第一节 生物学数据库简介 第二节 生物学数据库的数据存储格式 第三节 生物学数据库的检索

介绍了生物信息学资源的发展趋势。详细介绍了包括基因组数据库、蛋白质序列数据库、蛋白质二级、三级数据库、蛋白质结构分类数据库、核酸和蛋白质结构数据库等各类生物信息学资源的、基本格式、检索方式等。介绍了“整合生物主要内容信息学”的基本概念，较详细地介绍了BLAST软件的内容及使用方法，并学习了几种通用的序列查询软件和对各级序列数据库进行综合查询的基本思路

⚫ 序列的相似性 ⚫ 二重序列比对 ⚫ 多重序列比对 ⚫ DNA片断组装 第一节 序列的相似性 ⚫ 字母表和序列 ⚫ 编辑距离 ⚫ 矩阵作图法 ⚫ 序列的两两比对 ⚫ 打分矩阵 第二节 二重序列比对基本算法

背景 ACEDB(一种线虫C.e/ egans数据库)是一种被广泛应用的管理和提供基因组数据的工具组。它 是在1991年由 Ri chard duri n和 Jean Thi erry-Mi eg首先提供的,他们发展它来支持和整理 C. elegans领域中的大范围序列和物理图谱的工作。在本章结尾所列出的因特网资源和资料中 可见1和2条。后续的程序由 Durbin和 Thierry- Mi eg编制和完善,还有许多其他人参与了代码 的编制。这一时期, ACEDB适用于许多动物和植物的基因组计划[3]

如第二章所述,建立 GenBank是为了适应人类基应组工程等科学研究产生的大量序列数据的信 息爆炸。总的来说, GenBank是带有注释的公用DNA蛋白质序列的集合。写作本书时, GenBank中有160万条链的纪录,含超过10亿个核苷酸碱基。向GenBank存入新的序列有两种方 法:通过 Sequi nBankl和等工具直接提交,或通过国际核苷酸序列数据库的组成部分 GenBank,eml,和DDB等相互之间传递数据的共享协议

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网址 : http: //search. china. epnet. com 目前在我校校园网开通试用的11个数据库: 1.3学术期刊全文数据库(ASE、ASP)

1. WinSpirs简介 2.Medline数据库介绍 3.数据库的组成结构 4. WinSpirs检索界面 5.检索方法与技巧 6.检索练习

超星数字图书馆主站网简介 1993年北京世纪超星信息技术发展有限公司成立,致力于纸 张图文资料数字化技术及相关应用与推广,是国内最重要的集 ISP与ICP于一身的数字化信息中心。 2000年1月超星数字图书馆在互联网上正式开通; 网址 : http: //www.ssreader.com.cn/ 国家“863”计划中国数字图书馆示范工程 由广东省立中山图书馆,浙江图书馆,解放军医学图书馆