要在分子生物学领域进行计算分析,从公共数据库( DDBJ/EMBL/GenBank)中获得DNA序列记录 是其必需条件。借助于和一个已了解其生物学功能而被分离出来并测序的基因比较相似性的 方法,我们可以尝试确定某疾病基因的功能,这种方法要求序列记录有精确并且富于信息的 生物学注解。对于将其作为 BLAST或Eηtrez的检索结果来硏究的科学家来说,编码的蛋白质 产物的名称或功能、基因座位的名称以及和该序列最初的公布之间的联系(它因何被测 序?)构成了序列记录的直接的确切涵义 本章的内容是提交DNA序列及其注解到公共数据库,重点介绍了与国际核苷酸序列协作数据 库:DDBJ、EMBL和 Gen Bank密切相关的核苷酸序列数据库

4.1 信息产业的含义及其演变 4.2 信息产业在国民经济中的地位与作用 4.3 信息产业的特征与发展规律

对生物芯片作了简要介绍，从生物芯片的分类、基本原理、应用和数据的处理与分析几个角度学习生物芯片有关的基本知识

介绍了分子系统发生分析的基本内容，几种分子进化模型。重点学习分子系统树的构建方法，最后介绍分子系统发生树的分析软件

第1章 生物信息学引论 第2章 生物学基础 第3章 生物信息学资源与数据挖掘工具 第四章 序列分析 第五章 序列比对 第6章 分子系统发生分析 第7章 生物芯片 第8章 后基因组时代的生物信息学

第一节 统计学习与推理基础 第二节 统计模型与参数推断 第三节 聚类分析、主成分分析与Fisher判别 第四节 贝叶斯推理 第五节 隐马尔可夫模型 第六节 动态神经网络 第七节 深度学习 第八节 支持向量机 第九节 MATLAB的应用实例

第一节 基因组学概述 第二节 蛋白质编码基因的注释 第三节 RNA基因的注释 第四节 重复序列的注释 第五节 假基因的注释 第六节 案例分析：黄瓜基因组的注释

什么是生物信息学？ 生物信息在哪儿？ 细胞 分子 存贮、复制、传递和表达 遗传信息的系统 生物信息的载体 DNA RNA Protein Phenotype 生物信息学的发展背景 生物信息学的研究内容 我校生物信息学的平台简介

成绩 一、不安排考试 二、每次实验课布置实验报告,共6次作业。 三、期末交一篇综述。 四、期评成绩:作业占60%,综述40%。 五、作业交至我的邮箱

(1) Multiple sequence alignment and progressive global alignment (ClustalW) (2) Find and model local multiple alignment (3) How to evaluate the quality of a PSSM?