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4期 张群远等:品种区域试验中算术平均值、BLUP和AMM估值的精度比较 431 态度(即了:-了的“缩小”越多),这与我们的实际经验是吻合的。所以,品种随机的假设在此 有其合理性。 1.2.3AMMI模型及其估值 对模型(3)中的互作效应值0进行主成分分解(principal com ponent analysis,PCA),即得到AMI模型[2: Yg=以+哥+与+n+P作+g (6) 入。为品种×环境两向互作值矩阵的第n个奇异值(其平方即为特征根):um为互作值矩 阵中品种i的特征向量的第n个元素:n为互作值矩阵中环境j的特征向量的第n个元素:P 为O,进行PCA分解后的剩余部分:p的最大可取值N为s和v中的最小值减I,即p≤N=Mim (s-1,v-1)。p的取值不同,(6)式可得到不同的模型,所以,AI模型其实是一系列模型 的总称。p取值从到N,对应模型分别称为AMM-O、AMM-1、AMM-2·AMM-N模型。实际 应用中往往根据F测验的显著性来确定p的大小(一般取入值较大的前1~3项),这时,P 以后的(N-p)个PCA项被当作剩余归入Pg中。AMMI模型中的P被当作误差看待,所以,品种 ×环境组合均值的AMM组成为: =r+8+9+xa (7) 由于AMMI模型把各种效应看作是固定的,所以,与(4a)式同理,(7)式中的u、g:和e 分别以2=了,g:=(了-了)和g=(了-下)进行估计:入m、un和n则需先求出互作值矩阵a =了,-了:-了+了,再作特征分解求得它们的估值。最后得到的AMl估值为 ANNI(g)=了+了-了+i (8) AMI模型在保留模型(3)加性主效部分的同时,利用PCA方法压缩简化了互作的信息。 理论上讲,这有助于剔除算术平均值中所包含的部分误差,从而提高以估值的精度。需要指 出的是,当AMI模型的p取最大值N时(此时称为AMM全模型),模型中乘式互作项总和与 (3)式中的0,一致,所以,此时AMM(g)与(5a)式的BLUE(g)以及算术平均值相等 1.3各种估值精度的交叉验证 各种估值精度的比较采用交叉验证(cross validation)方法2]。具体做法是,对每年的区试 数据(v个品种,s个地点,r次重复),以试点为单位,把r个重复观测值随机分开,其中r1 个用于建立模型和估计,(称为建模数据),剩余1个用于验证(称为验证数据)。利用建模数 据,根据(4)组式和(8)式,分别求出g的BLUE、BLUPge、BLUPg BLUPe和AMMI估值(算术 平均值即B心E,故不再单独计算):由于本文使用的是平衡数据,(5)组式中的各种方差成分 直接通过方差分析的方法获得。对于每种估值,先根据(9)式出计算相应的平均预测差平 方和(mean square prediction differences,MSPD),然后根据(1O)式求出该估值相对于算术平均值 的精度增益倍数(gain factor,GF)。 MsPD=∑(Y,-¥与P/s (9) i=1j=1 MSe GF=(T-1)(MSPD-Me) (10) 公式中Y为品种i在环境j上的估计值:Y为验证观测值:MS为环境内的误差项均方, 由全部观侧值的号差分析获得。重复进行300次数据分样和计算,得到每种估值的平均态度(即!!" !!! 的“缩小”越多),这与我们的实际经验是吻合的。所以,品种随机的假设在此 有其合理性。 "#$#% &’’( 模型及其估值 对模型(%)中的互作效应值!"#进行主成分分解()*+,-+)./ -012 )0,3,4 .,./56+6,78&),即得到 &’’( 模型[$]: !"#$ % " & ’" & (# & " ) * % " #*+"*,#* &$"# &%"#$ (9) #* 为品种 : 环境两向互作值矩阵的第 , 个奇异值(其平方即为特征根);+"*为互作值矩 阵中品种 + 的特征向量的第 , 个元素;,#*为互作值矩阵中环境 ; 的特征向量的第 , 个元素;$"# 为!"# 进行 78& 分解后的剩余部分;) 的最大可取值 < 为 6 和 = 中的最小值减 ",即 )#< > ’+, (6 ! ",= ! ")。) 的取值不同,(9)式可得到不同的模型,所以,&’’( 模型其实是一系列模型 的总称。) 取值从到 <,对应模型分别称为 &’’(2?、&’’(2"、&’’(2$……&’’(2< 模型。实际 应用中往往根据 @ 测验的显著性来确定 ) 的大小(一般取#* 值较大的前 " A % 项),这时,) 以后的(<2))个 78& 项被当作剩余归入$"# 中。&’’( 模型中的$"# 被当作误差看待,所以,品种 : 环境组合均值""# 的 &’’( 组成为: ""# % " & ’" & (# & " ) * % " #*+"*,#* (B) 由于 &’’( 模型把各种效应看作是固定的,所以,与(C.)式同理,(B)式中的"、’" 和 (# 分别以 - ">!!,- ’" >(!!" !!!)和 - (# >(!!# !!!)进行估计;#*、+"*和 ,#*则需先求出互作值矩阵!- "# >!!"# !!!" !!!# D!!,再作特征分解求得它们的估值。最后得到""# 的 &’’( 估值为: &’’(( ""# )% !!" &!!# .!! & " ) * % " #- * - +"* - ,#* (E) &’’( 模型在保留模型(%)加性主效部分的同时,利用 78& 方法压缩简化了互作的信息。 理论上讲,这有助于剔除算术平均值中所包含的部分误差,从而提高""#估值的精度。需要指 出的是,当 &’’( 模型的 ) 取最大值 < 时(此时称为 &’’( 全模型),模型中乘式互作项总和与 (%)式中的!"# 一致,所以,此时 &’’(( ""# )与(F.)式的 GHIJ(""# )以及算术平均值相等。 !#" 各种估值精度的交叉验证 各种估值精度的比较采用交叉验证(-*066 =./+K.4+0,)方法[$]。具体做法是,对每年的区试 数据(= 个品种,6 个地点,* 次重复),以试点为单位,把 * 个重复观测值随机分开,其中 *2" 个用于建立模型和估计"("# 称为建模数据),剩余 " 个用于验证(称为验证数据)。利用建模数 据,根据(C)组式和(E)式,分别求出""# 的 GHIJ、GHI7L3、GHI7L、GHI73 和 &’’( 估值(算术 平均值即 GHIJ,故不再单独计算);由于本文使用的是平衡数据,(F)组式中的各种方差成分 直接通过方差分析的方法获得[C]。对于每种估值,先根据(M)式出计算相应的平均预测差平 方和(13., 6NO.*3 )*3K+-4+0, K+PP3*3,-36,’Q7R),然后根据("?)式求出该估值相对于算术平均值 的精度增益倍数(L.+, P.-40*,S@)。 ’Q7R % " , " % " " / # % " ( - !"# . !0 "# )$ 1 ,/ (M) S@ % ’Q3 (2 . ")(’Q7R ! ’Q3) ("?) 公式中 - !"# 为品种 + 在环境 ; 上的估计值;!0 "# 为验证观测值;’Q3 为环境内的误差项均方, 由全部观测值的方差分析获得。重复进行 %??? 次数据分样和计算,得到每种估值的平均 C 期 张群远等:品种区域试验中算术平均值、GHI7 和 &’’( 估值的精度比较 C%" 万方数据
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