HO Indinavir CH H CH3 ● Peptide substrate 2007W.H.Freeman and Company 图9.20 Indinavir是HIV蛋白酶抑制剂。Indinavir(crixivan)的结构与HIV蛋白酶底物多肽 的结构比较。底物断裂化学键用红色标出。 Indinavir与HV蛋白酶的多肽底物相似。Indinavir的醇与四面体中间物很相似，其它 基团与酶分子识别位，点S2,S1,S1',和S2'结合（图9.20）。X-射线晶体学研究显示，在活 性位，点，indinavir采用的构型能够接近于蛋白酶蛋白的二重对称结构（图9.2l)。结合后HV 蛋白酶活性位，点为可变翼盖住。抑制剂中心醇的羟基与活性位点的两个A$p相互作用。此 外，抑制剂的两个羰基与水分子形成氢键（在图9.21没有绘出），而这些水分子又与两翼的 肽键NH基团形成氢键。抑制剂与水分子和酶分子相互之间的这种互作模式，是不可能在 抑制剂与细胞天冬氨酸蛋白酶（如肾素）之间发生的。因此这些相互作用可能决定indinavir 抑制HV的特异性。 Figure9-21 Biochemistry,Sixth Edition 2007 W.H.Freeman and Company 图9.21HIV蛋白酶-indinavir复合物。（左边）HIV蛋白酶活性位，点与抑制剂indinavir结合。 (右边)旋转药物显示抑制剂接近于二重对称。图 9.20 Indinavir 是 HIV 蛋白酶抑制剂。Indinavir (crixivan)的结构与 HIV 蛋白酶底物多肽 的结构比较。底物断裂化学键用红色标出。 Indinavir 与 HIV 蛋白酶的多肽底物相似。Indinavir 的醇与四面体中间物很相似，其它 基团与酶分子识别位点 S2, S1, S1’，和 S2’结合（图 9.20）。X-射线晶体学研究显示，在活 性位点，indinavir 采用的构型能够接近于蛋白酶蛋白的二重对称结构（图 9.21）。结合后 HIV 蛋白酶活性位点为可变翼盖住。抑制剂中心醇的羟基与活性位点的两个 Asp 相互作用。此 外，抑制剂的两个羰基与水分子形成氢键（在图 9.21 没有绘出），而这些水分子又与两翼的 肽键 NH 基团形成氢键。抑制剂与水分子和酶分子相互之间的这种互作模式，是不可能在 抑制剂与细胞天冬氨酸蛋白酶（如肾素）之间发生的。因此这些相互作用可能决定 indinavir 抑制 HIV 的特异性。 图 9.21 HIV 蛋白酶-indinavir 复合物。（左边）HIV 蛋白酶活性位点与抑制剂 indinavir 结合。 （右边）旋转药物显示抑制剂接近于二重对称