本章将集中介绍生物信息学中生物分子结构的有关内容,并将研究重点放在三维结构实际存 在的氨基酸序列上,力图使读者了解结构数据库记录的内容及如何合理应用各类通用软件程 序处理这类记录。本章不涉及结构生物学家们建立三维分子结构的计算程序,也不讨论相似 蛋白质构象的精细结构。在本章参考书目后列出了一些优秀的讨论蛋白质构象的有关专著和 蛋白质结构决定方法

 第一节 基因组学概念  第二节 基因组图谱  第三节 生物信息学  第四节 基因组的特征和应用  第五节 基因组对生物学研究的影响

• 一、分子生物学数据库简介 • 二、 NCBI 简介 • 三、子数据库，数据格式，数据检索，工具软件

美国国家生物技术信息中心( National Center for biotechnology Information fa] 称NCBI)创建于1988年。 1991年,NCB|开发了 Entrez数据库查询系 统,用于对 Gen Bank等分子生物学和生物 医学文献摘要( Medline)等数据库的査询 ( Schuler et al,1996)

第一节 测序技术概述 第二节 第二代测序原理 第三节 第二代测序技术的应用 第四节 生物信息学在第二代测序中的应用

⚫ 序列的相似性 ⚫ 二重序列比对 ⚫ 多重序列比对 ⚫ DNA片断组装 第一节 序列的相似性 ⚫ 字母表和序列 ⚫ 编辑距离 ⚫ 矩阵作图法 ⚫ 序列的两两比对 ⚫ 打分矩阵 第二节 二重序列比对基本算法

Entrez系统 NCB综合数据库 ·美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, 称NCBI)创建于1988年。 1991年,NCBI开发 Entrez了数据库查询系 统,用于对 GenBank等分子生物学和生物 医学文献摘要(Medline)等数据库的查询 (Schuler et al, 1996)

随着人类基因组计划的实施,通过基因组测序,蛋白质序列测定结构解析等实 验,分子生物学家提供了大量的有关生物分子的原始数据,需要利用现代计算技 术对这些原始数据进行收集、整理、管理以便于检索使用。而为了解释和理解这 些数据,还需要对数据进行比对、分析,建立计算模型,进行仿真、预测与验 证,因而出现生物信息学,它的出现,极大的促进了分子生物学的发展

现代医学的挑战 生物信息学 分子同源性计算

数字信号处理: 是20世纪60年代，随着信息学科和计算机学科 的高速发展而迅速发展起来的一门新兴学科。它 的重要性日益在各个领域的应用中表现出来。 其主要标志是两项重大进展，即快速傅里叶变 换(FFT)算法的提出和数字滤波器设计方法的完善