第十 动物基圆组学 (Animal Genomics)
动物基因组学 （Animal Genomics） 第十一章
生戛內容 第一节人类基因组计划 第二节比较基因组与功能基因组 第三节生物信息学 第四节表观遗传学 第五节分子遗传标记
主要内容 第一节 人类基因组计划 第二节 比较基因组与功能基因组 第三节 生物信息学 第四节 表观遗传学 第五节 分子遗传标记
人类基因组计 ( Human Genome Project)
第一节 人类基因组计划 （Human Genome Project）
人类基因组计划(1) 1990年多国合作小组启动,2001年在 Nature上公布 结果; Craig Venter博土采用 散弹法于 Science上发表 结果。 *人基因组测序的完成 可与人类登月媲美。 Dr Craig Venter
人类基因组计划（1） * 1990年多国合作小组启动，2001年在Nature上公布 结果； * Craig Venter博士采用 散弹法于Science上发表 结果。 * 人基因组测序的完成 可与人类登月媲美
人类基因组计划(2) *耗时10载,耗费20余亿美圆; *基因组大小30亿碱基; *1%为外显子,9%为内含子和重复序列; *表达蛋白质的基因组数量约为3万; *约含100万个SNP标记
人类基因组计划（2） * 耗时10载，耗费20余亿美圆； * 基因组大小30亿碱基； * 1%为外显子，99%为内含子和重复序列； * 表达蛋白质的基因组数量约为3万； * 约含100万个SNP标记
序列突方法1 AB C DE 全基因组鸟枪法: 在一定作图信息基础 A 上,绕过大片段连续 克隆系的构建而直接 将基因组分解成小片 段随机测序,利用超 级计算机进行组装 4 (美国 Celera公司) A B C DE
序列测定方法 1 全基因组鸟枪法： 在一定作图信息基础 上，绕过大片段连续 克隆系的构建而直接 将基因组分解成小片 段随机测序，利用超 级计算机进行组装 （美国Celera公司）
序列测突方法2 AGTACTGGGATC AGTACTGGGATC wnsw wa OBer CheckADAPTED FROM FIGURES PROVIDED BY E. GREEN NATIONAL HUMAN GENOME RESEARCH INSTITUTE
序列测定方法 2
人类基圆组计的义 Genomics to society Genomics to health Genomics to biology Human Genome Project 图2基因组学的未来建立在人类基因组计划的基础上
人类基因组计划的意义
基因组大小的比教(1) 200 Telephone books Model Organism Genomes (1000 pages each) Drosophila E coli (bacterium) 300 pages ast chromosome 3
基因组大小的比较（1）
基因组大小的比(2) 种群 物种 基因组尺于 (百万对) 基因数 序列测 原核生物 支原体 0.58 47O 1995 mycoplasma 大肠杆菌 4.6 4,300 1997 绿脓杆菌 Pseudomonas 5,500 2001 aerugIn念a 真核生物 酿酒酵母 (单细胞 12 1996 s. cerevisiae 6,200 裂变酵 14 S. pomi 4,900 2001 幽螺杆菌 pylorl 多细胞 线虫C.e1 egans 100 400 1998 果虹 drosophia1a 13,600 2000 脊椎动物 阵风鱼 400 30,000 ? Fugu rubripes 3,00040,000? 2003 3,30o 2007 植物 拟南界 125 25,000 2000 grabldopsls 56o 2005 5 30,0002 ? 17,000
基因组大小的比较（2）