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既能提供足够的统计学信息,又使于测序。 程 原核生物的16 SrRNA(1.5kb),真核的18 SrRNA(2.9kb)是最合适的进化计时器 分米单元和金名 微生物的分类单元: 域(domain、门(phylum) ,刚(clas、目(order)、小family) 属(genus)、小种(species). 种:sp,l6 S rRNA序列相似性大于97%,DNA-DNA杂交率在70%或以上。△Tm<=5℃ 菌株:strain,由一个细胞或孢子在培养基上繁殖而来的后代。 命名法 二名法:属名+种名+(首次定名人)+现在定名人姓氏+现名定名 年份 三、原核生物的鉴定和分类方法 传统分类、分子分类、多相分类。常规法、数值法。 传统分类:以形态特征、培养特征、生理及生化特征等表型性状为依据的分类方法。 分子分类:主要采用核酸分子的信息讲行分类。G+Cm0l%、DNA-DNA杂交、名相分 教 四、原核生物分类系线 学 《伯杰氏细菌鉴定学手册》、《伯杰氏系统细菌学手册》。 提问设计: 过 L.原核生物的16 SrRNA(1.5kb),真核的18 S TRNA(2.9kb)为什么是最合适的进化 时器?让学生加对作为进化计时器分子标准的理解。 程 2各种分类依据中有没有一个金标准? 为什么?让学生明白,无论哪一种分类依据都 不是万能的,都有其不足之处。 讲课要点: 原核生物的16 S rRNA(1.5kb),真核的18 S rRNA是最合适的进化计时器,根据各种 生物的上术分子的序列,可物建生物的系统发有树。生物通用树就是W。邓依据该标准津 立起来的生物的系统发育树。微生物分类的方法 传统方法和分子方法。传统方法包括常规 方法和数值分类,分子分类方法主要依据核酸分子的信息进行分类 三、总结与巩固 1.小 本节主要阐述生物的系统发育与进化计时器、微生物分类单元、原核生物 的分类方法、原核生物分类系统 学习本章在理论上要了解什么是进化计时器 利用进化计时器建立起的生物系统发育关系、原核生物的分类单元、原核生物 的分类方法、原核生物分类系统。在实践上在原核生物分类鉴定中能加以应用。 2.考核知识点 2.1生物的系统发育与进化计时器 2.2微生物分类单元 23原核生物的分类方法 2.4原核生物分类系统 3.考核要求 3.1生物的系统发育与进化计时器 理解和记忆:进化计时器及作为进化计时器的标准、16 SrRNA的特点、生物通用树 3.2微生物分类单元 理解和记忆:微生物分类的各类分类等级及细菌的“种”和定义 3.3原核生物的分类方法 17 程 教 学 过 程 既能提供足够的统计学信息,又便于测序。 原核生物的 16S rRNA(1.5kb),真核的 18S rRNA (2.9kb)是最合适的进化计时器。 二、分类单元和命名 微生物的分类单元: 域(domain)、门(phylum) 、刚(class)、目(order)、科(family)、 属(genus)、种(species)。 种:sp.,16S rRNA 序列相似性大于 97%,DNA-DNA 杂交率在 70%或以上。ΔTm<=5℃。 菌株:strain,由一个细胞或孢子在培养基上繁殖而来的后代。 命名法:二名法:属名 + 种名+( 首次定名人)+现在定名人姓氏+ 现名定名 年份 三、原核生物的鉴定和分类方法 传统分类、分子分类、多相分类。常规法、数值法。 传统分类:以形态特征、培养特征、生理及生化特征等表型性状为依据的分类方法。 分子分类:主要采用核酸分子的信息进行分类。G+Cmol%、DNA-DNA 杂交、多相分 类。 四、原核生物分类系统 《伯杰氏细菌鉴定学手册》、《伯杰氏系统细菌学手册》。 提问设计: 1.原核生物的 16S rRNA(1.5kb),真核的 18S rRNA (2.9kb)为什么是最合适的进化计 时器?让学生加对作为进化计时器分子标准的理解。 2.各种分类依据中有没有一个金标准?为什么?让学生明白,无论哪一种分类依据都 不是万能的,都有其不足之处。 讲课要点: 原核生物的 16S rRNA(1.5kb),真核的 18S rRNA 是最合适的进化计时器,根据各种 生物的上述分子的序列,可构建生物的系统发育树。生物通用树就是 Woese 依据该标准建 立起来的生物的系统发育树。微生物分类的方法传统方法和分子方法。传统方法包括常规 方法和数值分类,分子分类方法主要依据核酸分子的信息进行分类。 三、总结与巩固 1.小结 本节主要阐述生物的系统发育与进化计时器、微生物分类单元、原核生物 的分类方法、原核生物分类系统。学习本章在理论上要了解什么是进化计时器、 利用进化计时器建立起的生物系统发育关系、原核生物的分类单元、原核生物 的分类方法、原核生物分类系统。在实践上在原核生物分类鉴定中能加以应用。 2.考核知识点 2.1 生物的系统发育与进化计时器 2.2 微生物分类单元 2.3 原核生物的分类方法 2.4 原核生物分类系统 3.考核要求 3.1 生物的系统发育与进化计时器 理解和记忆:进化计时器及作为进化计时器的标准、16S rRNA 的特点、生物通用树 3.2 微生物分类单元 理解和记忆:微生物分类的各类分类等级及细菌的“种”和定义 3.3 原核生物的分类方法
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