The Whitehead intitute/ MIT Center for Genome research是两张基因组范围物理图 谱的最初来源。其中一张是STS含量图,内含指定为YAC的10000多个标记物,以及一张含 12000个左右标记物的放射性杂交图。 Whitehead所用的G4杂交板( Genebridge4 radiation hybrid panel)分辨率为~1Mbp,而以YAC为基础作的图分辨率大约为200kbp。这些图己 经和 Genethon基因图相结合,产生了一张合图,在平均150kb范围内有2000个STSs Whitehead图上大约有一半的标记物是表达序列,它们在人类转录物图上也会出现 WI( Whitehead institute)图可通过网络从 Whitehead center for Genome research 的主页上得到。沿着“人类物理图项目”( Human Physical Mapping Project)的链接就可 以得到感兴趣的图,这些图可通过几种方法浏览。选择一系列pop-up菜单可以产生所选染 色体的图,选择选项按钮可以综合放射性杂交图、STS含量图和基因图。与 Entrez一样, 这些图不是固定不变的。点击一个STS或是重叠群,会弹出关于该图素详细信息的页面。图 形式图谱在网址上可按GIF或 Macintosh最初模式(PICT)下载。 Whitehead网址上还提供 了对图谱数据库进行査询的搜索页。这些搜索数据的链接可按名称、 GenBank通道号、STS 型号、染色体分配进行搜索。另外, Whitehead网页也可根据功能关键字搜索制图转录序列, 并提供与NCBI中的主转录物图的链接 Whitehead也为那些希望建立他们自己的STS的研究者提供服务,并将之放在一个或多 个图上,这些服务包括: 个在线的引物选择程序,引物3 将一个STS放在STS/YAC含量图上的服务 将一个STS放在放射性杂交图上的服务 Whitehead图远未完善,对合图进行监督性测试就能显示出在基因图、放射性杂交图和 STS/YAC图上的STSs位置间存在矛盾。这些矛盾表现在合图上仍存在交叉线。解释这些图 的一个关键点在于理解这些图在可靠性与分辨率水平不一。基因图骨架在数十兆时能可靠地 连接标记物,但在低于约2兆时就无法准确解决两个STS的顺序问题了。放射性杂交图能够 测知约10Mb的连接,有效分辨率达~1Mb(更小的间隔也能排序,但是不可靠性逐步增加) STS/YAC图可以测知两个相互间隔1Mb的STS的连接,估计分辨力达100~300kb。理解图谱 时头脑中应有这些尺度上的差异。一般在IMb的范围以下,STS/YAC图是说明顺序的图谱中 最可靠的一种。 在STS含量图中,由于STS和YAC的不等分布,可靠性也会有地域差异。在YAC密集的 区域(每一个STS有5个或更多的YAC),在排序信息的重要性上,图谱结果是相对更可靠 的。在低密度区,图谱结果中就会有几种同时可能替代的STS顺序,并会附上数据。假定的 错误的反面情况,如图12.8中,表示为图中的空白框。这一点也会严重降低图谱的准确性 最后,因为在所有YAC库中都存在嵌合现象的问题,双键(例如,一对STS同时与2个或更 多YAC连接)比单键(STS只由1个YAC连接)更能可靠说明相邻关系。尽管只有在基因图 或放射性杂交图中存在支持性数据时,图上才能构建单键信息,但单由两个STS相连形成的 连接仍保留怀疑。这些元素在任何制图区域被详细检查的时候都应考虑在内The Whitehead Intitute/MIT Center for Genome Research 是两张基因组范围物理图 谱的最初来源。其中一张是 STS 含量图，内含指定为 YAC 的 10000 多个标记物，以及一张含 12000 个左右标记物的放射性杂交图。Whitehead 所用的 G4 杂交板（Genebridge 4 radiation hybrid panel）分辨率为～1Mbp，而以 YAC 为基础作的图分辨率大约为 200kbp。这些图已 经和 Genethon 基因图相结合，产生了一张合图，在平均 150kb 范围内有 20000 个 STSs。 Whitehead 图上大约有一半的标记物是表达序列，它们在人类转录物图上也会出现。 WI（Whitehead Institute）图可通过网络从 Whitehead Center for Genome Research 的主页上得到。沿着“人类物理图项目”（Human Physical Mapping Project）的链接就可 以得到感兴趣的图，这些图可通过几种方法浏览。选择一系列 pop-up 菜单可以产生所选染 色体的图，选择选项按钮可以综合放射性杂交图、STS 含量图和基因图。与 Entrez 一样， 这些图不是固定不变的。点击一个 STS 或是重叠群，会弹出关于该图素详细信息的页面。图 形式图谱在网址上可按 GIF 或 Macintosh 最初模式（PICT）下载。Whitehead 网址上还提供 了对图谱数据库进行查询的搜索页。这些搜索数据的链接可按名称、GenBank 通道号、STS 型号、染色体分配进行搜索。另外，Whitehead 网页也可根据功能关键字搜索制图转录序列， 并提供与 NCBI 中的主转录物图的链接。 Whitehead 也为那些希望建立他们自己的 STS 的研究者提供服务，并将之放在一个或多 个图上，这些服务包括： 一个在线的引物选择程序，引物 3 将一个 STS 放在 STS/YAC 含量图上的服务 将一个 STS 放在放射性杂交图上的服务 Whitehead 图远未完善，对合图进行监督性测试就能显示出在基因图、放射性杂交图和 STS/YAC 图上的 STSs 位置间存在矛盾。这些矛盾表现在合图上仍存在交叉线。解释这些图 的一个关键点在于理解这些图在可靠性与分辨率水平不一。基因图骨架在数十兆时能可靠地 连接标记物，但在低于约 2 兆时就无法准确解决两个 STS 的顺序问题了。放射性杂交图能够 测知约 10Mb 的连接，有效分辨率达～1Mb（更小的间隔也能排序，但是不可靠性逐步增加）。 STS/YAC 图可以测知两个相互间隔 1Mb 的 STS 的连接，估计分辨力达 100～300kb。理解图谱 时头脑中应有这些尺度上的差异。一般在 1Mb 的范围以下，STS/YAC 图是说明顺序的图谱中 最可靠的一种。 在 STS 含量图中，由于 STS 和 YAC 的不等分布，可靠性也会有地域差异。在 YAC 密集的 区域（每一个 STS 有 5 个或更多的 YAC），在排序信息的重要性上，图谱结果是相对更可靠 的。在低密度区，图谱结果中就会有几种同时可能替代的 STS 顺序，并会附上数据。假定的 错误的反面情况，如图 12.8 中，表示为图中的空白框。这一点也会严重降低图谱的准确性。 最后，因为在所有 YAC 库中都存在嵌合现象的问题，双键（例如，一对 STS 同时与 2 个或更 多 YAC 连接）比单键（STS 只由 1 个 YAC 连接）更能可靠说明相邻关系。尽管只有在基因图 或放射性杂交图中存在支持性数据时，图上才能构建单键信息，但单由两个 STS 相连形成的 连接仍保留怀疑。这些元素在任何制图区域被详细检查的时候都应考虑在内