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TABLE 8.7 Enzymes for which k/KM is close to the diffusion-controlled rate of encounter Enzyme kcat/Km (s-1M-1) Acetylcholinesterase 1.6×108 Carbonic anhydrase 8.3×107 Catalase 4×107 Crotonase 2.8×108 Fumarase 1.6×108 Triose phosphate isomerase 2.4×108 β-Lactamase 1×108 Superoxide dismutase 7×109 Source:After A.Fersht,Structure and Mechanism in Protein Science:A Guide to Enzyme Catalysis and Protein Folding(W.H. Freeman and Company,1999),Table 4.5. 大多数生化反应有多个底物 生物系统的大多数反应有两个底物,产生两个产物。这类反应叫双底物反应: A+B =P+Q 这样的反应中有很多能够将一个基团,如磷酸或氨基,从一个底物转移给另一个底物。而氧 化还原反应恩能够将一个底物的电子转移给另一底物。多底物反应可以分为两类,即 sequential displacement double displacement. sequential反应在这类反应中,所有底物必须先与酶结合,然后才释放产物。结果双底 物反应能够形成含有酶和两个底物的三元复合物。Sequential反应又分为有序(ordered)和 随机(random)两类。 用NAD或NADH作为底物的很多酶采用ordered sequential机制。乳酸脱氢酶是葡萄糖 代谢的一种重要酶,能够将丙酮酸还原成乳酸,同时将NADH氧化成NAD。 ÷0 0c0 NADH H+HO- -H NAD+ CH3 CH3 Pyruvate Lactate 在ordered sequential机制中,辅酶总是先与酶结合。反应次序可以用W.Wallace Cleland 提出的方案表示: NADH Pyruvate Lactate NAD+ Enzyme- Enzyme E(NADH)(pyruvate)E(lactate)(NAD+) 反应过程中酶是三元复合物,先是酶与底物,后来是酶与产物形成三元复合物。 在random sequential机制中,底物加入的顺序和产物释放的顺序是随机的。例如肌氨酸 激酶催化的用ATP和肌氨酸形成磷酸肌氨酸和ADP的反应。大多数生化反应有多个底物 生物系统的大多数反应有两个底物,产生两个产物。这类反应叫双底物反应: A + B ===== P + Q 这样的反应中有很多能够将一个基团,如磷酸或氨基,从一个底物转移给另一个底物。而氧 化还原反应恩能够将一个底物的电子转移给另一底物。多底物反应可以分为两类,即 sequential displacement 和 double displacement. sequential 反应 在这类反应中,所有底物必须先与酶结合,然后才释放产物。结果双底 物反应能够形成含有酶和两个底物的三元复合物。Sequential 反应又分为有序(ordered)和 随机(random)两类。 用 NAD 或 NADH 作为底物的很多酶采用 ordered sequential 机制。乳酸脱氢酶是葡萄糖 代谢的一种重要酶,能够将丙酮酸还原成乳酸,同时将 NADH 氧化成 NAD。 在 ordered sequential 机制中,辅酶总是先与酶结合。反应次序可以用 W. Wallace Cleland 提出的方案表示: 反应过程中酶是三元复合物,先是酶与底物,后来是酶与产物形成三元复合物。 在 random sequential 机制中,底物加入的顺序和产物释放的顺序是随机的。例如肌氨酸 激酶催化的用 ATP 和肌氨酸形成磷酸肌氨酸和 ADP 的反应
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