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百北农林科技大学学报(自然科学版) 第36卷 该数量性状是主基因多基因混合遗传,其表型 其中i=1,2,…,k,则各成分分布的均值以(i=1,2, 观测值呈现多峰性,表现为多个正态分布的混合,故 …,)的3区间为[一34,十3,]。因此,可将各 混合分布理论来估计参数进行主基因型的划分. 观测个体的均值,(i=1,2 2.2 3 混合分布参数的估计 3g](=1,2,,)分别划分到相应的k个区间中, 混合分布中所包含成分分布的个数k利用 进而将其对应的每组观测值x。(i=1,2,,:三 Akaike提出的最大摘信息准则(AIC))来估计,混 1,2,…,r)划分到对应的区间中,即相应的主基因型 合分布中其他参数,即各成分分布的均值出、权重 ,,中。若其不干某区间,将理利个 和方差(=1,2,…,k),采用EM算法 估计 体在此区对应的主基因型中的观测数据记为0, 因为样本的每组重复观测值间存在一定误差 这样就得到表2数据形式, 同一个体的不同重复观测值可能划分到不同的区 例如:若第1个样本到第p(p<m)个样本的均 间,即属于不同的主基因型,这与实际情况不符,故 值在[1一3,4十3,]区间,则判定这些样本属于 参数的估计用其均值x,工。, ,,即一组全样本 混合分布中的第1个成分分布,其主基因型为 信息进行计算 则其余样本的观 数在主基因型中记为0,可认 2,3 观测样本个体主基因型的划分 为这些样本在基因型为x,时观测不到:其他样本个 假设测量值xN(u,2),则由正态分布的极限 体主基因型的划分与此类似, 误差山可知,x落在区间Cu一3g,a十3c]外的概率非 对每个个体的重复观测值进行主基因型划分 常小,因此由此极限误差划分各观测个体所属的区 后,实际观测数据可整理为表2的形式。这种观测 间,即对应的主基因型类别,信息损失较小 设计可按重复中有重复的单因素完全随机设计进行 设混合分布的成分分布个数为k,即有k种主 离差阵分析。 基因型:各成分分布的均值和方差分别为出和, 表2等重复的单团来随机试验数细 Table 2 Data of the single element tandom experiment with eaual repetition number 样本个数S T T 生:n(-1,2,…,k=1,2,,=1,2,…,r)为第)个观测个体的第1次重复观测值的第:个主基因型值。 3主基因和多基因存在的检验 判定主基因的存在,如果k=1,则说明无主基因存 在:如果k≥2,则说明有主基因存在。但具体的主 3.1主基因存在的检验 基因座位点之间的相互作用,如加性效应,完全显 对于主基因多基因混合遗传的数量性状来说, 性、部分显性等还需进行进一步的似然比假设检验, 根据其表型混合分布中成分分布个数表的大小 可以 才能作出相应推新,本文不加以详述 万方数据 192 西北农林科技大学学报(自然科学版) 第36卷 该数量性状是主基因一多基因混合遗传,其表型 观测值呈现多峰性,表现为多个正态分布的混合,故 用混合分布理论来估计参数进行主基因型的划分。 2.2混合分布参数的估计 混合分布中所包含成分分布的个数忌利用 Akaike提出的最大熵信息准则(AIC)[4]来估计,混 合分布中其他参数,即各成分分布的均值胁、权重口f 和方差盯;(i=1,2'..·,愚),采用EM算法[8。0]估计。 因为样本的每组重复观测值间存在一定误差, 同一个体的不同重复观测值可能划分到不同的区 间。即属于不同的主基因型,这与实际情况不符,故 参数的估计用其均值;。,;:,…,;。,即一组全样本 信息进行计算。 2。3 观测样本个体主基因型的划分 假设测量值z~N(岸,口2),则由正态分布的极限 误差[111可知,z落在区间h一3a,P+3司外的概率非 常小,因此由此极限误差划分各观测个体所属的区 间,即对应的主基因型类别,信息损失较小。 设混合分布的成分分布个数为忌,即有惫种主 基因型;各成分分布的均值和方差分别为“;和口;, 其中i=1,2,…,k,则各成分分布的均值雎(i=1,2。 …,志)的3口区间为[卢i一3a,,P。+30,]。因此,可将各 观测个体的均值至;(i=1,2,…,咒)按[户。一3a,,户j+ 3巩](i一1,2'..f,足)分别划分到相应的志个区间中, 进而将其对应的每组观测值zⅡ(i=1,2,…,”;歹= 1,2,…,r)划分到对应的区间中,即相应的主基因型 z。,z。,…,z。中。若其不属于某区间,则将观测个 体在此区间对应的主基因型中的观测数据记为0, 这样就得到表2数据形式。 例如:若第1个样本到第P(户<以)个样本的均 值在[卢。一30。,户。+30,]区间,则判定这些样本属于 混合分布中的第1个成分分布,其主基因型为z。, 则其余样本的观测数在主基因型z。中记为0,可认 为这些样本在基因型为z,时观测不到;其他样本个 体主基因型的划分与此类似。 对每个个体的重复观测值进行主基因型划分 后,实际观测数据可整理为表2的形式。这种观测 设计可按重复中有重复的单因素完全随机设计进行 离差阵分析。 裹2等t复的单因素随机试验数据 Table 2 Data of the single element random experiment with equal repetition number 注lo咖(f一1,2·…,ItIj=1·2’-.’·”lf21,2,…,r)为第j个观测个体的第t次重复观测值的第i个主基因型值。 Note:zo,(f一1t2,…,量Ij21,2,…,t/ft=1。2.…,r)is the i major gene genotype vaJtle of the t times repeated measure Va]Lie of the J indi— viduai. , 3主基因和多基因存在的检验 翟盖篙焉盖等;兰i:罂罢?蚕妻惹是至 3.1主基因存在的检验 基因座位点之间的相互作用,如加性效应、完全显 对于主基因一多基因混合遗传的数量性状来说, 性、部分显性等还需进行进一步的似然比假设检验, 根据其表型混合分布中成分分布个数是的大小可以 才能作出相应推断,本文不加以详述。 万方数据
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