像你在第一单元所学的用来描述图形显示方法的文本原子选择。你要学习的Atomselect,返 回的选择是一个命令。 3在Tk控制台窗口键入crystal[atomselect top"all"],这个选择包括了分子中所有原子，并把 所选赋予变量crystal。.我们用“top”来指代顶层分子，不用molecule ID(是个数字，不好记)。 Atomselect得出的结果是一个功能。因此，$crystal是一个针对all”所指代内容执行的功能。 4键入Scrystal num.把num赋给所选一个原子，返回的是原子在这个选择中的序号。检查 一下这个序号是不是与分子中原子的序号相同（可以从main窗口中读取）。 5键入Scrystal set beta0.。这样就把所有原子的beta”域设为0。当你这样做的时候，你会观 察到屏幕上原子的颜色会突然变成一样的（因为它们此时具有相同的beta值）。 原子选择中的原子指的是原始分子中的原子。当你通过选择改变一些原子的属性（如bta 值)，这些变化会反映在所有其它包括这些原子的选择中。 6现在，输入set sel[atomselect top"hydrophobic"门。这新建了一个包括所有疏水残基的选择。 7让我们把所有的疏水原子的beta值设为l来标记它们。你现在应该明白如何操作了：$sel set beta1。如果OpenGL Display中的颜色没有更新，单击Graphical Representations底部的Apply 按钮。 原子属性的例子。你可以通过应用原子选择，包括不同部分、残基、原子 名、位置(x,y和z),电荷、质量、体积、半径等等来获得或者设置许 多原子的属性 8现在要通过改变原子的物理性质来进一步说明疏水基团的分布。输入Scrystal set radius 1.0,以使所有的原子变得小一点，更易观察。输入$sel set radius1.5,让疏水基团大一点。 半径的大小范围会影响图形的显示方式（如VDW,CK)。 现在已经新建了一个图像，可以清楚地区别蛋白质的疏水部分和亲水部分。如果你完全按照 教程的要求来做，你得到的蛋白质图像就会如图12所示。像你在第一单元所学的用来描述图形显示方法的文本原子选择。你要学习的Atomselect，返 回的选择是一个命令。 3 在Tk控制台窗口键入crystal [atomselect top "all"]，这个选择包括了分子中所有原子，并把 所选赋予变量crystal。我们用“top”来指代顶层分子，不用molecule ID（是个数字，不好记）。 Atomselect得出的结果是一个功能。因此，$crystal是一个针对“all”所指代内容执行的功能。 4 键入$crystal num. 把num赋给所选一个原子，返回的是原子在这个选择中的序号 。检查 一下这个序号是不是与分子中原子的序号相同（可以从main窗口中读取）。 5 键入$crystal set beta 0.。这样就把所有原子的“beta”域设为0。当你这样做的时候，你会观 察到屏幕上原子的颜色会突然变成一样的（因为它们此时具有相同的beta值）。 原子选择中的原子指的是原始分子中的原子。当你通过选择改变一些原子的属性（如beta 值），这些变化会反映在所有其它包括这些原子的选择中。 6 现在，输入set sel [atomselect top "hydrophobic"]。这新建了一个包括所有疏水残基的选择。 7 让我们把所有的疏水原子的beta值设为1来标记它们。你现在应该明白如何操作了：$sel set beta 1。如果OpenGL Display中的颜色没有更新，单击Graphical Representations底部的Apply 按钮。 原子属性的例子。你可以通过应用原子选择，包括不同部分、残基、原子 名、位置（x，y和z），电荷、质量、体积、半径等等来获得或者设置许 多原子的属性 8 现在要通过改变原子的物理性质来进一步说明疏水基团的分布。输入$crystal set radius 1.0，以使所有的原子变得小一点，更易观察。输入$sel set radius 1.5，让疏水基团大一点。 半径的大小范围会影响图形的显示方式（如VDW, CPK）。 现在已经新建了一个图像，可以清楚地区别蛋白质的疏水部分和亲水部分。如果你完全按照 教程的要求来做，你得到的蛋白质图像就会如图12所示