(1)实线封闭区域 一般允许区,非键合原子间的距离大于一般允许距离,此区域内任何二面角确定的构象 都是允许的,且构象稳定 (2)虚线封闭区域 是最大允许区,非键合原子间的距离介于最小允许距离和一般允许距离之间,立体化学 允许,但构象不够稳定 (3)虚线外区域 是不允许区,该区域内任何二面角确定的肽链构象,都是不允许的,此构象中非键合原 子间距离小于最小允许距离,斥力大,构象极不稳定。 Gly的Φ、ψ角允许范围很大。 总之,由于原子基因之间不利的空间相互作用,肽链构象的范围是很有限的,对非Gly 氨基酸残基一般允许区占全平面的7.7%,最大允许区占全平面20.3% 二级结构的基本类型 驱使蛋白质折叠的主要动力: (1)暴露在溶剂中的疏水基团降低至最少程度。 (2)要保持处于伸展状态的多肽链和周围水分子间形成的氢键相互作用的有利能量状 态。 (3)、a螺旋及其特征 在α螺旋中,多肽主链按右手或左手方向盘绕,形成右手螺旋或左手螺旋,相邻的螺圈 之间形成链内氢键,构成螺旋的每个Cα都取相同的二面角Φ、W 典型的a螺旋有如下特征: ①二面角:Φ=-57°,=-48°,是一种右手螺旋 回忆P143图3-52 ②每圈螺旋:3.6个a.a残基,高度:0.54nm ③每个残基绕轴旋转100°,沿轴上升0.15n ④氨基酸残基侧链向外 ⑤相邻螺圈之间形成链内氢链,氢键的取向几乎与中心轴平行。 ⑥肽键上NH氢与它后面(N端)第四个残基上的C=0氧间形成氢键。 图 这种典型的α螺旋用3.613表示,3.6表示每圈螺旋包括3.6个残基,13表示氢键封闭 的环包括13个原子 2.21螺旋(n=1) 3。螺旋(n=2,Φ 63螺旋(n=3) 4.3螺旋(n=4) 封闭环原子数3n+4(n=1、2、 2.273 3.613 n=4⑴实线封闭区域 一般允许区，非键合原子间的距离大于一般允许距离，此区域内任何二面角确定的构象 都是允许的，且构象稳定。 ⑵虚线封闭区域 是最大允许区，非键合原子间的距离介于最小允许距离和一般允许距离之间，立体化学 允许，但构象不够稳定。 ⑶虚线外区域 是不允许区，该区域内任何二面角确定的肽链构象，都是不允许的，此构象中非键合原 子间距离小于最小允许距离，斥力大，构象极不稳定。 Gly 的 Φ、Ψ 角允许范围很大。 总之，由于原子基因之间不利的空间相互作用，肽链构象的范围是很有限的，对非 Gly 氨基酸残基一般允许区占全平面的 7.7%，最大允许区占全平面 20.3％。 二级结构的基本类型 驱使蛋白质折叠的主要动力： (1)暴露在溶剂中的疏水基团降低至最少程度。 (2)要保持处于伸展状态的多肽链和周围水分子间形成的氢键相互作用的有利能量状 态。 α螺旋 （3）、 α螺旋及其特征 在α螺旋中，多肽主链按右手或左手方向盘绕，形成右手螺旋或左手螺旋，相邻的螺圈 之间形成链内氢键，构成螺旋的每个 Cα都取相同的二面角 Φ、Ψ。 典型的α螺旋有如下特征： ① 二面角：Φ= -57°, Ψ= - 48°，是一种右手螺旋 回忆 P143 图 3-52 ② 每圈螺旋：3.6 个 a.a 残基， 高度：0.54nm ③ 每个残基绕轴旋转 100°，沿轴上升 0.15nm ④ 氨基酸残基侧链向外 ⑤ 相邻螺圈之间形成链内氢链，氢键的取向几乎与中心轴平行。 ⑥ 肽键上 N-H 氢与它后面（N 端）第四个残基上的 C=0 氧间形成氢键。 图 这种典型的α螺旋用 3.613 表示，3.6 表示每圈螺旋包括 3.6 个残基，13 表示氢键封闭 的环包括 13 个原子。 2.27 螺旋（n=1） 310 螺旋（n=2，Φ= -49°, Ψ= - 26°） 613 螺旋（n=3） 4.316 螺旋（n=4） 封闭环原子数 3n+4（n=1、2、.....） 2.27 310 3.613 4.316 n=1 n=2 n=3 n=4