除STS含量图和放射性杂交图外还有几个方法可用于制作人类物理图谱。克隆图谱使用与 STS含量图不同的技术来决定克隆体的接近程度。例如, CEPH YAC图谱法综合利用指纹法 ( fingerprinting)、间一Alu产物杂交法( inter-Alu product hybridization)和STS 含量图法来制作一张重叠的YAC克隆体图谱。缺失和体细胞杂交图依赖于大型基因组重组 (可以人工引进或由实验本身引起),从而将标记物放在由染色体断点所限定的bin?中。 FISH图谱使用一个荧光信号来探测克隆体的间期DNA扩散时的杂交情况,从而以细胞遗传 学图中一条带的位置定出克隆体的位置 研究者捕捉致病基因时对转录序列图谱有特别的兴趣。这些序列是由已表达序列,和那 些从已转化成STS并置于传统物理图谱的已知基因衍生而来的。近来一些制作大量EST的工 程已经使制图实验室能够得到数以万计的单一表达序列。一旦一个致病位点被鉴定出来后 这些转录序列图谱就能明显加快对目标基因的研究速度 YAC库可用于STS的排序,但其克隆体中的高嵌合率和高删除率使它们不能用于DNA测 序。去年高分辨率、可用于测序的质粒和BAC图谱则发展很快。因为它们所需的克隆工艺水 平很低。除了几个特例,如染色体19的 Lawrence livemore实验室质粒图外,其它图谱都 还只处在初级阶段 2.大型公用数据库中的基因组图谱 人类基因组物理图谱信息的主要来源是由NCBI和GDB提供的大型公用数据库。这些 数据库提供各种图谱的来源,使研究者能够用一个多用户界面交互系统在图谱中进行比较 在一定程度下,这些数据库还能进行图谱的综合及分析 (1) NCBi Entrez的染色体图谱 Entrez的基因组部分是最容易获得物理图谱信息的来源之一。此服务由NCBI所提供 Entrez试图以一种可理解的方式将几种遗传学图谱和物理图谱、DNA和蛋白序列信息、以 及一个目录型引用数据库和三维晶体结构信息融合起来。因为它的内部连接多,而且界面简 单, Entrez可作为搜索图谱的一个起始点 除人类基因组, Entrez还提供关于鼠类、果蝇、C. elegans、酵母以及一些原生动物的 图谱。尽管可比较的(同线性)图仍不可获得,但它代表了现在最大和最完整的一套多生物 体的图谱信息。 (2)GDB的浏览染色体图谱 另一种常见的人类物理图谱数据的来源是GDB。尽管GDB是基于当时基因图谱的重要性 才构建起来的,但是最近几年来,GDB也已经进行了扩建重组,现在同样可以算是物理图谱 数据的仓库。不象NCBI,GDB只限于人类图谱数据。它不含序列数据,也没有其它种类生物 的信息。同NCBI一样,GDB可以由WwW上得到。GDB提供了一种全功能的对其数据库的查询 式界面。 (3)来自个体来源的基因组图谱除 STS 含量图和放射性杂交图外还有几个方法可用于制作人类物理图谱。克隆图谱使用与 STS 含量图不同的技术来决定克隆体的接近程度。例如，CEPH YAC 图谱法综合利用指纹法 （fingerprinting）、间－Alu 产物杂交法（inter-Alu product hybridization）和 STS 含量图法来制作一张重叠的 YAC 克隆体图谱。缺失和体细胞杂交图依赖于大型基因组重组 （可以人工引进或由实验本身引起），从而将标记物放在由染色体断点所限定的 bin?中。 FISH 图谱使用一个荧光信号来探测克隆体的间期 DNA 扩散时的杂交情况，从而以细胞遗传 学图中一条带的位置定出克隆体的位置。 研究者捕捉致病基因时对转录序列图谱有特别的兴趣。这些序列是由已表达序列，和那 些从已转化成 STS 并置于传统物理图谱的已知基因衍生而来的。近来一些制作大量 EST 的工 程已经使制图实验室能够得到数以万计的单一表达序列。一旦一个致病位点被鉴定出来后， 这些转录序列图谱就能明显加快对目标基因的研究速度。 YAC 库可用于 STS 的排序，但其克隆体中的高嵌合率和高删除率使它们不能用于 DNA 测 序。去年高分辨率、可用于测序的质粒和 BAC 图谱则发展很快。因为它们所需的克隆工艺水 平很低。除了几个特例，如染色体 19 的 Lawrence Livemore 实验室质粒图外，其它图谱都 还只处在初级阶段。 2. 大型公用数据库中的基因组图谱 人类基因组物理图谱信息的主要来源是由 NCBI 和 GDB 提供的大型公用数据库。这些 数据库提供各种图谱的来源，使研究者能够用一个多用户界面交互系统在图谱中进行比较。 在一定程度下，这些数据库还能进行图谱的综合及分析。 （ 1 ） NCBI Entrez 的染色体图谱 Entrez 的基因组部分是最容易获得物理图谱信息的来源之一。此服务由 NCBI 所提供。 Entrez 试图以一种可理解的方式将几种遗传学图谱和物理图谱、 DNA 和蛋白序列信息、以 及一个目录型引用数据库和三维晶体结构信息融合起来。因为它的内部连接多，而且界面简 单， Entrez 可作为搜索图谱的一个起始点。 除人类基因组， Entrez 还提供关于鼠类、果蝇、 C. elegans 、酵母以及一些原生动物的 图谱。尽管可比较的（同线性）图仍不可获得，但它代表了现在最大和最完整的一套多生物 体的图谱信息。 （ 2 ） GDB 的浏览染色体图谱 另一种常见的人类物理图谱数据的来源是 GDB。尽管 GDB 是基于当时基因图谱的重要性 才构建起来的，但是最近几年来，GDB 也已经进行了扩建重组，现在同样可以算是物理图谱 数据的仓库。不象 NCBI，GDB 只限于人类图谱数据。它不含序列数据，也没有其它种类生物 的信息。同 NCBI 一样，GDB 可以由 WWW 上得到。GDB 提供了一种全功能的对其数据库的查询 式界面。 （ 3 ）来自个体来源的基因组图谱