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一、引言 快速、经济的核酸序列测序方法的出现使包括分子生物学、遗传学以及生物化学在内的许多 科学领域发生了革命。(Gi bert,1981: Sanger,1981)这项技术的发展同时也使人们需 要构建公用数据库来存储在全世界范围的实验室内得到的序列信息(Benson et al.1997 Stoesser et al.1997)。由于提交到数据库中的序列需要进行分析和解释,同时已经存在 的数据库中的条目需要进行辨识和修补以供研究人员进一步研究之用,因此随着公用数据库 的建立,生物信息学和计算生物学逐渐走向成熟
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第二章关系数据库 2.1关系模型概述 2.2关系数据结构 2.3关系的完整性 2.4关系模型的三层体系结构 2.5关系代数 2.6关系演算 2.7小结
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一、什么是数据结构 二、抽象数据类型及面向对象概念 三、数据结构的抽象层次 四、用C++描述面向对象程序 五、算法定义 六、模板 七、性能分析与度量
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静态数据表类定义 #include const int DefaultSize = 100; template class dataList //数据表的前视声明 template class Element { //数据表元素类的定义
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如第二章所述,建立 GenBank是为了适应人类基应组工程等科学研究产生的大量序列数据的信 息爆炸。总的来说, GenBank是带有注释的公用DNA蛋白质序列的集合。写作本书时, GenBank中有160万条链的纪录,含超过10亿个核苷酸碱基。向GenBank存入新的序列有两种方 法:通过 Sequi nBankl和等工具直接提交,或通过国际核苷酸序列数据库的组成部分 GenBank,eml,和DDB等相互之间传递数据的共享协议
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第7章构造数据类型 一、构造数据类型:共用体、用户自定义类型 7.1数组 一组同类型的若干个(已知个数)多个相关变量的数据集合
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6.4逻辑结构设计 一、逻辑结构设计的任务 1.概念结构是各种数据模型的共同基础。 2.为了能够用某一DBMS实现用户需求,还必须将概念结构进一步转化为相应的数据模型,这正是数据库逻辑结构设计所要完成的任务
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一、移动数据通信的概念 二、移动数据通信的交换技术 三、移动数据通信网
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6.3.1概念结构 什么是概念结构设计 一、需求分析阶段描述的用户应用需求是现实世界的具体需求。 二、将需求分析得到的用户需求抽象为信息结构即概念模型的过程就是概念结构设计。 三、概念结构是各种数据模型的共同基础,它比数据模型更独立于机器、更抽象,从而更加稳定。 四、概念结构设计是整个数据库设计的关键
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第五章关系数据理论 5.1问题的提出 5.2规范化 5.3数据依赖的公理系统 5.4模式的分解 5.5小结
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