第1期 莫惠练：贝叶斯瓶率及其在数量遗传领城的一些应用 77 PA1)-a51x848篇gX75-Q98, PM1a)-a58x9&源gX07万-Q0s2, PAB)-a62x02器18票6X07西=a02. 0.7198×0.75 P(A1B)=0.0062×0.25+0.7198×0.75-0.9971. 上述结果表明：在B,组选得个体的株高基因型几平都是gg(达99.48%)，而在B,组个体的株高 基因型则几乎都是Gg或GG(达99.71%).所以此例的株高虽然是连续的相互重的混合分布（参见 文献[6]图1)，但对选择gg或Gg十GG基因型并无多大障碍，因为分布的重选区主要在T0~90cm内 (其间gg占39.9%，Gg+GG占61.1%).这种情况在具有主基因的数量性状上有一定普遍性。 3.2由标记表现型推断基因型 在DNA分子标记分析中 一个个体的任 表2在M,为1,0，一1时M,基因型的亲件鞭车 一标记座位的基因型都只有3种：即2份 Table 2 Conditional probabilityof M. DNA为P,纯合，P,P,杂合以及P纯合，可用 genotypes glven M.=1.0 and-1 代码1,0，一1表示。但表现型（电泳谱带的有 M Mo=1 Mo-0 Ma=-1 无)却可能是3种（共显性标记），2种（显性标 r(1-r 记)或1种（缺失标记），后两者为遗传信息不完 2r1-r 全标记，可用它们最邻近的信息完全标记和贝 叶斯框率椎断其所属基因型.设M。和M,为相邻标记，其间重组率为r,则在M。取1,0，一1时，M,为 10 -1的概率如表2.表2中的r函数均为M,基因型的条件概率.例如在M,=1下，M,亦为1的 摄率乃M。和M1间2条DNA均未发生交换的概率，故P(M:=1|M。=1)=(1一r):M:为0的概率乃 有2条DNA一条发生交换另一条未发生交换的概率，故P(M,=0lM。=1)=2r(1一r):…等，这些 领率是推晰信息不完全标记基因型的莲础。 现设某染色体上有顺序标记MM,和M,M,=1(共显性标记)，M,可能为1或0（显性标记） M:可能为1,0或-1（缺失标记）：相应重组案依次为=0.1和=0.2。求M。=1下，M,为1或0的 领率？M2为1,0或一1的概率？ 对于M.观事件是=[M。=1,M,=(1,0)].由于P(M,=1M,=1)=(1-=(1-0.1)2= 0.81,P(M1=01M。=1)-2(1-)=2×0.1×(1-0.1)=0.18和P(M。=1)=1,故 -0.81x+018xD=0.8182 0.18×1 PM,=01B)-0.81X0.18xT=0.1818. 即M1基因型为1和0的概串分别为0.8182和0.1818。 对于M2,观察事件B=[M=1,M1=(1,0),M2=(1,0,-1)门.故必须考患M1一1时M:为1,0或 -1以及M,=0时M,为1.0或-1的6种组合，可简记为6=(1,1)，=(1,0)，6=(1，-1)，,= (0,1),=(0,0)和=(0，-1)。在M。-1下它们的条件概率为 P(6lM。=1=(1-r)2…(1-r)2=(1-0.1)2×(1-0.2)2=0.5184, P(6M。=1)=(1-r22(1-)=(1-0.1)2×2×0.2×(1-0.2)=0.2592 P(6,M=1)=(1-)·r=(1-0.1)X0.2=0.0324 P(hlM=1)=2(1-r)·n(1-n). =2×0.1×(1-0.1)×0.2×(1-0.2)=0.0288. 万方数据 第1期 莫惠栋：贝叶斯概率及其在数量遗传领域的一些应用 P(A㈣I B=丽砸蒜器竿舞岳而而 P(A舢：)一丽丽黑器竿篇南而丽 P(A㈣IE一丽丽蒜焉竿描‰而丽 0．994 8， 0．005 2； =0．002 9． P(A：IBD一丽丽书等卑等等厕_o．997 1。 上述结果表明：在B：组选得个体的株高基因型几乎都是gg(达99．48％)，而在B．组个体的株高 基因型则几乎都是G奢或GG(达99．71％)。所以此例的株高虽然是连续的相互重迭的混合分布(参见 文献[6]图1)，但对选择gg或G奢+GG基因型并无多大障碍，因为分布的重迭区主要在70～90 cm内 (其间gg占39．9％，G奢+6G占61．1％)。这种情况在具有主基因的数量性状上有一定普遍性。 3．2由标记表现型推断基因型 在DNA分子标记分析中，一个个体的任 一标记座位的基因型都只有3种：即2份 DNA为P。纯合、P。P：杂合以及P。纯合，可用 代码1．0，一l表示。但表现型(电泳谱带的有 无)却可能是3种(共显性标记)、2种(显性标 记)或1种(缺失标记)。后两者为遗传信息不完 全标记，可用它们最邻近的信息完全标记和贝 表2在^f．为1。o，一1时埘．基因型的条件概率 Table 2 Conditional probability of MI genotypes given肌一1，0 and一1 叶斯概率推断其所属基因型。设M。和"。为相邻标记，其间重组率为r，则在肘。取1，0，一1时，肘。为 1．0，一1的概率如表2”1。表2中的r函数均为肘．基因型的条件概率。例如在M。=1下，M。亦为1的 慨率乃肘。和M。间2条DNA均未发生交换的概率，故P(M，一1IM。一1)一(1--r)2；M。为0的概率乃 有2条DNA一条发生交换另一条未发生交换的概率，故P(M．一0lM。=1)一2r(1一r)；……等。这些 概率是推断信息不完全标记基因型的基础。 现设某染色体上有顺序标记肘。、M。和肘：，M。一1(共显性标记)，Mt可能为1或0(显性标记)， 肘：可能为1，0或一1(缺失标记)；相应重组率依次为n一0．1和r。一0．2。求Mo一1下，M。为1或0的 概率7．!lfz为1，0或一1的概率? 对于Ⅳ。，观察事件是B；[M。一l，M。一(1，o)]。由于P(JIlf，=1IM。=1)=(1一r。)2=(1—0．1)2— 0．81，P(Ml一0lM。一1)一2r1(1一r1)一2X0．1×(1—0．1)一0．18和P(M。一1)一1，故 刚。刮肛而i瓜器锰砦岩胖舄旨丽 0．81×1 2丽忑订可可了矿丙又可 一0．818 2， P(M。=o|B)=丽-蓟了昌弩晕i‰=0．181 8。 即M。基因型为1和0的概率分别为0．818 2和0．181 8。 对于肘：，观察事件B一[M。一1，M，一(1，o)，M。一(1，0．一1)]。故必须考虑M-一1时Mz为1，0或 一1以及M。一0时肘：为1．0或一1的6种组合，可简记为b，一(1，1)，bz=(1，o)，b，一(1，一1)，b4一 (O，1)，b；一(O，o)和b。一(O，一1)。在M。一1下它们的条件概率为： P(bl lMo一1)一(1mr．1)2·(1一r2)。一(1一o．1)2×(1一o．2)2=0．518 4， P(b2lM。一1)一(1一r。)2·2r：(1一r：)=(1—0．1)2×2×0．2×(1—0．2)一0．259 2， P(b，IM。=1)=(1一ri)2·一一(1—0．1)2×0．2 2—0．032 4， P(风IM。=1)一2r。(1一n)·n(1一n)， 一2×0．1×(】一0．1)X0．2×(】一0．2)=0．028 8， 万方数据