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在质粒提取过程中,由于机械力、酸碱度、试剂等的原因,可能使质粒DNA 链发生断裂。所以,质粒DNA琼脂塘凝胶电泳模式图分为:松弛线性的DNA 松弛开环的OC构型;超螺旋的SC构型。由于琼脂糖中加有嵌入型染料溴化乙 锭,因此,在紫外线照射下DNA电泳带成橘黄色。道中的 SC DNA走在最前沿, OC DNA则位于凝胶的最后边;道中的LDNA是经核酸内切限制酶切割质粒之 后产生的,它在凝胶中的位置介于 OC DNA和 SC DNA之间。以提取小量质粒 为例 )煮沸法 【原理】 煮沸法是根据 Holme和 Quigley(1985)的方法改进而成的。在基因工程 中,DNA分子的切割是由限制性内切酶来完成的。限制性内切酶能识别特定的 DNA序列,在一定的条件下切断双链DNA。限制性内切酶的作用效率是受多方 面因素影响的,如反应温度,缓冲体系,离子种类与浓度,DNA的纯度和甲基 化程度等。对DNA进行酶切时,首先要选择适合的缓冲液。对于单酶切,应选 用该酶的最适缓冲液;对于双酶切或三酶切,应选用一种能使所有酶都充分作用 的缓冲液。DNA的纯度对于酶切的效果的影响也很大,因为蛋白质、酚、氯仿、 SDS等杂质都会抑制限制性内切酶的活性 琼脂糖凝胶电泳是分离,鉴定和纯化DNA片段的常规方法。利用低浓度 的荧光嵌入染料溴化乙锭进行染色,可确定DNA在凝胶中的位置。如有必要, 还可以从凝胶中回收DNA条带,用于各种克隆操作。琼脂糖凝胶的分辨能力要 比聚丙烯酰胺凝胶低,但其分离范围较广。用各种浓度的琼脂糖凝胶可以分离长 度为200bp至近50kbp的DNA。长度100kb或更大的DNA,可以通过电场方向 呈周期性变化的脉冲电场凝胶电泳进行分离。 在基因工程的常规操作中,琼脂糖凝胶电泳应用最为广泛。它通常采用水平 电泳装置,在强度和方向恒定的电场下进行电泳。DNA分子在凝胶缓冲液( 般为碱性)中带负电荷,在电场中由负极向正极迁移。DNA分子迁移的速率受 分子大小,构象。电场强度和方向,碱基组成,温度和嵌入染料等因素的影响。 【材料】 1.器材微量移液器(2oμl、200ul、1000ul),台式髙速离心机,恒温振荡 摇床,髙压蒸汽消毒器(灭菌锅),涡旋振荡器,电泳仪,琼脂糖平板电泳装置 恒温水浴锅,1.5ml塑料离心管(又称 eppendorf管,离心管架。在质粒提取过程中,由于机械力、酸碱度、试剂等的原因,可能使质粒 DNA 链发生断裂。所以,质粒 DNA 琼脂塘凝胶电泳模式图分为:松弛线性的 DNA; 松弛开环的 OC 构型;超螺旋的 SC 构型。由于琼脂糖中加有嵌入型染料溴化乙 锭,因此,在紫外线照射下 DNA 电泳带成橘黄色。道中的 SC DNA 走在最前沿, OC DNA 则位于凝胶的最后边;道中的 L DNA 是经核酸内切限制酶切割质粒之 后产生的,它在凝胶中的位置介于 OC DNA 和 SC DNA 之间。以提取小量质粒 为例。 一)煮沸法 【原理】 煮沸法是根据 Holmex 和 Quigley(1985)的方法改进而成的。在基因工程 中,DNA 分子的切割是由限制性内切酶来完成的。限制性内切酶能识别特定的 DNA 序列,在一定的条件下切断双链 DNA。限制性内切酶的作用效率是受多方 面因素影响的,如反应温度,缓冲体系,离子种类与浓度,DNA 的纯度和甲基 化程度等。对 DNA 进行酶切时,首先要选择适合的缓冲液。对于单酶切,应选 用该酶的最适缓冲液;对于双酶切或三酶切,应选用一种能使所有酶都充分作用 的缓冲液。DNA 的纯度对于酶切的效果的影响也很大,因为蛋白质、酚、氯仿、 SDS 等杂质都会抑制限制性内切酶的活性。 琼脂糖凝胶电泳是分离,鉴定和纯化 DNA 片段的常规方法。利用低浓度 的荧光嵌入染料-溴化乙锭进行染色,可确定 DNA 在凝胶中的位置。如有必要, 还可以从凝胶中回收 DNA 条带,用于各种克隆操作。琼脂糖凝胶的分辨能力要 比聚丙烯酰胺凝胶低,但其分离范围较广。用各种浓度的琼脂糖凝胶可以分离长 度为 200bp 至近 50kbp 的 DNA。长度 100kb 或更大的 DNA,可以通过电场方向 呈周期性变化的脉冲电场凝胶电泳进行分离。 在基因工程的常规操作中,琼脂糖凝胶电泳应用最为广泛。它通常采用水平 电泳装置,在强度和方向恒定的电场下进行电泳。DNA 分子在凝胶缓冲液(一 般为碱性)中带负电荷,在电场中由负极向正极迁移。DNA 分子迁移的速率受 分子大小,构象。电场强度和方向,碱基组成,温度和嵌入染料等因素的影响。 【材料】 1. 器材 微量移液器(20μl、200μl、1000μl),台式高速离心机,恒温振荡 摇床,高压蒸汽消毒器(灭菌锅),涡旋振荡器,电泳仪,琼脂糖平板电泳装置, 恒温水浴锅,1.5ml 塑料离心管(又称 eppendorf 管),离心管架
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