论文 题目： 由全基因组测序揭示的复发性急性髓性白血病中的克隆演 变 背景： 大多数急性髓性白血病患者死于复发后的进行性疾病，这与细胞遗传学水平 的克隆突变有关。为了确定与复发相关的突变谱，我们测序了来自八位急性髓性 白血病患者的原发肿瘤以及复发的基因组，并且运用深度测序的方法证实了成百 上千种基因突变。这样我们得以精确定义了复发情况下的无性系形成能力以及克 隆演变的方式。除了发现急性髓性白血病相关的新型的，循环性的发生突变的基 因（比如，WAC,SMC3,DIS3,DDX41 and DAXX)之外，我们也发现了在急性髓性 白血病复发过程中的两种主要克隆演变的形式： (1)原发肿瘤中的初始克隆体积累了突变并逐步演化成为复发性克隆： (2)初始克隆中的一个亚克隆体在先期治疗中存活下来，积累了额外的附 加突变，并在复发时进一步扩大化。 在所有的病例中，我们发现，化疗无法根除初始克隆体。对于八个病例的 关于特定性复发以及原发肿瘤突变的比较，揭示了分子生物水平上颠换的增加， 可能是由于细胞毒素化疗造成的DNA损伤。这些数据证明了，急性髓性白血病的 复发与新突变的增加以及克隆演变有关，它很有计划性，并且依靠患者所接受的 化疗建立并且保持活性。 正文摘要： 为了研究基因改变与急性髓性白血病复发的关系，以及确定克隆演变是否会 导致该疾病的复发，我们进行了原发性肿瘤及复发对的全基因组测序，并与来自 八位患者皮肤细胞样本进行了比对，其中包括一位特殊的(UPN)933124患者， 他的原发性肿瘤变异在之前就被发现过。华盛顿大学医学院机构审查委员会的支 持下，我们与八位患者签订了清晰明确的知情同意协议。我们对于每一个样本， 我们都达到了>25X的单倍体覆盖率和>97g%的二倍体覆盖率。这些病人来 自于五个不同的法-英-美血液学子类型，在初次确证和复发的时间间隔为235 到961天。 候选的原发性肿瘤中的体细胞以及复发后的基因组都运用“补充信息”中 所提到的方法进行了鉴别和选择。对于来自于皮肤细胞，原发性肿瘤细胞及复发 性肿瘤细胞样本的靶向基因进行的深度测序在每个位，点得到了590番数的中值。 每一例的变异以及构象改变的平均值为539。论文 题目： 由全基因组测序揭示的复发性急性髓性白血病中的克隆演 变 背景： 大多数急性髓性白血病患者死于复发后的进行性疾病，这与细胞遗传学水平 的克隆突变有关。为了确定与复发相关的突变谱，我们测序了来自八位急性髓性 白血病患者的原发肿瘤以及复发的基因组，并且运用深度测序的方法证实了成百 上千种基因突变。这样我们得以精确定义了复发情况下的无性系形成能力以及克 隆演变的方式。除了发现急性髓性白血病相关的新型的，循环性的发生突变的基 因（比如，WAC,SMC3, DIS3,DDX41 and DAXX）之外，我们也发现了在急性髓性 白血病复发过程中的两种主要克隆演变的形式： （1）原发肿瘤中的初始克隆体积累了突变并逐步演化成为复发性克隆； （2）初始克隆中的一个亚克隆体在先期治疗中存活下来，积累了额外的附 加突变，并在复发时进一步扩大化。 在所有的病例中，我们发现，化疗无法根除初始克隆体。对于八个病例的 关于特定性复发以及原发肿瘤突变的比较，揭示了分子生物水平上颠换的增加， 可能是由于细胞毒素化疗造成的 DNA 损伤。这些数据证明了，急性髓性白血病的 复发与新突变的增加以及克隆演变有关，它很有计划性，并且依靠患者所接受的 化疗建立并且保持活性。 正文摘要： 为了研究基因改变与急性髓性白血病复发的关系，以及确定克隆演变是否会 导致该疾病的复发，我们进行了原发性肿瘤及复发对的全基因组测序，并与来自 八位患者皮肤细胞样本进行了比对，其中包括一位特殊的(UPN) 933124 患者， 他的原发性肿瘤变异在之前就被发现过。华盛顿大学医学院机构审查委员会的支 持下，我们与八位患者签订了清晰明确的知情同意协议。我们对于每一个样本， 我们都达到了﹥25×的单倍体覆盖率和﹥97 ㏒％的二倍体覆盖率。这些病人来 自于五个不同的法-英-美血液学子类型，在初次确证和复发的时间间隔为 235 到 961 天。 候选的原发性肿瘤中的体细胞以及复发后的基因组都运用“补充信息”中 所提到的方法进行了鉴别和选择。对于来自于皮肤细胞，原发性肿瘤细胞及复发 性肿瘤细胞样本的靶向基因进行的深度测序在每个位点得到了 590 番数的中值。 每一例的变异以及构象改变的平均值为 539