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第一节 转录组学概述 第二节 试验设计和测序流程 第三节 转录组数据核心分析 第四节 功能分析 第五节 RNA-seq数据分析案例
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第一节 蛋白质编码基因的注释 第二节 RNA基因的注释 第三节 重复序列的注释 第四节 假基因的注释 第五节 案例分析:黄瓜基因组的注释
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第一节 转录组学概述 第二节 试验设计和测序流程 第三节 转录组数据核心分析 第四节 功能分析 第五节 RNA-seq数据分析案例
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第一章 生物信息学的概念及发展历史 第二章 生物学数据库及其检索 第三章 序列比对原理 第四章 蛋白质结构预测与分析 第五章 基因组学 第六章 转录组学 第七章 非编码RNA 第八章 蛋白质组学 第九章 系统生物学 第十章 合成生物学 第十一章 分子进化与系统发育 第十二章 统计学习与推理 第十三章 生物信息学编程基础 第十四章 新一代测序技术及其应用
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一、核酸制备的基本原理 二、核酸制备的基本方法 三、质粒DNA的制备 四、基因组DNA的制备 五、RNA的制备 六、基因组、cDNA文库的构建
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实验一 细菌感受态的制备和质粒的转化 实验二 碱变性法提取质粒 DNA 实验三 水平式琼脂糖凝胶电泳法检测 DNA 实验四 DNA 的限制性内切酶酶切 实验五 DNA 的回收与连接 实验六 基因的 PCR 扩增 实验七 用温度敏感型启动子表达系统表达目的基因 实验八 基因组合生物合成新化合物 实验九 药用甘草片中甘草酸含量的分析及其质量评价 实验十 牛奶中酪蛋白和乳蛋白素粗品的制备 实验十一 固定化细胞法生产 L-天冬氨酸和 L-丙氨 实验十二 重组水蛭素Ⅲ的制备 实验十三 酸醇提取法制备猪胰岛素 实验十四 多肽缩宫素的 Fmoc 固相合成 实验十五 酵母 RNA 的制备和单核苷酸的离子交换柱层析分析 实验十六 单核苷酸衍生物制备 实验十七 胰弹性蛋白酶的制备及活力测定 实验十八 超氧化物歧化酶的分离纯化 实验十九 重组门冬酰胺酶Ⅱ的纯化与分析
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第一节 原核基因表达的调控 1. 原核生物基因表达调控的要点; 2. 操纵子学说的主要内容; 3. 乳糖操纵子的发现及其意义; 4. 乳糖操纵子的主要调控方式。 第二节 真核生物基因表达的调控 原核生物基因表达调控的要点; ◼ 一、DNA重排 ◼ 二、转录水平的调控 ◼ 三、翻译水平的调控 真核生物基因表达的调控 一、 DNA水平的调控 二、染色质水平调控 三、转录水平的调控 四、翻译水平的调控 (一) mRNA运输 (二)mRNA翻译的控制 (三)mRNA的结构 (四)选择性翻译 (五)反义RNA (六)蛋白质的加工
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第一节 DNA作为主要遗传物质的证据 第二节 核酸的化学结构 第三节 染色体的分子结构 第四节 DNA复制 第五节 RNA的转录及加工 第六节 遗传密码与蛋白质的翻译
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一、转录组测序简介 二、基因注释和注释库简介 三、转录组测序技术方法及数据分析 表达序列标签(EST) 基因表达系列分析(SAGE) 新一代高通量测序技术(RNA-seq)
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•第一节 糖类化学 carbohydrates •第二节 脂类化学 •脂肪(真脂):甘油三酯(三酯酰甘油) •类脂 磷脂:含磷酸及有机碱的脂类 糖脂:含糖及有机碱的脂类 •类固醇 胆固醇及其酯 胆汁酸 类固醇激素 •脂类 (lipides) •第三节 氨基酸、多肽与蛋白质化学 •第四节 核酸化学 • DNA 遗传的物质基础 • 核酸 mRNA 作为Pr合成模板 • RNA tRNA 转运AA • rRNA 作为Pr合成场所
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