由于基因中的加性效应在遗传过程中是可以固定的，即通过育种工作可以在后代 中固定下来的部分，而其它两个效应是由基因的互作造成的，在遗传后代时，由于基 因的分离重组使得这两部分在育种工作中不能被固定，因此，在数量遗传学中把全部 基因的加性效应值叫育种值(A),由显性效应产生的偏差叫显性偏差(D),由上位 (互作)产生的效应叫上位偏差(I),于是，表型值还可写成：P=A+D+1+E。 由于D和I是不能通过育种固定的部分，因此把其与E合并后称剩余值(R)。于是 P=A+R 根据统计学方差分析的原理，可得出： 表型方差(Vp)=育种值方差(VA)+剩余值方差(VR)=VA+VDV+VE 在育种实践中，通过对某一性状表型值的分析和计算，就可估测出各种选育性状 的遗传参数，计算出育种值和选择指数，根据这些指数选留种畜。 二、群体基因型均值 家畜改良的第一步是选择生产上有利的基因型，因此需先计算群体的基因型值。 以只有两个等位基因A1和A2的基因位点为例，设一个纯合体的基因型值为+，另 个纯合体基因型值为-a,杂合体的基因型值为d。各基因型值可以下示坐标表示： 坐标的原点位于两纯合体（基因型）数值的中点上，杂合体的基因型值取决于显 性度(ald) d=0时，称为无显性：0<d<a,A1对A2为不完全显性，-a<d<0时，A2对A1为不 完全显性；当d=+a时，A1为完全显性，当d=-a时，A2为完全显性：d>a时超显性。 当一个群体处于哈代-温伯格平衡时，根据上图可设A1为增效基因，A2为减效基 因，其频率分别为和q,随机交配后，可从已知的各基因型频率和基因型值估测出群 体的基因型值的平均数(u)。 u-a(p-q)+2pqd 若性状由多基因控制，则各位点的基因效应是可加的。 u=∑a(p-q)+2∑pad 另外，由于P=G+E 对于群体，当求其平均值时，P=G+E 当群体相当大时，环境偏差有正有负，E=0,故P=G=u 上式是以两个纯合体中点为0时的公式，而实际上两纯合子的平均值并不为0，如 果两个纯合体（基因型）数值的中点为M(绝对值)时， P-G-∑a(p-q)+2∑pqd+M 由于基因型值a和d一般是不能改变的，若想提高P,主要方法就是改变基因频率p 和q。在本例中，就是要有提高A1A1个体在群中的数量，尽量淘汰A2A2个体