基因表达调控 reguLation of gene expression 刘新文 北京大学医学部生物化学与分子生物学系
北京大学医学部生物化学与分子生物学系
第一节概述 、基因表达的概念 1、基因(gene):从遗传学讲,基因就是遗传的基 本单位或单元,具有编码RNA或多数情况下编码多肽功 能的信息单位。从分子生物学看,基因是负载特定遗 传信息的DNA分子片段 2、基因表达( gene expression):基因表达就是基 因转录及翻译的过程。在一定调节机制控制下,大多 数基因经历基因激活、转录及翻译等过程,产生具有 特异生物学功能的蛋白质分子,赋予细胞或个体一定 的功能或形态表型;rRNA、tRNA编码基因转录生成相 应RNA的过程也属于基因表达
第一节 概述 一、基因表达的概念 1、基因(gene):从遗传学讲,基因就是遗传的基 本单位或单元,具有编码RNA或多数情况下编码多肽功 能的信息单位。从分子生物学看,基因是负载特定遗 传信息的DNA分子片段 2、基因表达(gene expression):基因表达就是基 因转录及翻译的过程。在一定调节机制控制下,大多 数基因经历基因激活、转录及翻译等过程,产生具有 特异生物学功能的蛋白质分子,赋予细胞或个体一定 的功能或形态表型;rRNA、tRNA编码基因转录生成相 应RNA的过程也属于基因表达
基因表达的规律(特点)及方式 1、基因表达的规律(特点):时、空特异 1.1时间特异性( temporal specificity,阶段特异 性 stage specificity):按功能需要,某一特定基因 的表达严格按特定的时间顺序发生。多细胞生物基因表 达的时间特异性又称阶段特异性 1.2空间特异性( special specificity,细胞或组 织特异性( tissue specificity):在个体生长全过 程,某种基因产物按不同组织空间顺序出现
二、基因表达的规律(特点)及方式 1、基因表达的规律(特点):时、空特异 1.1 时间特异性(temporal specificity,阶段特异 性stage specificity):按功能需要,某一特定基因 的表达严格按特定的时间顺序发生。多细胞生物基因表 达的时间特异性又称阶段特异性 1.2 空间特异性(special specificity,细胞或组 织特异性(tissue specificity):在个体生长全过 程,某种基因产物按不同组织空间顺序出现
2、基因表达的方式 2.1组成性表达( constitutive gene expression) 管家基因( housekeeping gene):在生物个体的几乎 所有细胞中持续表达,其表达产物对生命全过程都是必 需的或必不可少的基因 组成性基因表达(基本的基因表达):管家基因的表 达,它只受启动子与RNA聚合酶相互作用的影响 2.2诱导( induction)和阻遏 (repression)表达 ≯诱导:在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活, 基因表达产物增加,该现象称为诱导。相应基因称为可 诱导的基因
2、基因表达的方式 2.1 组成性表达(constitutive gene expression) Ø管家基因(housekeeping gene) :在生物个体的几乎 所有细胞中持续表达,其表达产物对生命全过程都是必 需的或必不可少的基因 Ø组成性基因表达(基本的基因表达):管家基因的表 达,它只受启动子与RNA聚合酶相互作用的影响 2.2 诱导(induction)和阻遏(repression)表达 Ø诱导:在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活, 基因表达产物增加,该现象称为诱导。相应基因称为可 诱导的基因
>阻遏:基因对环境信号应答时被抑制,这种基因称 为可阻遏的基因。可阻遏基因表达产物降低的过程称 为阻遏 可诱导或可阻遏基因除受启动序列或启动子与RNA聚 合酶相互作用的影响外,尚受其它机制调节(如:增 强子) 2.3协调调节( coordinate regulation) >在一定机制控制下,机能上相关的一组基因,无论 其为何种表达方式,均需协调一致、共同表达,即为 协调表达。这种调节称为协调调节
Ø 阻遏:基因对环境信号应答时被抑制,这种基因称 为可阻遏的基因。可阻遏基因表达产物降低的过程称 为阻遏 Ø可诱导或可阻遏基因除受启动序列或启动子与RNA聚 合酶相互作用的影响外,尚受其它机制调节(如:增 强子) 2.3 协调调节(coordinate regulation) Ø在一定机制控制下,机能上相关的一组基因,无论 其为何种表达方式,均需协调一致、共同表达,即为 协调表达。这种调节称为协调调节
原核生物、真核生物基因表达调控的意义 1、适应环境、维持生长和增殖 2、维持个体发育与分化题 四、基因表达调控的基本原理 、基因表达的多级调控:基因结构活化、转录起始、 转录后加工及载运、翻译及翻译后加工,等魯 转录起始是基因表达的基本控制点 2、基因转录激活调节的基本要素(调控体系) 2.1特异DNA序列:操纵子(原核)、顺式作用元件 (真核)
三、原核生物、真核生物基因表达调控的意义 1、适应环境、维持生长和增殖 2、维持个体发育与分化 四、基因表达调控的基本原理 1、基因表达的多级调控:基因结构活化、转录起始、 转录后加工及载运、翻译及翻译后加工,等 Ø 转录起始是基因表达的基本控制点 2、基因转录激活调节的基本要素(调控体系) 2.1 特异DNA序列:操纵子(原核)、顺式作用元件 (真核)
>操丛子( (operator):原核生物中由2个以上的编码序 列与启动序列、操纵序列以及其它调节序列在基因组 中成簇串联组成的基因调控单位 >顺式作用元件(ci- acting element):可影响自身基 因表达活性的DNA序列。包括启动子、增强子及沉默子 等 2.2调节蛋白 原核:特异因子、阻遏蛋白和激活蛋白 ≯真核:转录因子(主要为反式作用因子) 原核基因调节蛋白都是一些DNA结合蛋白 阻遏蛋白介导的负性调节机制在原核生物普遍存在
Ø 操丛子(operator):原核生物中由2个以上的编码序 列与启动序列、操纵序列以及其它调节序列在基因组 中成簇串联组成的基因调控单位 Ø 顺式作用元件(cis-acting element):可影响自身基 因表达活性的DNA序列。包括启动子、增强子及沉默子 等 2.2 调节蛋白 Ø原核基因调节蛋白都是一些DNA结合蛋白 Ø阻遏蛋白介导的负性调节机制在原核生物普遍存在 Ø 原核:特异因子、阻遏蛋白和激活蛋白 Ø 真核:转录因子(主要为反式作用因子)
反式作用因子( trans acting factor):某一基因的 编码产物,与其它基因的调节序列结合,调节其它基 因的表达活性。大多数反式作用因子是DN结合蛋白 ≯正性调节机制在真核生物普遍存在 3、转录调节的作用机理(基本形式):DNA-蛋白质 蛋白质-蛋白质相互作用、RNA聚合酶活性调节 3.1DNA-蛋白质相互作用:反式调节因子与顺式作用 元件之间的特异识别及结合 ≯这种结合通常是非共价结合 多数调节蛋白结合DNA前需通过蛋白质-蛋白质相互作 用形成二聚体或多聚体
Ø正性调节机制在真核生物普遍存在 Ø 反式作用因子(trans-acting factor):某一基因的 编码产物,与其它基因的调节序列结合,调节其它基 因的表达活性。大多数反式作用因子是DNA结合蛋白 3、转录调节的作用机理(基本形式):DNA-蛋白质、 蛋白质-蛋白质相互作用、RNA聚合酶活性调节 3.1 DNA-蛋白质相互作用:反式调节因子与顺式作用 元件之间的特异识别及结合 Ø这种结合通常是非共价结合 Ø多数调节蛋白结合DNA前需通过蛋白质-蛋白质相互作 用形成二聚体或多聚体
3.2蛋白质-蛋白质相互作用:二聚体是调节蛋白结 合DNA时最常见的形式,杂二聚体比同二聚体具更强的 DNA结合能力 3.3RNA聚合酶:转录激活调节最终由RNA聚合酶活 性体现 五、原核与真核基因表达调控的区别 1、真核基因与原核基因的结构特点 真核细胞基因组非常复杂:结构庞大、重复序列、不 连续性、单顺反子(一个编码基因转录、翻译生成 条多肽链)
3.2 蛋白质-蛋白质相互作用:二聚体是调节蛋白结 合DNA时最常见的形式,杂二聚体比同二聚体具更强的 DNA结合能力 3.3 RNA聚合酶:转录激活调节最终由RNA聚合酶活 性体现 五、原核与真核基因表达调控的区别 1、真核基因与原核基因的结构特点 Ø真核细胞基因组非常复杂:结构庞大、重复序列、不 连续性、单顺反子(一个编码基因转录、翻译生成一 条多肽链)
2、原核基因表达调控特点 σ因子决定RNA聚合酶识别特异性 操纵子(元)模型的普遍性:多顺反子转录,通过调 控单个启动基因的活性来完成协调表达 一>阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性:负性调节占主导 3、真核基因表达调控特点 ≯活性染色体结构变化:对核酸酶高度敏感、拓扑结 构变化、DNA碱基修饰、组蛋白减少 x正性调节占主导 转录与翻译分隔进行
2、原核基因表达调控特点 Øσ因子决定RNA聚合酶识别特异性 Ø操纵子(元)模型的普遍性:多顺反子转录,通过调 控单个启动基因的活性来完成协调表达 Ø阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性:负性调节占主导 3、真核基因表达调控特点 Ø活性染色体结构变化:对核酸酶高度敏感、拓扑结 构变化、DNA碱基修饰、组蛋白减少 Ø正性调节占主导 Ø转录与翻译分隔进行