Human hemoglobin (a chain) VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHG SAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLS HCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR Human myoglobin GLSDGEWQLVLNVWGKVEADI PGHGQEVL IRLFKGHPETLEKFDKFKHLKS EDEMKASEDLKKHGATVLTALGGI LKKKGHHEAE I KPLAQSHATKHKI PVK YLEFISECI IQVLQSKHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDMASNYKELGFQG Figure 困6.4人血红蛋白-链和人肌球蛋白进行序列比对。0-链血红蛋白有141个氨基酸，肌红 蛋白有153个氨基酸。 如何比对两个序列？最简单的方法是将一个蛋白质的氨基酸序列与另一个蛋白质的氨 基酸序列进行所有可能的比对，记录各种比对所获得的一致残基的数目。这种比对不难，只 需每次将一个序列沿着另一个序列滑行一位，计算匹配氨基酸残基的数量（图6.5）。 (A) Hemoglobin Hemoglobin T Myoglobin Myoglobin (B) GLSEGEWQLVLNWGKVEADI PGHGQEVL I RLFKGHPETL YFPHFDLSHGSAQVGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSA FPTTKTYFPHFDLSHGSAOVGHGKKMADALTNAVAHVDDM LSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHA EAEIKPLAQSHATKHKIPVKYLEFISECI IQVLQSKHPGDF SLDKFL可SVSTVLTSKYR T PAVHASLDRFLASVSTVLTSKYR 22 matches 23 matches 15 10 Alignment Figure 6-5 Biochemistry,Sixth Edition 2007 W.H.Freeman and Company 图6.5人血红蛋白α-链和人肌球蛋白进行序列比对。(A)一条序列沿另一条序列滑行，进 行序列比对（每次滑行一个氨基酸位点），统计两条多肽链中氨基酸一致的位点数量。(B)匹 配数量最多的比对模式（上），将一致氨基酸位点数量（纵轴）与滑行位点（横轴）作图（下）。图 6.4 人血红蛋白链和人肌球蛋白进行序列比对。链血红蛋白有 141 个氨基酸，肌红 蛋白有 153 个氨基酸。 如何比对两个序列？最简单的方法是将一个蛋白质的氨基酸序列与另一个蛋白质的氨 基酸序列进行所有可能的比对，记录各种比对所获得的一致残基的数目。这种比对不难，只 需每次将一个序列沿着另一个序列滑行一位，计算匹配氨基酸残基的数量（图 6.5）。 图 6.5 人血红蛋白链和人肌球蛋白进行序列比对。（A）一条序列沿另一条序列滑行，进 行序列比对（每次滑行一个氨基酸位点），统计两条多肽链中氨基酸一致的位点数量。（B) 匹 配数量最多的比对模式（上），将一致氨基酸位点数量(纵轴）与滑行位点（横轴）作图（下）