1358 植物遗传资源学报 卷 表2(续) 作物 种质(群体)数量种质(群体)类型驯化区段或 Type of accessions 鉴定手段 分析内容 参考文献 Amount o QTLs Crops Methods accessions( families families Number of QTls Analysis performed Reference 野生种(52)地 代基因组重测序,SNP鉴定,主成分分析,[33 方品种(213),育 测序深度:野生种(平进化树,Fsr,遗传多样 品种(215) 均64×),地方品种性(τ),连锁不平衡,全 (平均64X)育成品基因组关联分析,选择 种(平均6.4×) 性鉴定(w/m。),CLR 梨 种(57)地 代基因组重测序,SNP鉴定,主成分分[39] 方品种(56)(候选基因)测序深度:野生种(平析,进化树,Fsr,遗传 均11×),地方品种多样性(m),连锁不平 (平均11×) 衡,基因漂流,ROD,群 体结构,IBD 柑橘 野生种(13) 1600个二代基因组重测序,主成分分析,进化树,[40] Orans 地方品种(91) 测序深度:野生种(平Fx,遗传多样性() 均35×),地方品种SNP鉴定, XP-CLR,基 (平均35×) 因漂流 野生种(5)地方 代基因组重测序,SNP鉴定,主成分分析 Cotton 品种(43),育成 测序深度:野生种(平进化树,群体结构,F 品种(95) 均5.17×)地方品种遗传多样性(m),选择 (平均517×),育成性鉴定(c/m 品种(平均5.17×) 大麦 野生种(344),地137个 umina enrichment SNP鉴定,主成分分[42] 方品种(89) 析,群体结构,CLR,遗 传多样性(T),选择性 鉴定(w/re) 野生种(188) 个SNP芯片 SNP鉴定,Fr,lnRH,进[43] 地方品种(84) 匕树 育成品种(429) 野生种ⅹ栽培 7个Q∏ LS SSR及DArT Q∏定位,比较遗传[44] 种,RI 谷子 野生种x栽培10个 QTLs SNP,SSR及 RFLPS QTL定位,上位性效应,[16] Foxtail millet 环境互作效应 饭豆 野生种×栽培73个 QTLS SSR及AFLP Q∏定位,比较遗传[45] Rice bean 种,BC1F1 188(F2)/190野生种x栽培153个QTLs QL定位,比较遗传[46 Yardlong bean (BC FI) 种,F2及BC1F1 分析 花生 142(87BCJF1and野生种x栽培95个 QTLs SSR Q∏L定位,比较遗传[47] Peanu 55BC2F2) 种,44BC2F1 分析 野生种x栽培61个 QTLs Illumina Golden Gate,Q∏定位,比较遗传[48] Safflower 种,F SNP 分析1358 植 物 遗 传 资 源 学 报 20 卷 作物 Crops 种质（群体）数量 Amount of accessions（families） 种质（群体）类型 Type of accessions （families） 驯化区段或 QTLs Number of QTLs 鉴定手段 Methods 分析内容 Analysis performed 参考文献 Reference 桃 Peach 480 野生种（52），地 方品种（213），育 成品种（215） 142 个 二代基因组重测序， 测序深度：野生种（平 均 6.4×），地 方 品 种 （平均 6.4×），育成品 种（平均 6.4×） SNP 鉴定，主成分分析， 进化树，FST，遗传多样 性（π），连锁不平衡，全 基因组关联分析，选择 性鉴定（πw /πc），CLR ［33］ 梨 Pear 113 野生种（57），地 方品种（56） 1082 个 （候选基因） 二代基因组重测序， 测序深度：野生种（平 均 11×），地 方 品 种 （平均 11×） SNP 鉴 定，主 成 分 分 析，进 化 树，FST，遗 传 多样性（π），连锁不平 衡，基因漂流，ROD，群 体结构，IBD ［39］ 柑橘 Orange 104 野生种（13）， 地方品种（91） 1600 个 二代基因组重测序， 测序深度：野生种（平 均 35×），地 方 品 种 （平均 35×） 主成分分析，进化树， FST，遗传多样性（π）， SNP 鉴定，XP-CLR，基 因漂流 ［40］ 棉花 Cotton 143 野生种（5），地方 品种（43），育成 品种（95） 109 个 二代基因组重测序， 测序深度：野生种（平 均 5.17×），地方品种 （平 均 5.17×），育 成 品种（平均 5.17×） SNP 鉴定，主成分分析， 进化树，群体结构，FST， 遗传多样性（π），选择 性鉴定（πrace /πcultivar） ［41］ 大麦 Barley 433 野生种（344），地 方品种（89） 137 个 Illumina enrichment resequencing SNP 鉴 定，主 成 分 分 析，群体结构，CLR，遗 传多样性（π），选择性 鉴定（πw /πc） ［42］ 小麦 Wheat 701 野生种（188）， 地方品种（84）， 育成品种（429） 7984 个 SNP 芯片 SNP 鉴定，FST，lnRH，进 化树 ［43］ 152 野生种 × 栽培 种，RILs 27 个 QTLs SSR 及 DArT QTL 定 位，比 较 遗 传 分析 ［44］ 谷子 Foxtail millet 182 野生种 × 栽培 种，RILs 10 个 QTLs SNP，SSR 及 RFLPs QTL 定位，上位性效应， 环境互作效应 ［16］ 饭豆 Rice bean 198 野生种 × 栽培 种，BC1F1 73 个 QTLs SSR 及 AFLP QTL 定 位，比 较 遗 传 分析 ［45］ 长豇豆 Yardlong bean 188（F2）/190 （BC1F1） 野生种 × 栽培 种，F2 及 BC1F1 153 个 QTLs SSR QTL 定 位，比 较 遗 传 分析 ［46］ 花生 Peanut 142（87 BC3F1 and 55 BC2F2） 野生种 × 栽培 种，44 BC2F1 后代 95 个 QTLs SSR QTL 定 位，比 较 遗 传 分析 ［47］ 红花 Safflower 276 野生种 × 栽培 种，F2 61 个 QTLs Illumina GoldenGate， SNP QTL 定 位，比 较 遗 传 分析 ［48］ 表 2（续）