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78 江苏农业研究第2卷 P(1M。=1)=21(1-n)·[1-n)2+]=2×0.1×0.9×(0.8+0.2)=0.1224 P(blM=1)=2(1-n)·r:(1-n=2×0.1×(1-0.1)×0.2×(1-0.2)=0.0288 由于P(M。=1)=1,故M:=1的概率可简化为: P(M,-11)=P(M=1)+P(M=1) ∑P(b,iM。=1) M,=0的概率为: PM,=01)=a094±4288=0.3855 M2=一1的概率为: 0.0324+0.0288 PM:=-1)-a.i84++0.0288=0.0618. 如果遗传信息不完全座位连续,类似上述的计算亦需继续,直至达到完全信息座位(这时该座位某 基因型的概率为1,任何其他座位的基因型都不可能影响其概率)或染色体末端座位为止。所以当不完 全信息座位成串出现时,恢复其遗传信息的工作量将是非常艰巨的(如上例,假设M,一M也是缺失 记,就要计算6×3-39366种慨率,并涉及10个不同的+),即使高效率的计算机也难以胜任。文献 「7门报道的是此计算过程的一种较简捷算法 以往-些软件对显性标记常以P(1)=1/3,P(0)-2/3,或P(0)=2/3,P(一1)=1/3处理:对缺失 标记则以P(1)=1/4,P(0)=1/2,P(-1)=1/4处理或甚至别除该个体(不参加分析).这样,运算虽然 简化,但肯定丧失部分有用信息。 参考文献: [1]Ber y DA. tang DK.Bayesi]nd Ed.New Dekker.INC,.16 DK, Gh 5 K+M ick B K.Generali )New York:Marce 2000. 44 [3] mch M.W h5 1998.1-980 Weir BS .1996.1-44 M H.Pro ty and到8 [M].Calf ing Co..INC,1975.49-76 [6 妻长竖,莫惠标 量-数量性状的速传分析门作物学报,1995,21(6 641-648 [7]姜长鉴,莫惠株DNA分千标记倍息不完全的统计处理01.中国科学(C辑),198,28(6):529-535, [8]Kinghom B P.Kennedy B W.Smith C.A method for sreenin enes of major effect Genetics,993.134 351-360. 万方数据78 江苏农业研究 第z2卷 P(b5IM。一1)一2r1(1--r1)·[(1--r2)2+一]=2×0.1×0.9×(O.82+O.22)=0.122 4, P(b6lM。一1)=2rI(1--r1)·r2(1一r2);2×0.1×(1一O.1)×0.2×(1--0.2)=O.028 8。 由于P(M。一1)一1,故M。=1的概率可简化为: P(M。一1|B)一墅世霉』生旦虹刿 ∑P(以IM。=1) J-1 一高0 51型8 4岩罴0 022 8=o.552 7; . +…+. ……1 M:=0的概率为: P(M:一01B)=高署等揣=0.3855; M:一一1的概率为: P(M:=一liB)一正{;器芝÷{__睾‰=o.os·s。 如果遗传信息不完全座位连续,类似上述的计算亦需继续,直至达到完全信息座位(这时该座位某 基因型的概率为1,任何其他座位的基因型都不可能影响其概率)或染色体末端座位为止。所以当不完 全信息座位成串出现时,恢复其遗传信息的工作量将是非常艰巨的(如上例,假设M,~",。也是缺失标 记,就要计算6X3。=39 366种概率,并涉及10个不同的r),即使高效率的计算机也难以胜任“1。文献 [7]报道的是此计算过程的一种较简捷算法。 以往一些软件对显性标记常以P(1)一1/3,P(0)=2/3,或P(0)=2/3,P(一1)=1/3处理;对缺失 标记则以P(1)一1/4,P(o)一1/2,P(一1)一1/4处理或甚至剔除该个体(不参加分析)。这样,运算虽然 简化,但肯定丧失部分有用信息。 参考文献 Berry D A.Stangl D K.Bayesian biostatistics[M]2nd Ed.New York:Mabel Dekker·INC,2000.1—696. Dey D K,Ghosh S K,Mallick B K.Genemlized linear models:A bayesian perspective[M].New York:Mabel Dekker.INC,2000.1—440. LynchM,WalshB.Genetics and analysis ofquantitativetraits[M].Massachusetts:SinauerAssociates,INC,Pub— Ushers.1998.1—980. 。 Weir B S.Genetic data analysis 1[M].Massachusetts:Sinauer Assoicates,INC,Pubfishers,1996.1--445. DeGtootMH.Probability and slatistics[M].California:Addison—wesley PublishingCo.INC,1975.49—76. 姜长鉴.其惠栋.质量一数量性状的遗传分析IV[J].作物学报,1995,21(6):641—648. 姜长鉴.莫寒拣.DNA分子标记信息不完全的统计处理口].中国科学(c辑),1998,28(6):529--535. Kinghom B P。Kennedy B W,Smith C.A method for screening genes of major effect E1].Genetics,1993,134I 35l一360. m嗍 啪 啪踟嘲Ⅲ嘲 万方数据
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