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D E lleal vs Colonic content GF vs Colonized feces ABX vs SPF Colonic content 10 2 Log2 [Fo 图I鉴别(identification)粪便及肠腔内容物中的miRNA 注:D-F上侧为火山图,统计差异及差异显著性。横轴为L0g2 (X/X数量的倍数),纵轴为P值。图中小点表示某一种miRNA: 下侧为PCA分析,分析组成的相似性或差异性。 2.肠上皮细胞及表达Hopx阳性细胞是miRNA的两大主要来源 粪便中mRNA的来源先前未被报道过,因为有研究表明肠上皮 细胞(IECs)分泌外泌体(exosome),而作者发现miRNA存在于 外泌体中,他们就设计实验来验证miRNA是否源自ECs。Dicer酶 是在miRNA成熟过程中的必须酶,它参与miRNA的剪切。故作者 培育了IECs细胞无Dicer酶表达的小鼠(Dicer1△IEC),与IECs细 胞表达Dicer酶的小鼠(Dicer1fl/H)并比较两组小鼠粪便中的 miRNA的丰度,图2A中火山图表明IECs细胞无Dicer酶的小鼠, 其粪便中的miRNA减少了,所以可以得出IECs是miRNA的来源。 同样的方法,发现Hopx表达阳性细胞也是miRNA的来源(图 2B)。且在两种无Dicer酶的细胞中miRNA变化是不同的,故 Hopx+细胞与ECs负责产生不同的miRNA。同时作者又用另一种方 图 1 鉴别(identification)粪便及肠腔内容物中的 miRNA 注:D-F 上侧为火山图,统计差异及差异显著性。横轴为 Log2 (X/X 数量的倍数),纵轴为 P 值。图中小点表示某一种 miRNA; 下侧为 PCA 分析,分析组成的相似性或差异性。 2.肠上皮细胞及表达 Hopx 阳性细胞是 miRNA 的两大主要来源 粪便中 miRNA 的来源先前未被报道过,因为有研究表明肠上皮 细胞(IECs)分泌外泌体(exosome),而作者发现 miRNA 存在于 外泌体中,他们就设计实验来验证 miRNA 是否源自 IECs。Dicer 酶 是在 miRNA 成熟过程中的必须酶,它参与 miRNA 的剪切。故作者 培育了 IECs 细胞无 Dicer 酶表达的小鼠(Dicer1∆IEC),与 IECs 细 胞表达 Dicer 酶的小鼠(Dicer1fl/fl)并比较两组小鼠粪便中的 miRNA 的丰度,图 2A 中火山图表明 IECs 细胞无 Dicer 酶的小鼠, 其粪便中的 miRNA 减少了,所以可以得出 IECs 是 miRNA 的来源。 同样的方法,发现 Hopx 表达阳性细胞也是 miRNA 的来源(图 2B)。且在两种无 Dicer 酶的细胞中 miRNA 变化是不同的,故 Hopx+细胞与 IECs 负责产生不同的 miRNA。同时作者又用另一种方
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