当设置完成时,按下“提交”键。当数据已被转交或正在制图时,你会得到一个证明,在 小时内结果将会通过 Email回执给你。 对于大量的筛选数据,如果用剪切和粘贴来向服务器提交这些文件就不太方便了。这时 可以将数据以纯文本形式存在用户盘上,然后用RH制图页中的浏览键来定义并提交此文件 给服务器,同样, Email地址也要手工输入 对于~98%的提交的标记物, Whitehead放射性杂交图制图服务器都会找到特定的位 置。如果安置成功,软件将会给一回执,包括该标记物的染色体分布和在染色体连接群中的 位置、对标记物的表格式说明、和在 Whitehead放射性杂交图上两侧标记物的存在时其数据 情况。按要求将会得到一张 Macintosh图或GIF格式图。这些图由 Whitehead框架图组成, 所提交STS的位置以红色标明。 如果发现标记物连接的染色体多于一个或是根本就没有连接,制图过程也可能失败。在 前一种情况中,可以重新提交并设置高优势对数值,这样服务器将会认为其连接一个染色体, 在后一种情况中,你可以试着利用放射性杂交图页上的一个pop-up菜单将限制性降低。如 果一个标记物确实连向多个染色体,那么有可能用STS探测出重复序列 Stanford University放射性杂交图 Stanford Human Genome Center已经用G3制图板发展了一张基因组放射性杂交图。由 于比G4板所用放射量更高,G3板的分辨率更高,但是代价是在探测长距离连接时限制很大 Stanford图一般在平均375kb的范围内存在~8000个STS,这些标记物中,3700个左右是 表达序列,存在于NCBI转录物图中。同以往一样,在基因组很多部分中, Stanford图中的 表达序列比“全包容”NCBI图中的准确性更高 Stanford提供一个放射性杂交图制图服务器。如同 Whitehead服务,这个服务器允许 对从 Research genetics和其它业主处得到的G3板进行STS扫描。输入数据,服务器将会 尝试将STS与 Stanford图相连,并用 Email返回结果。因为G3板不能探测长距离连接,在 无其它图谱信息时, Stanford服务器只能将75%的STS定位在一条染色体上。但是如果要 在可选区域内提供标记物的染色体分布。服务器就能够在一个低优势对数连接值时进行分 析,并可对90%的情况作出分布图谱 当使用PCR时,STS应对8363板DMA扫描。为得到最好的结果,可使用 Stanford的RH Protocol主页给出的PCR协议,每次分析结果都应该复制,并且复制品间有分析差异就应 该重复或标为未知 Stanford服务器返回的制图结果由一系列相应的标记物分布组成。对于每一个STS,服 务器都会报告离其最近的基因标记物、染色体、和标记物到STS的距离,以 centiray(cR) 为单位。尽管对于制图结果并不提供图形显示,图谱信息还是可以用来与以上讨论的浏览图 形结合来说明所提交STS相对于 Stanford图上其它STS的位置。 要提交这一数据,连接 Stanford的主页,并按下RH服务器的链接,然后是 RH Server Web submission。输λ Email地址和提交号的区域已被说明。 Email地址对于保证收到制图 结果是很重要的。提交号是一个可选择栏,它会同结果一起回执给用户,并且用于帮助工作当设置完成时，按下“提交”键。当数据已被转交或正在制图时，你会得到一个证明，在一 小时内结果将会通过 Email 回执给你。 对于大量的筛选数据，如果用剪切和粘贴来向服务器提交这些文件就不太方便了。这时 可以将数据以纯文本形式存在用户盘上，然后用 RH 制图页中的浏览键来定义并提交此文件 给服务器，同样，Email 地址也要手工输入。 对于～98％的提交的标记物，Whitehead 放射性杂交图制图服务器都会找到特定的位 置。如果安置成功，软件将会给一回执，包括该标记物的染色体分布和在染色体连接群中的 位置、对标记物的表格式说明、和在 Whitehead 放射性杂交图上两侧标记物的存在时其数据 情况。按要求将会得到一张 Macintosh 图或 GIF 格式图。这些图由 Whitehead 框架图组成， 所提交 STS 的位置以红色标明。 如果发现标记物连接的染色体多于一个或是根本就没有连接，制图过程也可能失败。在 前一种情况中，可以重新提交并设置高优势对数值，这样服务器将会认为其连接一个染色体， 在后一种情况中，你可以试着利用放射性杂交图页上的一个 pop-up 菜单将限制性降低。如 果一个标记物确实连向多个染色体，那么有可能用 STS 探测出重复序列。 Stanford University 放射性杂交图 Stanford Human Genome Center 已经用 G3 制图板发展了一张基因组放射性杂交图。由 于比 G4 板所用放射量更高，G3 板的分辨率更高，但是代价是在探测长距离连接时限制很大。 Stanford 图一般在平均 375kb 的范围内存在～8000 个 STS，这些标记物中，3700 个左右是 表达序列，存在于 NCBI 转录物图中。同以往一样，在基因组很多部分中，Stanford 图中的 表达序列比“全包容”NCBI 图中的准确性更高。 Stanford 提供一个放射性杂交图制图服务器。如同 Whitehead 服务，这个服务器允许 对从 Research Genetics 和其它业主处得到的 G3 板进行 STS 扫描。输入数据，服务器将会 尝试将 STS 与 Stanford 图相连，并用 Email 返回结果。因为 G3 板不能探测长距离连接，在 无其它图谱信息时，Stanford 服务器只能将 75％的 STS 定位在一条染色体上。但是如果要 在可选区域内提供标记物的染色体分布。服务器就能够在一个低优势对数连接值时进行分 析，并可对 90％的情况作出分布图谱。 当使用 PCR 时，STS 应对 83G3 板 DNA 扫描。为得到最好的结果，可使用 Stanford 的 RH Protocol 主页给出的 PCR 协议，每次分析结果都应该复制，并且复制品间有分析差异就应 该重复或标为未知。 Stanford 服务器返回的制图结果由一系列相应的标记物分布组成。对于每一个 STS，服 务器都会报告离其最近的基因标记物、染色体、和标记物到 STS 的距离，以 centiray（cR） 为单位。尽管对于制图结果并不提供图形显示，图谱信息还是可以用来与以上讨论的浏览图 形结合来说明所提交 STS 相对于 Stanford 图上其它 STS 的位置。 要提交这一数据，连接 Stanford 的主页，并按下 RH 服务器的链接，然后是 RH Server Web Submission。输入 Email 地址和提交号的区域已被说明。Email 地址对于保证收到制图 结果是很重要的。提交号是一个可选择栏，它会同结果一起回执给用户，并且用于帮助工作