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Animal Husbandry Veterinary Medicine 2020 Vol. 52 No. 2 表2水牛CART基因与11个物种编码区相似性分析 E值/随机匹配可能性与水牛基因匹配一致性/% 参考序列 美洲野牛( Bison bison bison) 7.00E-107 XM010853569.1 野牦牛( Bos mutus) CP027088.1 双峰驼( Camelus bactrianus) 单峰驼( Camelus dromedarii 1.00E-73 XM_o10974976.1 野猪( Sus scrofa) 马( Equus caballus) XM023618226 驴( Equus asinus) XM014851944.1 人类( Homo sapiens) 猕猴( Macaca mulatta) 2.00E-57 NM001265877.1 agr Bison bison bison 2068(NW 011494901.1 g! os mutus2196N07005930741) Camelus bactrianus 2210(NW 011511773.1) Camelus dromedarius 2107(NW 011591039.1) Sus scrofa 2035(NC 010458. 4) 100usa10N004638051 5CART基因系统进化树 2.4水牛CART蛋白理化性质分析 经 Prot Paran在线软件预测显示,水牛CART基因 由116个氨基酸残基组成,分子式为CsHN1s5O3S8 分子量为12790.18,带负电荷的残基总数(Asp+ Gu)为15个,带正电残基总数(Arg+Lys)为17 个,理论p值为8.22,属于碱性蛋白。消光值在 4845~4470之间,不稳定性指数(Ⅱ)计算为 38.67,属于稳定蛋白。 Prot scale在线预测分析显 示,水牛CART蛋白的总平均亲水性为-0.006,属 于两性氨基酸(图6)。 位点 图6水牛CART基因蛋白疏水性分析表 2 水牛 CART 基因与 11 个物种编码区相似性分析 物种 E 值/ 随机匹配可能性 与水牛基因匹配一致性/ % 参考序列 美洲野牛(Bison bison bison) 7􀆰 00E-107 100 XM_010853569.1 野牦牛(Bos mutus) 0 98 CP027088􀆰 1 普通牛(Bos taurus) 0 100 AY603972􀆰 1 羊(Ovis aries) 4􀆰 00E-99 98 XM_015101190􀆰 1 双峰驼(Camelus bactrianus) 7􀆰 00E-74 91 XM_010949313􀆰 1 单峰驼(Camelus dromedarius) 1􀆰 00E-73 91 XM_010974976􀆰 1 野猪(Sus scrofa) 0 78 EF581838􀆰 1 马(Equus caballus) 2􀆰 00E-54 85 XM_023618226􀆰 1 驴(Equus asinus) 1􀆰 00E-53 85 XM_014851944􀆰 1 人类(Homo sapiens) 3􀆰 00E-180 81 NG_015988􀆰 1 猕猴(Macaca mulatta) 2􀆰 00E-57 90 NM_001265877􀆰 1 图 5 CART 基因系统进化树 2􀆰 4 水牛 CART 蛋白理化性质分析 经 ProtParam 在线软件预测显示,水牛 CART 基因 由 116 个氨基酸残基组成,分子式为 C566H949N155O163 S8 , 分子量为 12 790􀆰 18, 带负电荷的残基总数 (Asp + Glu) 为 15 个, 带正电残基总数 (Arg +Lys) 为 17 个, 理论 pI 值为 8􀆰 22, 属于碱性蛋白。 消光值在 4 845~ 4 470 之 间, 不 稳 定 性 指 数 ( Ⅱ) 计 算 为 38􀆰 67, 属于稳定蛋白。 Prot scale 在线预测分析显 示, 水牛 CART 蛋白的总平均亲水性为- 0􀆰 006, 属 于两性氨基酸 (图 6)。 图 6 水牛 CART 基因蛋白疏水性分析 ·4· Animal Husbandry & Veterinary Medicine 2020 Vol􀆰 52 No􀆰 2
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