图6泛素Licorice,Tube and NewCartoon.显示方法 1.4学习不同的着色方法 1现在,让我们来改变所显示图像的颜色。选择Coloring Method-一一ResTypel图5(c),这 可以区别非极性基团(白色),碱性基团(蓝色)、酸性基团(红色)和极性基团(绿色)。 2选择Coloring Method一Structure(c),确定NewCartoon表示的图形与二级结构相一致。 1.5学习不同选择 让我们来看一看分子中不同的独立的部分。 1如图5(f),在Graphical Representations窗口的Selected Atoms文本输入框中删去“al”,输 入heliⅸ,然后按下apply按钮或者按下键盘上的Enter或者Return键(每当在文本框中输入后 都可执行同样的操作),VMD会显示出分子中的α螺旋结构。 2在Graphical Representations窗口中选择Selections标签,如图7(a)。在Singlewords(b)这一 部分中你可以发现可以输入的选项表列。例如,要显示折叠而不是a螺旋,就可以在Selected Atoms的文本输入框中输入合适的词。1.4 学习不同的着色方法 1 现在,让我们来改变所显示图像的颜色。选择Coloring Method——ResType图5(c),这 可以区别非极性基团(白色),碱性基团(蓝色)、酸性基团(红色)和极性基团(绿色)。 2 选择Coloring Method —— Structure (c),确定NewCartoon表示的图形与二级结构相一致。 1.5 学习不同选择 让我们来看一看分子中不同的独立的部分。 1 如图5(f),在Graphical Representations窗口的Selected Atoms文本输入框中删去“all”, 输 入helix,然后按下apply按钮或者按下键盘上的Enter或者Return键(每当在文本框中输入后 都可执行同样的操作),VMD会显示出分子中的α螺旋结构。 2 在Graphical Representations窗口中选择Selections标签,如图7(a)。在Singlewords (b)这一 部分中你可以发现可以输入的选项表列。例如,要显示β折叠而不是α螺旋,就可以在Selected Atoms的文本输入框中输入合适的词。 图6 泛素Licorice, Tube and NewCartoon显示方法