 模板 DNA 3.0μL 约 15ng/25μL Taq 酶(3U/μL) 0.33μL 1U/25μL 总体积 25μL (3) RAPD 扩增:配制好反应液后,放入 PCR 仪中进行扩增反应,扩增程序为:94℃ 5′ (预变性);94℃ 40″→38℃ 1′→72℃ 1′(40 个循环);72℃ 10′(延伸 反应)。 (4) 制备 1.5%的琼脂糖凝胶:称取适量琼脂糖、量取适量 TBE 电泳缓冲液,混合后 于微波炉中加热至溶化,补充蒸发的水分,制备得到浓度准确的琼脂糖凝胶, 适当冷却后小心倒胶,待凝胶板完全冷却后,小心拔去梳子,将胶板放入电泳 槽中,加电泳液淹没胶面。本实验中,需制作 3 块 300ml 的琼脂糖凝胶。 (5) 电泳、染色及观察: 在每个反应产物中,加入适量的载样缓冲液,混合均匀,得到混合物; 于每个梳孔中,点加适量的混合物(20μL),每排梳孔中最左边的梳孔用于点 加 DNA Marker(分子量标记物),以便计算分子量; 以 2~3V/cm 的电压进行衡压电泳,待溴酚蓝条带泳动至胶板底端时停止电泳; 将胶块没入 EB 染液中染色 1~2h,用自来水冲洗后于凝胶成像系统上扫描成像
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