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第9期 罗凤娟等:主基因多基因混合传数量性状的单性状选择模型 193 3.2多基因存在的检验 其中为环境协方差阵 如果主基因存在,可以将主基因的变异从总的 以上参数的最小二乘估计分别为: 表型亦异中分离出来,但是仍需确定主基因之外的 变异是来自多基因,环境、或是两者共同作用的结 果,即应对多基因的存在进行鉴定,假设混合分布 a=x.-x,月。=x.-x.,e=xm一元. 的成分分布个数为k,观则样本个数为n,则样本的 4,2协方差阵的分解 似然函数为: 对于每个观测值有重复的总离差阵W,可分解 L(p)=fp()=IIf () 为主基因型间的离差阵即主基因效应离差阵L,主 基因型内的离差阵即多基因效应离差阵L:和随机 构造零假设H。:=(即不存在多基因),其 误差的离差阵即环境离差阵L,3部分切, 中j=1,2,…,k,备择假设H。:d>d(即有多基因 生基因型间的离差阵为 存在),其中=1,2,…,k,且互不相等。通过计 65:…6 算两种假设下似然函数最大值L,和L,构造出似 然比统计量 L=nXrx λ=2[1ogL.一logL.Jy2(k-1) 式中:L.=i2元f,(z,d),L。=i2xf,(i =(i.-x) ,),进而对上述假设进行显著性检验。若A> 其中5=6=(G.-五-)(位.-云-). X(k一1),则拒绝原假设,说明在显著水平。下有多 j=1,2,…,k,≠j 基因存在,即除主基因之外的变异是多基因和环境 主基因型内的离差阵即多基因效应离差阵为: 共同作用的结果,香则,接受原假设,在显著水平。 「:52…ia1 下无多基因存在,即除主基因之外的变异只是环境 作用的结果。 4 主基因-多基因混合遗传的方差分 5,折… 6=G-王 4.1方差分析模型的建立 其中 设 是主基因型为工,的第j个观到个体的第 :次重复观测值,主基因型工的均值为:,第j个观 i,p=1,2,…,k,i≠p 测值的主效应为B,,x。的第1次重复观测的随机误 随机误差的离差阵即环境离差阵为: 差为ew,则方差分析的统计模型为, x=十风十e :… =1,2,…,k; j=1,2,",n …」 t=1,2,…,r, -22-八 主基因型五1,x2,…,工,的理论平均值分别为1性, …以其均值=产.把离差a,=4一(i=1, 其中5=片=之2(xn一云.)(红m一王w.) i,p=1,2,,k,i≠ 2,…,k)称为主基因型工的主效应,则有: u+a.+8,+em L,L:和L,的自由度分别为: i=1,2 =1,2 f=k-1,f=k(m-1),f=kn(r-1)1 在这个核型中间相豆维立,日均复从从0。 1.2 L,L,和L,的均方离差阵为: ),其中为主基因型间的主基因效应协方差阵, s,-点 8,相互独立,且均服从N,(0,E),其中为多基因 效应协方差阵:知为随机误差,且均服从N,(0,3), SP.-1 万方数据第9期 罗凤娟等:主基因一多基因混合遗传数量性状的单性状选择模型 193 3.2 多基因存在的检验 如果主基因存在,可以将主基因的变异从总的 表型变异中分离出来,但是仍需确定主基因之外的 变异是来自多基因、环境、或是两者共同作用的结 果,即应对多基因的存在进行鉴定。假设混合分布 的成分分布个数为忌,观测样本个数为起,则样本的 似然函数为: n n ^ L(9’亍旦户(zr;妒)=。I。I。,E;。,r,f,(置;胁,考)。 l=I l-工,=J 构造零假设H。:Z—O,,2(即不存在多基因),其 中歹一1,2,…,k;备择假设H。:Z>Z(即有多基因 存在),其中J=1,2,…,k,且Z互不相等。通过计 算丽种假设下似然函数最大值L。和L。,构造出似 然比统计量: 3,=2[109L。一logLq]~;【2(k--1)。 n ● ^ ^ 式中:L。=量蚤码^(zr;膨,Z),Lo=卫。njfj(zz; l=l,一l l=j,;l 弘i,Z),进而对上述假设进行显著性检验。若A> z:(是一1),则拒绝原假设,说明在显著水平口下有多 基因存在,即除主基因之外的变异是多基因和环境 共同作用的结果;否则,接受原假设,在显著水平口 下无多基因存在,即除主基因之外的变异只是环境 作用的结果。 4 主基因一多基因混合遗传的方差分 析 4.1 方差分析模型的建立 设z卿是主基因型为z;的第.『个观测个体的第 t次重复观测值,主基因型z;的均值为弘;,第J个观 测值的主效应为风,zo的第t次重复观测的随机误 差为e¨则方差分析的统计模型为m。131: z咖=lui+岛+e咖, f一1,2,…,k o J一1,2,…,咒‘ £=1,2,…,,.。 主基因型z,,z。,…,z。的理论平均值分别为卢。,户z, …,胁,其均值产=÷至∥i。把离差oi2肛-l_(i=1, 2,…,曼)称为主基因型霸的主效应,则有: zⅡt=弘+口{+岛+£班, i=1,2,…,志;i=1,2,…,以,£=1,2,…,,.。 在这个模型中,口。问相互独立,且均服从M(0, 五),其中蜀为主基因型间的主基因效应协方差阵; 岛相互独立,且均服从N。(o,嚣),其中嚣为多基因 效应协方差阵;e们为随机误差,且均服从Nt(0,嚣), 其中E为环境协方差阵。 以上参数的最小二乘估计分别为: ^ 一 ^ 一 ^ 一 产2z…’肛0 2z口.,产i 221..’ ^ 一 一 ^ 一 一 ^ 一 口f2zf..一z…,m 2z#.--X1..’e咖2z扣一z口.. 4.2协方差阵的分解 对于每个观测值有重复的总离差阵W,可分解 为主基因型间的离差阵即主基因效应离差阵Lf,主 基因型内的离差阵即多基因效应离差阵LI和随机 误差的离差阵即环境离差阵L。3部分[1 2。13]。 主基因型间的离差阵为: 其中 LI=挖×r× ‰ 器2 巧1 Z;2 改l Z:2 … ‰ … 改 i i … 纥 俄=(;-一五)2 其中{%=缘=(;。一;…)(三“一;。.)。 【i,J=1,2,…,七,i=fij 。 主基因型内的离差阵即多基因效应离差阵为: L。=,.× 巧l 巧2 巧l Z;2 Z:1 Z:l …Z{^ … 圾 : : ● ● … 段 ;=∑(毛.一瓦)2 J-l - r ;=£0=五(至#.一三i..)(三厨.一;^.)· ,p一1,2,…,k,i≠P 随机误差的离差阵即环境离差阵为: L。。 窍l 毋2 巧l % Z:l Z:2 … Z:。 … Z缸 : : ● ● … & 俺=∑∑(z咖一毛.)2 j叠It一1 ’ 其中{岛一住=壹耋(z班一;d.)(z螂一三何.)。 I’ ’ 』蕾It—l 。 。 一 一 【i,p=l,2,…,志,i=fip L、L和L。的自由度分别为: ,u=k--1,fk=k(n--、、),fh=kn(r--1、)I LI、L和L.的均方离差阵为t SP,=k皂l, 皿=丽‰, 万方数据
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