(1. 鞍山科技大学 理学院, 辽宁 鞍山 114044; 2. 武汉大学 数学与统计学院, 湖北 武汉 430072) 摘 要: 分子生物学中基因无方向的反转基因组重排问题在数学上已被证明是一个 N P2难问题. 目前, 较好 的算法是 Ch ristie (2001) 的 3ö22近似算法. 本文给出一种适合于计算基因无方向的反转基因组重排问题的模 拟退火算法, 定义了解的邻域结构. 数据实验的结果表明该算法性能优于 3ö22近似算法

1) 突变 2) 重组 3) 转座 1) 遗传系统的产生 2) 基因组进化的模式

1) 什么是表观遗传 2) 表观遗传现象 3) 表观遗传机制 位置效应 副突变 甲基化 基因组印记 染色质重建 剂量补偿

第一节 原核基因组 一、病毒基因组 二、细菌基因组 第二节 真核基因组 一、基因组大小 二、真核基因组结构组织特征 三、基因组计划及其意义 第三节 基因重组和基因移动 一、基因重组 二、基因移动

 突变  重组  转座

基因组是相对稳定的，基因组中的序列通常处于恒定的位置。因此，我们可以通过构建遗传图谱(genetic map)来鉴定已知基因的基因座。在分子水平上，每个个体基因组之间的差异主要由重组引起，但转座元件（transposable element）或转座子（transposons）的存在也可以造成基因组的改变

1 基因组序列特征分析  碱基组成分析  序列模体分析  密码子使用偏嗜性分析  重复序列分析  限制性酶切位点分析  基因识别 2 基因功能分析 3 基因组比较 基因组比较  基因组比较：将一个基因组（全部序列、预测的所有基因或蛋白质）与其自身（物种内）或其它的基因组（物种间）进行比较。  对不同物种的基因组进行比较分析，帮助我们理解基因组间的相似性、基因组的进化及其基因的进化历程 基因组内比较 vs 基因组间比较

一、基因组进化的分子基础 二、基因组的进化模式 The mode of Genome evolution I. The Origin of Genome II. The Origin of New Genes III. The Evolution of New Genes 基因组进化的分子基础 突变（mutation） 重组（recombination) 转座(transposition) III. 新基因的进化（Evolution of new genes ）

真核生物的基因组（重点） 真核生物基因表达调控的特点和种类（熟悉） 真核生物DNA水平上的基因表达调控（重点） 真核生物转录水平上的基因表达调控（重点） 真核生物其他水平上的基因表达调控（熟悉）

3、基因重组 基因重组(gene recombination)是两个独立基因组内 的遗传基因,通过交换与重新组合形成新的稳定基因组 的过程。 原核微生物基因组通常只是部分遗传物质的转移和重 组,并且通过转化、接合和转导等形式进行; 真核微生物的基因重组发生在有性繁殖过程中,通过 减数分裂后整套染色体发生高频率交换(基因重组) 在真核微生物中的部分真菌存在不通过减数分裂而在有 丝分裂过程产生低频率基因重组的准性生殖方式