第一节 分子进化与系统发育 第二节 分子系统发育树的构建方法 第三节 系统发育树构建及应用

第一节 分子进化与系统发育 第二节 分子系统发育树的构建方法 第三节 系统发育树构建及应用

第一节 分子进化与系统发育 第二节 分子系统发育树的构建方法 第三节 系统发育树构建及应用

系统发育学研究的是进化关系,系统发育分析就是要推断或者评估这些进化关系。通过系统 发育分析所推断出来的进化关系一般用分枝图表(进化树)来描述,这个进化树就描述了同 一谱系的进化关系,包括了分子进化(因树)、物种进化以及分子进化和物种进化的综 合。因为 cl ade这个词(拥有共同祖先的同一谱系)在希腊文中的本意是分支,所以系统 发育学有时被称为遗传分类学(cl adi sti cs)。在现代系统发育学研究中,研究的重点已经不 再是生物的形态学特征或者其他特性,而是生物大分子尤其是序列

• 了解分子进化及系统发育分析 • 掌握多序列比对方法 • 熟悉系统发育树建立方法 • 掌握用Mega软件进行构建系统发育树

生物分类的二种基本原则： （a）根据表型(phenetic)特征的相似程度分群归类，这种表型分类重在应用，不涉及生物进化或不以反映生物亲缘关系为目标； （b）按照生物系统发育相关性水平来分群归类，其目标是探寻各种生物之间的进化关系，建立反映生物系统发育的分类系统

14.1 Enrichment and Isolation 14.2 Isolation 14.3 General Staining Methods 14.4 Phylogenetic staining using FISH 系统发育学染色: FISH技术 14.5 PCR Methods of Microbial Community Analysis 14.6 Microarrays and Microbial Diversity: Phylochips 系统发育学微阵列（芯片） 14.7 Environmental Genomics and Related Methods

系统发生(或种系发生、系统发育,phylogeny是指生物形成或进化的历史。系统发 生学(phylogenetics)研究物种之间的进化关系,其基本思想是比较物种的特征,并认为特征 相似的物种在遗传学上接近

第14章植物的进化和系统发育 第一节植物进化的证据 一、化石证据 二、比较解剖学证据

植物分类学( Taxonomy)作为一门独立的科学大约始于17世纪,林奈发 表〈〈植物种志》〉(1753年) 按斯特斯(A. Stace)的观点:植物分类学发展历史大致经过如下几个时 期:古代分类时期一草本学时期一林奈的性系统时期——自然系统时期 系统发育时期—一当代表型性系统时期,后四个时期是近代植物分类的内容