Sphere Resolution到l3。注意分辨率越高，分子的显示速度越慢。 6注意Coloring Method一Name菜单项，每一个原子都有其自己的颜色，比如，O是红 色的，N是蓝色的，C是青色的，S是黄色的。 7按下Default键，这个操作允许你回到默认的绘图方式中。 更多显示方法。还有有趣的显示方法是CPK和Licorice。在CPK中， 就像以前化学中的球棒模型，每个原子都用球形表示，每个键都用圆柱 棒表示（球和圆柱形棒的半径和分辨率都可以独立地调节）。Licorice绘 图方法（广泛使用）也用球形表示原子，用圆柱形棒表示键，但是球的 半径不能被独立调节。 前面的显示方式可以让你看到蛋白质大分子的细节。但是，更多的普遍结构属性可以用抽象 的绘图方式来观看。 8在Drawing Method下选择Tube style,观察蛋白骨架。Radiusi设为0.8。 9在tube模式下观察你的蛋白质，你可以分辨出它有多少a螺旋、折叠和无规则卷曲吗？ 我们要了解的最后一个绘图模式是NewCartoon。它可以给出一个以二级结构为基础的简化 的蛋白质图像。α螺旋以卷曲的条带状表示，B折叠以固形箭头表示，所有其它的结构以管状 表示。这可能是观察蛋白质分子总体构造的最普遍的方法。 l0选择Drawing Method—NewCartoon 11现在确定蛋白质分子中有多少α螺旋、折叠和无规则卷曲。 泛素的结构。泛素有一个三圈半的c螺旋（残基23到34，其中有三 个是疏水的)，一个310-螺旋（残基56到59），还有5个折叠（残基 1到7,10到17,40到45,48到50,64到72)，还有7个反向转角。 VMD用STRIDE程序，以一种探索性的法则计算出二级结构Sphere Resolution 到13。注意分辨率越高，分子的显示速度越慢。 6 注意Coloring Method —— Name菜单项, 每一个原子都有其自己的颜色，比如，O是红 色的，N是蓝色的，C是青色的，S是黄色的。 7 按下Default键，这个操作允许你回到默认的绘图方式中。 . 前面的显示方式可以让你看到蛋白质大分子的细节。但是，更多的普遍结构属性可以用抽象 的绘图方式来观看。 8 在Drawing Method下选择Tube style，观察蛋白骨架。Radius设为0.8。 9 在tube模式下观察你的蛋白质，你可以分辨出它有多少α螺旋、β折叠和无规则卷曲吗？ 我们要了解的最后一个绘图模式是NewCartoon。它可以给出一个以二级结构为基础的简化 的蛋白质图像。α螺旋以卷曲的条带状表示，β折叠以固形箭头表示，所有其它的结构以管状 表示。这可能是观察蛋白质分子总体构造的最普遍的方法。 , 10 选择Drawing Method ——NewCartoon. 11 现在确定蛋白质分子中有多少α螺旋、β折叠和无规则卷曲。 泛素的结构。泛素有一个三圈半的α螺旋（残基23到34，其中有三 个是疏水的），一个310-螺旋（残基56到59），还有5个β折叠（残基 1到7，10到17，40到45，48到50，64到72），还有7个反向转角。 VMD用STRIDE程序，以一种探索性的法则计算出二级结构 更多显示方法。还有有趣的显示方法是 CPK 和 Licorice。在 CPK 中， 就像以前化学中的球棒模型，每个原子都用球形表示，每个键都用圆柱 棒表示（球和圆柱形棒的半径和分辨率都可以独立地调节）。Licorice 绘 图方法（广泛使用）也用球形表示原子，用圆柱形棒表示键，但是球的 半径不能被独立调节