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ATOGTGTCACCTAOAT AGCTTGGCG TAATCATGGTCATAGCT 00 110 120 困5.5荧光检测双脱氧法产生的寡核酸片段。四个链终止双脱氧核苷酸用不同颜色的荧光 标签标记(如红色标记T)。色谱图中一种颜色表示一种核苷酸。 固相自动法能合成DNA探针 如同多肽,依次添加活化单体至不溶性载体交联的生长链能够合成DNA链。活化单体 是质子化的脱氧核苷3-亚磷酰胺。第1步,加入的脱氧核苷3'-亚磷酰胺的3”磷原子与生长 链的5-0原子连接,形成亚磷酸三酯(图5.6)。加入的脱氧核苷3-亚磷酰胺5'OH被二甲 氧三苯甲基(DMT)保护,不参与这个连接反应。3”磷酰基与B-氛乙基(B-CE)结合,没有 反应活性。类似地,嘌呤和嘧啶碱基环上的氨基也需要保护。 Dimethoxytrityl DMT]group base(protected) CH B-Cyanoethyl Hz (BCE)group 一C CH NC一2 Aaoreneminu ” 在无水条件下进行缩合反应(因为水能够与亚磷酰胺发生反应)。第二步,用碘氧化亚 磷酸三酯,生成磷酸三酯((五价磷)。第三步,二氯乙酸脱去生长链5OH的保护基团DMT, 但不影响其它保护基团。现在DNA合成已经完成一个核苷酸延长,可以进行下一轮操作。 每延长一个核苷酸耗时10分钟,延伸效率超过99%。 basen-1 basen basen-1 Activated monomer Growing chain hosphite triester intermediate by lz basen-1 ③ Deprotection cetic acid Elongated chain Phosphotriester intermediate 总 图5.6亚磷酸三酯法固相合成DNA链。加成到生长链的活化单体是脱氧核苷3'-亚磷酰胺, 其5-OH用DMT保护,3'磷氧原子用B-CE保护,还有一个保护基团保护碱基环上的胺基。图 5.5 荧光检测双脱氧法产生的寡核酸片段。四个链终止双脱氧核苷酸用不同颜色的荧光 标签标记(如红色标记 T)。色谱图中一种颜色表示一种核苷酸。 固相自动法能合成 DNA 探针 如同多肽,依次添加活化单体至不溶性载体交联的生长链能够合成 DNA 链。活化单体 是质子化的脱氧核苷 3'-亚磷酰胺。第 1 步,加入的脱氧核苷 3'-亚磷酰胺的 3'-磷原子与生长 链的 5'-O 原子连接,形成亚磷酸三酯(图 5.6)。加入的脱氧核苷 3'-亚磷酰胺 5'-OH 被二甲 氧三苯甲基(DMT)保护,不参与这个连接反应。3'-磷酰基与氰乙基(CE)结合,没有 反应活性。类似地,嘌呤和嘧啶碱基环上的氨基也需要保护。 在无水条件下进行缩合反应(因为水能够与亚磷酰胺发生反应)。第二步,用碘氧化亚 磷酸三酯,生成磷酸三酯(五价磷)。第三步,二氯乙酸脱去生长链 5'-OH 的保护基团 DMT, 但不影响其它保护基团。现在 DNA 合成已经完成一个核苷酸延长,可以进行下一轮操作。 每延长一个核苷酸耗时 10 分钟,延伸效率超过 99%。 图 5.6 亚磷酸三酯法固相合成 DNA 链。加成到生长链的活化单体是脱氧核苷 3'-亚磷酰胺, 其 5'-OH 用 DMT 保护,3'-磷氧原子用CE 保护,还有一个保护基团保护碱基环上的胺基
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