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子的变化,struct表示二级结构,在图中,各种颜色所代表的意义都用字母作了标注。 T Turn E Extended conformation sheets) B Isolated bridge Alpha helix G 3-10 helix Pi helix Coil 1.8保存结果 用VMD创建的图形可以与创建的图形显示法,VMD环境设置一起保存。这里提到的VMD 环境设置包括你开启一个新的VMD环境所需要的所有信息,这就不会使你以前的工作成果 丢失。 1在VMD主窗口,选择File一Save State菜单项,写上一个合适的文件名(例如: myfirststate.vmd)保存。 File一Load State菜单项允许你导入一个保存过VMD环境设置,就像保存时一样,虽然 设置好的VMD环境允许你用VMD来处理蛋白质的图像,探索它的性质,但是你通常需要得 到能用于论文和其他各种文件的图像。VMD可以润色图像,产生一个可作它用的图像文件。 如下所述: 2用你己经学过的所有关于VMD的知识,用缩放、旋转和改变分子位置的方法找到蛋白质 分子的合适的视野。打开和关闭不同的显示方法,提高选择的分辨率,调整其他属性。如果 你想得到一个质量很高的分子,注意每一个显示方法的分辨率。 3注意你用Sequence Viewer extension创建的新显示法。如果需要的话,隐藏或者删除它们。 4在润色图像之前,选择Graphics一Colors菜单项,改变背景颜色。选择Display category, Background name和8 white color..。这样背景就变成白色的了。 5选择File一Render菜单项(渲染),一个叫做File Render Controls的窗口会在屏幕上出现。 6可以用不同的文件包来润色分子。如果你用的操作系统是Unix或者Mac OS X,就在Render using菜单中选择TachyonInternal,否则选择Tachyon。 7在Filename文本输入框中键入图像要保存的文件名,例如:picture.tga或者picture.dat(默子的变化,struct表示二级结构,在图中,各种颜色所代表的意义都用字母作了标注。 . T E B H G I C Turn Extended conformation (_ sheets) Isolated bridge Alpha helix 3-10 helix Pi helix Coil 1.8 保存结果 用VMD创建的图形可以与创建的图形显示法,VMD环境设置一起保存。这里提到的VMD 环境设置包括你开启一个新的VMD环境所需要的所有信息,这就不会使你以前的工作成果 丢失。 1 在VMD主窗口,选择File ——Save State菜单项,写上一个合适的文件名(例如: myfirststate.vmd)保存。 File —— Load State菜单项允许你导入一个保存过VMD环境设置,就像保存时一样,虽然 设置好的VMD环境允许你用VMD来处理蛋白质的图像,探索它的性质,但是你通常需要得 到能用于论文和其他各种文件的图像。VMD可以润色图像,产生一个可作它用的图像文件。 如下所述: 2 用你已经学过的所有关于VMD的知识,用缩放、旋转和改变分子位置的方法找到蛋白质 分子的合适的视野。打开和关闭不同的显示方法,提高选择的分辨率,调整其他属性。如果 你想得到一个质量很高的分子,注意每一个显示方法的分辨率。 3 注意你用Sequence Viewer extension创建的新显示法。如果需要的话,隐藏或者删除它们。 4 在润色图像之前,选择Graphics —— Colors菜单项,改变背景颜色。选择Display category, Background name和 8 white color.。这样背景就变成白色的了。 5 选择File—— Render菜单项(渲染),一个叫做File Render Controls的窗口会在屏幕上出现。 6 可以用不同的文件包来润色分子。如果你用的操作系统是Unix或者Mac OS X,就在Render using菜单中选择TachyonInternal,否则选择Tachyon。 7 在Filename文本输入框中键入图像要保存的文件名,例如:picture.tga 或者picture.dat (默
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