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b.底物或可逆抑制剂可保护共价修饰剂的抑制作用 对化学修饰实验得出的结论应非常慎重,因为可能被修饰的基团位于活性中心以外的附近, 由于空间位阻使得底物无法进入活性中心,从而表现出酶失去活性。活性中心往往有多个与底物 结合的基团,修饰其中的一个往往不能使酶失去活性,可能导致结合力减弱,也可能改变被结合 底物的专一性。被修饰的氨基酸残基的位号可通过肽链的部分消化分析得到 422动力学分析法 动力学分析法是利用改变酶反应介质的pH,观察其对酶催化能力的影响。酶蛋白分子中含 有许多可解离的基团,p改变必然会影响这些基团的解离状态。当活性中心的必需基团的解离 状态发生变化时,会直接影响到酶的催化能力。因此,通过pH~酶催化活性关系的研究,可能 得到与催化直接相关的某些基团的pK值,进而推断这些基团的种类 pK值的测定以后再述 各基团的pK值有一理论值,但由于微环境的影响,实测的pk值往往与理论值有偏差,导 致分析基团种类的困难,这时需要用其他方法辅助分析,如测该基团的解离热函△H,或加有机 溶剂,改变溶液的电导率,作pH依存关系实验,从pK的变化来协助推断基团种类。 表、各种氨基酸残基的pK值与解离热函△H 氨基酸残基 值 △H(J/mol) a一羧基 3.0~3.2 ±6.276 β一羧基(天冬氨酸) 3.0~4.2 ±6.276 Y一羧基(谷氨酸) ~4.4 ±6.276 酚羟基(酪氨酸) 9.8~10.4 ±25,104 SH基(半胱氨酸) 8.3~8.6 咪唑基(组氨酸) 5.6~7.0 28.870~31.380 氨基 7.6~8.4 41,840~54,392 a一氨基(胱氨酸) 6.5~8.5 ε一氨基(赖氨酸) 9.4~10.6 41,840~50,208 胍基(精氨酸) 116~12.6 50,208~54,3926 b.底物或可逆抑制剂可保护共价修饰剂的抑制作用。 对化学修饰实验得出的结论应非常慎重,因为可能被修饰的基团位于活性中心以外的附近, 由于空间位阻使得底物无法进入活性中心,从而表现出酶失去活性。活性中心往往有多个与底物 结合的基团,修饰其中的一个往往不能使酶失去活性,可能导致结合力减弱,也可能改变被结合 底物的专一性。被修饰的氨基酸残基的位号可通过肽链的部分消化分析得到。 4.2.2 动力学分析法 动力学分析法是利用改变酶反应介质的 pH,观察其对酶催化能力的影响。酶蛋白分子中含 有许多可解离的基团,pH 改变必然会影响这些基团的解离状态。当活性中心的必需基团的解离 状态发生变化时,会直接影响到酶的催化能力。因此,通过 pH~酶催化活性关系的研究,可能 得到与催化直接相关的某些基团的 pK 值,进而推断这些基团的种类。 pK 值的测定以后再述。 各基团的 pK 值有一理论值,但由于微环境的影响,实测的 pK 值往往与理论值有偏差,导 致分析基团种类的困难,这时需要用其他方法辅助分析,如测该基团的解离热函△H,或加有机 溶剂,改变溶液的电导率,作 pH 依存关系实验,从 pK 的变化来协助推断基团种类。 表、各种氨基酸残基的 pK 值与解离热函△H 氨基酸残基 pK 值 △H(J/mol) α-羧基 3.0 ~ 3.2 ±6,276 β-羧基(天冬氨酸) 3.0 ~ 4.2 ±6,276 γ-羧基(谷氨酸) ~ 4.4 ±6,276 酚羟基(酪氨酸) 9.8 ~ 10.4 ±25,104 SH 基(半胱氨酸) 8.3 ~ 8.6 — 咪唑基(组氨酸) 5.6 ~ 7.0 28,870 ~ 31,380 α-氨基 7.6 ~ 8.4 41,840 ~ 54,392 α-氨基(胱氨酸) 6.5 ~ 8.5 — ε-氨基(赖氨酸) 9.4 ~ 10.6 41,840 ~ 50,208 胍基(精氨酸) 11.6 ~ 12.6 50,208 ~ 54,392
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