第一节 测序技术概述 第二节 第二代测序原理 第三节 第二代测序技术的应用 第四节 生物信息学在第二代测序中的应用

⚫ 序列的相似性 ⚫ 二重序列比对 ⚫ 多重序列比对 ⚫ DNA片断组装 第一节 序列的相似性 ⚫ 字母表和序列 ⚫ 编辑距离 ⚫ 矩阵作图法 ⚫ 序列的两两比对 ⚫ 打分矩阵 第二节 二重序列比对基本算法

Entrez系统 NCB综合数据库 ·美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, 称NCBI)创建于1988年。 1991年,NCBI开发 Entrez了数据库查询系 统,用于对 GenBank等分子生物学和生物 医学文献摘要(Medline)等数据库的查询 (Schuler et al, 1996)

一、引言 快速、经济的核酸序列测序方法的出现使包括分子生物学、遗传学以及生物化学在内的许多 科学领域发生了革命。(Gi bert,1981: Sanger,1981)这项技术的发展同时也使人们需 要构建公用数据库来存储在全世界范围的实验室内得到的序列信息(Benson et al.1997 Stoesser et al.1997)。由于提交到数据库中的序列需要进行分析和解释,同时已经存在 的数据库中的条目需要进行辨识和修补以供研究人员进一步研究之用,因此随着公用数据库 的建立,生物信息学和计算生物学逐渐走向成熟

现代医学的挑战 生物信息学 分子同源性计算

数字信号处理: 是20世纪60年代，随着信息学科和计算机学科 的高速发展而迅速发展起来的一门新兴学科。它 的重要性日益在各个领域的应用中表现出来。 其主要标志是两项重大进展，即快速傅里叶变 换(FFT)算法的提出和数字滤波器设计方法的完善

风水与人体生命信息学 人类是地球的主宰，是宇宙的精华，万物的灵长。我们所研究的一切包括现代风 水学，都是为了人，都是为人类服务，使人类在这个星球上生活得更健康、更美 好、更舒心

浙江大学：生物信息学札记——生物信息学主要英文术语及释义（樊龙江）

随着人类基因组计划的实施,通过基因组测序,蛋白质序列测定结构解析等实 验,分子生物学家提供了大量的有关生物分子的原始数据,需要利用现代计算技 术对这些原始数据进行收集、整理、管理以便于检索使用。而为了解释和理解这 些数据,还需要对数据进行比对、分析,建立计算模型,进行仿真、预测与验 证,因而出现生物信息学,它的出现,极大的促进了分子生物学的发展

本章将集中介绍生物信息学中生物分子结构的有关内容,并将研究重点放在三维结构实际存 在的氨基酸序列上,力图使读者了解结构数据库记录的内容及如何合理应用各类通用软件程 序处理这类记录。本章不涉及结构生物学家们建立三维分子结构的计算程序,也不讨论相似 蛋白质构象的精细结构。在本章参考书目后列出了一些优秀的讨论蛋白质构象的有关专著和 蛋白质结构决定方法