第一节 统计学习与推理基础 第二节 统计模型与参数推断 第三节 聚类分析、主成分分析与Fisher判别 第四节 贝叶斯推理 第五节 隐马尔可夫模型 第六节 动态神经网络 第七节 深度学习 第八节 支持向量机 第九节 MATLAB的应用实例

第1章 生物信息学引论 第2章 生物学基础 第3章 生物信息学资源与数据挖掘工具 第四章 序列分析 第五章 序列比对 第6章 分子系统发生分析 第7章 生物芯片 第8章 后基因组时代的生物信息学

对生物芯片作了简要介绍，从生物芯片的分类、基本原理、应用和数据的处理与分析几个角度学习生物芯片有关的基本知识

介绍了分子系统发生分析的基本内容，几种分子进化模型。重点学习分子系统树的构建方法，最后介绍分子系统发生树的分析软件

第一节 基因组学概述 第二节 蛋白质编码基因的注释 第三节 RNA基因的注释 第四节 重复序列的注释 第五节 假基因的注释 第六节 案例分析：黄瓜基因组的注释

成绩 一、不安排考试 二、每次实验课布置实验报告,共6次作业。 三、期末交一篇综述。 四、期评成绩:作业占60%,综述40%。 五、作业交至我的邮箱

(1) Multiple sequence alignment and progressive global alignment (ClustalW) (2) Find and model local multiple alignment (3) How to evaluate the quality of a PSSM?

5.1 Genetic polymorphism and phylogenetic tree 5.2 Construction of phylogenetic tree

第1节 序列特征解析 第2节 序列比对和分析 第3节 分子进化和发育树构建

数据库(Database) 用于收集、整理、储存、加工、发布 和检索数据的系统。 生物类的数据库种类很多， 投稿文章首先要将核苷酸序列或蛋白， 质序列提交到相应的数据库中