随着cDNA微阵列和寡核苷酸芯片(下文没有特别说明时,统称为DNA微阵列)等 高通量检测技术的发展,我们可以从全基因组水平定量或定性检测基因转录产物mrNA 在本章中,基因表达数据特指基于DNA微阵列实验得到的反映mRNA丰度的数据,而 不包括基因表达最终产物—蛋白质丰度的数据。由于生物体中的细胞种类繁多,同时基因 表达具有时空特异性,因此,基因表达数据与基因组数据相比,要更为复杂,数据量更大, 数据的增长速度更快

DNA序列自身编码特征的分析是基因组信息学研究的基础,特别是随着大规模测序的日 益增加,它的每一个环节都与信息分析紧密相关。从测序仪的光密度采样与分析、碱基读出、 载体标识与去除、拼接、填补序列间隙、到重复序列标识、读框预测和基因标注的每一步都 是紧密依赖基因组信息学的软件和数据库。特别是拼接和填补序列间隙更需要把实验设计和 信息分析时刻联系在一起

一、名词解释 1.基因组 2.原病毒 3.分子杂交 4.启动子 5.端粒酶 6.副密码子 二、是非 1.半保留复制是指有50%的基因是新合成的另50%的基因是上一代的。 2.微生物全基因组测序的进展完全证明了真核生物是从原核生物直接进化而来。 3.×174 phage是一种很小的E. coli phage,它有5386个核苷酸,其DA为双链环状

金力教授简介 人类分子遗传学家、教育部“长江学者奖励计划”讲座教授、复 旦大学生命科学学院院长。1985年复旦大学生物系遗传专业本科毕业, 1987年复旦大学遗传学专业硕士毕业,1994年获德克萨斯大学遗传学 博士学位,1994年至1996年在美国斯坦福大学医学院从事博士后研究。 曾任德克萨斯大学助理教授、副教授、辛辛那提大学医学院教授。现 兼任中科院-马普计算生物学伙伴研究所所长,国家人类基因组南方 研究中心副主任,“973”项目首席科学家,《人类基因组学》杂志主 编和《人类生物学》、《突变研究》等杂志的编委等职务

遗传学中把染色体基因组所控制的遗传现象和遗传规律称为核遗传,把由 细胞质内的遗传物质基因组控制的遗传现象及规律称为胞质遗传。 我们知道细胞核内染色体上的基因是重要的遗传物质,由核基因所决定的 遗传方式叫“核遗传”,随着遗传学研究的深入,人们发现细胞核的遗传并不 是生物唯一的遗传方式,生物的某些遗传现象并不决定于核基因或不完全决定 于核基因

基本概念 遗传标记(Genetic Marker):是指一些等 位基因或遗传物质,而这些等位基因或遗传物 质具有简单的遗传方式,它们以生物体上各种 变异表现出来。 遗传多态性(Genetic Polymorphisms):是指 一个基因座位在群体中存在两个或更多类的等 位基因的现象。 标记辅助选择(Marker-assisted- Selection MAS):就是对特定的主效基因(major gene )或者数量性状位点(Quantitative Trait Loci QTL)在遗传标记的辅助下区分其基因型,并 在此基础上应用于家畜的育种实践

一、名词解释:(6题,每题3分,共18分) 1.分子伴侣(molecular chaperone) 2.核糖核酸质酶(ribozyme) 3.光复活 4.基因组(genome) 5.异染色质化 6.诱导物(inducer)

第一章 生物信息学的概念及其发展历史 第二章 生物学数据库及其检索 第三章 序列比对原理 第四章 蛋白质结构预测与分析 第五章 真核生物基因组的注释 第六章 蛋白质组学 第七章 系统生物学 第八章 合成生物学 第九章 分子进化与系统发育 第十章 统计学习与推理 第十一章 生物信息学编程基础 第十二章 第二代测序技术及其应用

第一节 遗传变异的物质基础 第二节 微生物的基因组结构 第三节 质粒和转座因子 第四节 基因突变及修复 第五节 基因重组 第六节 微生物育种 第七节 菌种的衰退、复壮与保藏

第一节 医学遗传学研究的对象和范围 第二节 遗传病的概念 The hereditary disease's concept 第三节 遗传病的主要类型 The hereditary disease's main type 第四节 医学遗传学分科及发展简史 第五节 走进基因组医学时代