复旦大学上海医学院 2009~2010学年第二学期期末考试试卷 课程名称:医学文献检索与利用课程代码:MED130046.02 开课院系:图书馆文献检索教研室考试形式:课程报告 医学信息检索与利用 综合实习报告 (临床医学八年制、基础医学版) 检索题目(中英文) HIF在肿瘤侵袭转移中作用的研究进展 Advances in the Research on the Effect of Hypoxia-incudible Factors in Tumor Invasion and Metastasis 1/8
、围绕课题需求,开展信息检索 1.根据检索需求,选择检索工具:列出所选数据库(3种) 2.分析课题,确定检索词和检索语句:编写各种数据库的检索式 3.列出所选数据库检索获得的记录数、各摘录3条相关文献题录 数据库1: PubMed &a*: (Hypoxia-Inducible Factor" [TIAB] OR"HIF"[])AND(Neoplasm Metastasis"[Mesh] OR"Neoplasm Invasiveness"[Mesh])AND ("2008/01/01"[PDAT]:"2008/12/3I"[PDAT]) 检索记录数:63 主要相关文献(3条题录) 1. Du R HIF1 alpha induces the recruitment of bone marrow-deri ved vascular modulatory cells to regulate tumor angiogenesis and invasion. Cancer Cell. 2008;13(3):206-20 2. Rankin EB. The role of hypoxia-inducible factors in tumori genesis. Cell Death Differ. 2008: 15(4): 678-85 3. Gort EH Hypoxic regulation of metastasis via hypoxia-inducible factors Curr Mol Med.2008;8(1):60-7. 数据库2: Web of science 检索式:标题=( HIF OR hypoxia- induc*)AND标题=( metastasis OR migration OR inas米)AND主题=( tumor OR neoplasm OR cancer OR carcinoma) 入库时间=2008.数据库=SCI- EXPANDED 检索记录数:16 主要相关文献(3条题录) 1. Wu H Resveratrol inhibits hypoxia-induced metastasis potential enhancement by restricting hypoxia-induced factor-1 alpha expression in colon carcinoma cells. Biomed Pharmacother. 2008: 62(9): 613-621 2. Helczynska K Hypoxia-inducible factor-2alpha correlates to distant recurrence and poor outcome in invasive breast cancer. Cancer Res. 2008:68(22):9212-9220. 3. Yang MH. Direct regulation of TWIST by HIF-lalpha promotes metastasis Nat Cell Biol.2008;10(3):295-305 2/8
数据库3:中国知网期刊全文数据库 检索式:(摘要HIF+缺氧诱导因子+低氧诱导因子)and(题名=侵袭+转移)and(主 题=癌+肿瘤)时间限制:2008,精确匹配,全部期刊 检索记录数:9 主要相关文献(3条题录): 1.王洪远.C0X-2、TGF-B1和HIF-1a表达与乳腺癌侵袭转移的关系[J.临床肿 瘤学杂志.2008;(5):417-420 2刘欣乏氧诱导因子1与肿瘤转移研究进展[J].中国肿瘤.2008:17(3):208-210 3.袁彩霞低氧依赖低氧诱导因子-1a增强卵巢癌细胞SKOV3中乙酰肝素酶的表达 及其侵袭力[].中国医学科学院学报.2008:30(6):711-716. 二、分析检索结果,筛选核心资源 1.列出本专业的中外文重要期刊、最新影响因子和收藏处 期刊名称 影响因子(IF) 收藏处 1. Nature Reviews Cancer 9.538 中国人民解放军医学图书馆 2. Journal of the National 14.069 复旦大学医科馆 Cancer Institute 3.中华肿瘤杂志 0.998 复旦大学医科馆 4.癌症 0.835 复旦大学医科馆 注:本人通过JCR检索到外文期刊的IF为2009年最新影响因子,而通过 Exlibris中外文核 心期刊查询系统检索到中文期刊的IF为2008年版影响因子。 2.列出本专业重要网络信息如重要网站(1-3个)、免费电子期刊网 站(1-2个)等 重要网站: (1)美国国立癌症研究所(NCI) http://www.cancer.gov (2)美国癌症研究会(ACR) http://www.aacr.org (3)中国抗癌协会 http://www.caca.org.cn 兔费电子期刊: (1)natueRRevIewsCancEr:http://www.nature.com/nrc/index.html (2)canceRCelL:http://www.sciencedirect.com/science/journal/15356108
、回顾检索过程,总结检索方法 1.表述相关文献获取的方法,主要思路和线索 (一)课题的确立 (1)课题方向的选择: 登陆国家自然科学基金委员会网站hp://www.nsfc,g0v,cn/,在“2010年 项目指南”中了解到在本年度医学科学部的16个重点项目中,肿瘤学方面的研究 占到了3个,可见国家对肿瘤这一人类健康的头号杀手之重视。而肿瘤学恰为本 人感兴趣的研究方向,故决定选择肿瘤学方向的课题。近年来的研究表明,仅以 肿瘤细胞为中心的研究已远不能够帮助人们全面认识肿瘤的临床进程,2004年和 2007年,NCI(美国国立癌症研究所)相继发布了关于肿瘤微环境方面研究的项目 指南,并将其确定为肿瘤学三大主要研究方向。“微环境在肿瘤转移复发中的作 用”又恰为NSFC本年度重点立项的领域。故本人初步将课题方向定为“肿瘤微环 境在肿瘤转移中的作用”,以通过检索最新研究成果,对此课题进行一定了解 (2)背景知识的获取: 通过读秀知识库、查阅教科书 Raymond E. Lenhard的上海科学技术出版社200 年版《临床肿瘤学》和陈正堂主编的中国协和医科大学出版社2000年版《临床肿 瘤学概论》,熟悉课题的背景知识,明确肿瘤进程的主要阶段、微环境的概念及具 体内容(如各种分泌因子、蛋白、P、氧化还原状态等)、相关名词术语书写以及 著名的专家学者。 (3)课题的细化及确定: 通过査找、阅读综述文献,如樊嘉.肿瘤微环境的研究动态与展望.中华医 学杂志.2008:88)505-507.、 Hede K. Environmental protection: studies highlight importance of tumor microenvironment [J]. J Natl Cancer Inst,2004,96(15):110-121.等,了解到近年来国内外肿瘤微环境的研究方向, 其中关于在肿瘤缺氧微环境中处于高表达状态的HF因子研究较多,它与肿瘤的恶 性程度极其相关,对肿瘤血管生成、肿瘤侵袭、转移都起着重要作用,并可能成 为肿瘤治疗的新靶点。故本人将课题修改为“HIF在肿瘤转移中的作用”。 利用CNKI、万方、CBM、 PubMed、 Web of science等多个数据库进行预检索, 发现2008年度关于HIF在肿瘤转移中作用的文献数量不多,而HIF在肿瘤侵袭中也 有显著作用,且侵袭和转移过程紧密联系,绝大多数论文对两者同时进行研究, 故进一步将题目调整为“HIF在肿瘤侵袭转移中的作用”。 4/8
(二)检索思路与过程 (1)外文数据库: ① PubMed的选择及检索: PubMed具有期刊收录范围广、数据更新快、覆盖内容全、检索途径多、检索 体系完备等特点,且 MeSH Database提供的规范化主题词功能可以有效提高文献 查全查准,是本人首选的外文数据库 首先使用MeSH查到规范主题词: Hypoxia- .Inducible Factor、 Neoplasm Metastasis、 Neoplasm Invasiveness,并将其全部作为MeSH字段检索,得到结 果231篇,数量过多,故需要加以限制从而提高文献相关度。经过添加检索词HIF 调整检索字段(如将HF和 Hypoxia-Inducible Factor作为标题、文摘、标题及 文摘、关键词等分别检索)后,检索式:(" Neoplasm Metastasis" [Mesh]OR Neoplasm Invasiveness"[Mesh)AND("Hypoxia-Inducible Factor" [TIAB] OR "HIF"[TIAB])AND("2008/01/01"[PDAT]:"2012/31"[PDAT])得到63篇文献, 数量合适。本人浏览文献标题后认为检索结果与课题有较高相关度,故将其定为 最终检索式。 ② Web of Science的选择及检索: 由于之前的 PubMed已经包含了0vid中的 MEDLINE数据库,且 Web of Knowledge 功能齐全,是研究人员进行文献检索、数据分析、信息管理不可或缺的核心数据 库集合,其强大的引文功能为后面的引文检索提供了便利,故本人经比较后在两 者中选择了 Web of Knowledge中影响最大、使用最多的 Web of science数据库。 由于使用自由词检索,为提高文献的查准度和查全度,本人将主要检索词HIF 作为标题字段,并添加了 migration作为 metastasis的同义词。鉴于本人在预检 索中看到有相关文章标题中含有 hy poxia- induced/ hypoxia- inducing vasion/ invasi veness等,故使用了截词符以查全文献,并以( tumor OR neoplasm OR cancer OR carcinoma)作为主题字段加以限制,以提高相关度。经多次调整 比较检索词、检索字段及其对应检索结果,最终将检索式定为:标题=(HFOR hypoxia- induc*)AND标题=( metastasis OR migration OR inas*)AND主题 ( umor OR neoplasm OR cancer OR carcinoma)入库时间=2006经检查,其中检 索到的16篇文献均与课题高度相关。 5/8
(2)中文数据库 ①数据库的比较与选择 检索国内的生物医学文献,首选的数据库为CBM。利用CBM主题检索查找HIF 肿瘤、侵袭、转移的主题词及其下位词,以提高文献的查全和查准,并在CBM中利 用主题词进行相关检索,得到发现命中文献数量太少(检索式:主题词:缺氧诱导 因子1/全部树/全部副主题词;检索记录数:9,且其中与肿瘤转移相关的文献更 利用CBM中查到的主题词分别在万方数据资源系统和中文科技期刊数据库中 检索,调整检索词和检索字段,发现检索记录数仍然不多,且检索结果中有不相 关的内容。 相比之下,中国知网期刊全文数据库作为国内大型的全文数据库,有较多的 命中文献,故将其作为检索该课题的中文数据库。 ②CNKI的检索 由于学习了逻辑表达式编写方法,本人使用专业检索以求得检索精确性。通 过不断调整检索字段和检索词,最终将检索式定为:(摘要=HIF+缺氧诱导因子+低 氧诱导因子)and(题名=转移+侵袭) 具体过程摘录: 1)通过CBM主体词结构树了解到,肿瘤形成过程包括间变、细胞转化、侵润 转移、消退等许多内容,仅2008年即有大量文献发表,而本课题研究肿瘤侵袭、 转移的影响因素,故为了提高检索结果相关度,本人在预检索后决定始终将“侵 袭”、“转移”作为篇名字段。 2)将“HIF”作为篇名检索字段,“癌”、“肿瘤”作为主题字段限制文献内容 得到检索结果为6篇。数量太少,须放宽检索限制,以获得更多的文献资料。 3)添加“HIF”的中文同义词“缺氧诱导因子”、“低氧诱导因子”,并将三者 作为主题词:去掉“癌”、“肿瘤”的主题限制,得到13条检索记录。虽然数目合 适,但其中出现了非肿瘤方面研究的检索结果,须继续调整检索式,以得到更高 相关性的结果。 4)检索式:(摘要=IF+缺氧诱导因子+低氧诱导因子)and(题名=转移+侵袭), 检索记录数:11。文章数量不多,但其中仍有相关度不大的文献 5)在篇名字段中加入肿瘤侵袭、转移的同义词“侵润”、“复发”等,未发现 有新的检索结果纳入。故仍然保持“侵袭+转移”作为检索字段。 6)添加限制(主题=癌+肿瘤),得到9篇检索结果,数量虽不多、但均与检索 课题高度相关,故最终定下检索式
2.引文检索和参考文献回溯过程, (1)引文检索: 数据库名称: Web of science 检索式:被引作者=( Gort er.,)AND被引著作=( Curr Mol med)入库时间=2008.数 据库=SCI- EXPANDED. 被引著者、被引文献(1条题录) Gort EH Hypoxic regulation of metastasis via hypoxia-inducible factors Curr Mol med.2008;8(1):60-67 引用著者、引用文献(1条题录): Polyak K Transitions between epithelial and mesenchymal states acquisition of malignant and stem cell traits. Nat Rev Cancer. 2009:9(4):265-273 (2)参考文献回溯: 文献原文(1条题录) 袁彩霞低氧依赖低氧诱导因子1a增强卵巢癌细胞SKoV3中乙酰肝素酶的表达 及其侵袭力门中国医学科学院学报2008,30:711-716 参考文献(1条题录) Lee JW. Hypoxia-inducible factor(HIF-1) alpha: its protein stability and biological functions [J]. Exp Mol Med, 2004, 36(1): 1-12 7/8
