3.肠上皮细胞产miRNA缺陷使（同类型）小鼠肠道菌群组成相异度 增大 为了明确mRNA是否影响肠道菌群，作者通过高通量测序肠道 菌群的16 S rRNA基因的V4区并进行生物信息学分析。通过比较肠 上皮细胞Dicer酶缺陷小鼠与Dicer酶表达小鼠，发现两组小鼠之间 菌群组成的几个菌门(Phyla)发生了改变，如厚壁菌门 (Firmicutes)、变形菌门(Proteobacterial)。在科(family)水平 上，缺陷小鼠拟杆菌科(Bacteroidaceae)、螺杆菌科 (Helicobacteraceae)增多，普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、紫单胞 菌科(Porphyromonadaceae)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)及疣微 菌科(Ruminococcaceae)减少。（图3A)PCoA分析显示，与正常 小鼠(WT)相比，缺陷小鼠组内小鼠之间肠道菌群差异较大（图 3B),同时图3C、3D中对所有菌科Unifrac分析也印证了上述现象。 (不加权Unifrac衡量系统发生相似性而加权Unifrac衡量丰度)。 进一步地，他们将上一步所有菌科限制到具体某一菌科，对野生型 小鼠(WT)中最多的3种菌科(Prevotellaceae Porphyromonadaceae、.Lachnospiraceae)进行距离分析(distance metric),图3E-3G显示缺陷小鼠与野生型小鼠之间存在明显，且 在Prevotellaceae、Porphyromonadaceae两个菌科上差异尤为明显。 然而，在Prevotellaceae方面却没有出现显著的beta多样性差异（补 充图2B-2D)，这表明缺陷小鼠间的beta多样性要不是因为物种组 成上的差异、要不是因为特定细菌丰度上的差异造就的，为了确定 是哪一种原因造成的，作者又利用基于Bray-Curtis算法计算整体 OTUs,对属(Genus)水平的beta多样性进行分析（图3H),但由 于缺陷小鼠之间beta多样性太高，并没有找到缺陷小鼠与野生型小 3.肠上皮细胞产 miRNA 缺陷使（同类型）小鼠肠道菌群组成相异度 增大 为了明确 miRNA 是否影响肠道菌群，作者通过高通量测序肠道 菌群的 16S rRNA 基因的 V4 区并进行生物信息学分析。通过比较肠 上皮细胞 Dicer 酶缺陷小鼠与 Dicer 酶表达小鼠，发现两组小鼠之间 菌群组成的几个菌门（Phyla）发生了改变，如厚壁菌门 （Firmicutes）、变形菌门（Proteobacterial）。在科（family）水平 上，缺陷小鼠拟杆菌科（Bacteroidaceae）、螺杆菌科 (Helicobacteraceae)增多，普雷沃氏菌科（Prevotellaceae）、紫单胞 菌科（Porphyromonadaceae）、毛螺菌科（Lachnospiraceae）及疣微 菌科（Ruminococcaceae）减少。（图 3A）PCoA 分析显示，与正常 小鼠（WT）相比，缺陷小鼠组内小鼠之间肠道菌群差异较大（图 3B），同时图 3C、3D 中对所有菌科 Unifrac 分析也印证了上述现象。 （不加权 Unifrac 衡量系统发生相似性而加权 Unifrac 衡量丰度）。 进一步地，他们将上一步所有菌科限制到具体某一菌科，对野生型 小鼠（WT）中最多的 3 种菌科（Prevotellaceae、 Porphyromonadaceae、Lachnospiraceae）进行距离分析（distance metric），图 3E-3G 显示缺陷小鼠与野生型小鼠之间存在明显，且 在 Prevotellaceae、Porphyromonadaceae 两个菌科上差异尤为明显。 然而，在 Prevotellaceae 方面却没有出现显著的 beta 多样性差异（补 充图 2B-2D），这表明缺陷小鼠间的 beta 多样性要不是因为物种组 成上的差异、要不是因为特定细菌丰度上的差异造就的，为了确定 是哪一种原因造成的，作者又利用基于 Bray-Curtis 算法计算整体 OTUs，对属（Genus）水平的 beta 多样性进行分析（图 3H），但由 于缺陷小鼠之间 beta 多样性太高，并没有找到缺陷小鼠与野生型小