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生物信息数据分析技能培训:计算机基础技能培训(linux基础知识)
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一、 生物信息的传递
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疾病对人类的健康和生存构成重大威胁,是世界各国面临的最重要的社会问 题之一。当前和今后相当长的时期内药物将是疾病治疗的最主要手段,但由于历 史、经济及观念等原因,与发达国家相比我国在药学相关基础研究,特别是创新 药物的的基础研究和开发领域比较落后,导致医药产业基础较差,药品来源长期 依赖于仿制和进口,每年进口药品达 40 亿美元以上。在中国加入 WTO 以后, 一方面,由于知识产权保护的限制,药品仿制不可能再成为我国医药产业的中长 期目标;另一方面,由于成员国之间的低关税,国外药品将会更多地进入中国市 场。这不仅严重影响到我国人民的用药和健康问题,同时也将威胁我国医药产业 的生存和发展,进而影响我国医药产业对国民经济的贡献度
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2005年贵州大学家畜生理学硕士研究生入学统一考试 理论课考试大纲 第一部分考试说明 一、考试性质 全国硕士研究生入学考试是为高等学校招收硕士研究生而设置的,由招生单位自主命 题进行考试。其评价标准是高等学校优秀本科生能达到的及格或及格以上水平,以保证被 录取者具有较好的业务素质,利于硕士招生专业择优选拨。 二、考试的范围 考试的范围包括:细胞生物信息的传递、血液及循环、呼吸、消化、能量代谢、排 泄、肌肉、神经系统、内分泌和生殖泌乳等十部分组成
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2.1本章简介 本章介绍因特网(Internet)和万维网(《ntemctWorIdWidcWcbWWW,《,简称www),介绍世界各国生物信息中心和服务机构。因特网的诞生,国际生物信息中心的建立,大大推动了生物信息学革命。基于因特网的浏览器的出现,为生物信息资源的开发和应用提供了有效途径。本章将简单介绍浏览器和通过浏览器进行数据库查询的方法,并给出一些重要生物信息中心的网址
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第一节 生物信息学编程概述(生物技术与信息技术融合) 第二节 Linux系统及编程语言简介(生物问题 → 信息表示) 第四节 数据库开发基础(生物数据/知识图谱 → 数据再利用) 第三节 数据分析流程搭建(生物数据 → 知识发现)
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近年来大量生物学实验的数据积累,形成了当前数以百计的生物信息数据库。它们各自按一定的目标 收集和整理生物学实验数据,并提供相关的数据查询、数据处理的服务。随着因特网的普及,这些数据库 大多可以通过网络来访问,或者通过网络下载。 一般而言,这些生物信息数据库可以分为一级数据库和二级数据库。一级数据库的数据都直接来源于实验 获得的原始数据,只经过简单的归类整理和注释二级数据库是在一级数据库
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第一节 生物数据库简介 第二节 国际主要数据中心 第三节 代表性生物数据库 第四节 生物数据库发展趋势
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第一节 生物信息学的基本概念 第二节 生物信息学的发展历史与趋势 第三节 生物信息学的研究领域 第四节 生物信息学的算法基础 第五节 生物信息学的机遇与挑战
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1.1本章简介 本章旨在介绍生物信息学的基本概念,指出它在现代生物学中的重要地位。首先,我们 将简要回顾生物信息学发展的几个历史阶段,从早期的蛋白质手工测序,到今天的DNA自 动测序。读完本章,你将会发现,DNA测序自动化引起的生物信息爆炸,使生物大分子序 列数据库的数据量急剧增长,而蛋白质结构测定的速度远不能与之相比。因此,从序列信息 直接推断其可能的生物学功能就显得十分必要。本章还将简述蛋白质结构预测的现状,从蛋 白质一级结构中各种氨基酸所包含的折叠信息入手,重点说明蛋白质三级结构预测的意义, 并指出分子伴侣的本质及其在蛋白质折叠过程中的作用
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