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根据待选基因相关信息→确定筛选方法和条件 从基因库中筛选、分离基因。 多数方法是利用一段核苷酸序列DNA、cDNA或 寡聚核苷酸)或抗体作探针(Pobe),用放射性同位素或 非放射性同位素标记探针→筛选基因库
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功能性基因的筛选是探索生物进程、研究疾病发生发展和诠释基因功能的重要方法,在生物、医药、新治疗靶点筛选及肿瘤耐药等方面有广泛的应用。文中对CRISPR-cas9技术应用于功能性基因筛选的方法及研究进展进行了综述
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从北京清河筛选出了具有异养能力的一株藻类,经初步鉴定为小球藻.在异养批量培养条件下,研究了不同氮源和碳氮比对筛选小球藻生长的效应.当葡萄糖作为惟一碳源时,硝酸钾和尿素都可以分别作为惟一氮源支持小球藻快速持续生长,而氯化铵作为惟一氮源时因使培养物中的pH快速降低而抑制了小球藻的进一步生长.当葡萄糖和硝酸钾分别作为小球藻生长的惟一碳源和氮源时,在碳氮质量比从5到20范围内,小球藻的生长随碳氮质量比的升高而明显增加,最大OD680nm达到了73.8
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针对特定水处理工艺,研究了投加2-MIB前后水中微生物种群的变化,建立了筛选分离2-MIB降解菌的方法.以生物膜生长成熟的活性炭连续处理含有较高浓度2-MIB水样,然后从活性炭表面取样,用2-MIB为惟一碳源的无机盐培养基筛选和驯养,最后进行划线分离,成功得到2-MIB降解菌种.通过16SrRNA分析,该菌株属于假单胞菌属(Pseudomonas spp.)
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筛选途径需要解决的基本问题 I. 结构多样性(Diversity) II. 转化医学(Translational Medicine, from bench to bedside) 合成化合物的筛选 组合化学、多样性导向合成及片段库 转化医学 (Translational Medicine, from bench to bedside, from bed to bench) Neoclassic drug discovery 新经典药物发现 —— Phenotypic Screening
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3.1蛋白质表达系统 3.1.1 E. coli蛋白表达系统 3.1.2哺乳动物表达系统 3.1.3昆虫表达系统 3.1.4硒代蛋白表达 3.2蛋白纯化技术 3.2.1 AKTA使用规则及使用实例 3.2.2蛋白纯化柱子的介绍及清洁方法 3.2.3透析袋的使用 3.2.4浓缩管的使用 3.2.5 TEV蛋白酶的使用 3.2.6金属螯合层析 3.2.7分子筛 3.2.8疏水作用层析 3.2.9离子交换层析 3.2.10 Protein A/G 纯化抗体 3.2.11谷胱甘肽转移酶 (GST) 亲和层析 3.2.12 Fab的蛋白表达 3.2.13植物种子蛋白的提取方案 3.2.14包涵体复性 3.2.15 SDS-PAGE凝胶电泳 3.2.16 GraphPad Prism软件的使用 3.3筛选与蛋白互作的分子 3.3.1酵母双杂交技术从文库中筛选与蛋白X结合的蛋白 3.3.2噬菌体展示 3.3.3配体指数富集的系统进化技术筛选核酸适配体 3.4检测蛋白与互作分子的互作 3.4.1酵母双杂交 Yeast two hybrid 3.4.2双分子荧光互补Bimolecular fluorescence complementation 3.4.3 Western Blotting 3.4.4免疫共沉淀Co-Immunoprecipitation 3.4.5差示扫描荧光技术Differential Scanning Fluorimetry 3.4.6荧光偏振Fluorescence polarization 3.4.7等温滴定微量热Isothermal Titration Calorimetry 3.4.8表面等离子共振技术Biacore 3.4.9蛋白质交联Crosslink 3.4.10 Native-PAGE 3.4.11静态光散射Static light scattering 3.4.12凝胶阻滞实验EMSA-electrophoretic mobility shift assay 3.5蛋白生化实验技术 3.5.1蛋白酶活性检测 3.5.2 ATP酶活检测 3.5.3解旋酶活性检测 3.5.4体外转录实验
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第一节 工具酶、克隆载体 第二节 基因文库的构建 第三节 基因文库的筛选 第四节 cDNA文库的构建与筛选 第五节 其它几种基因文库
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一、总则 二、试验方法 (一)第一阶段试验 1、急性吸入毒性试验 2、急性经皮毒性试验 3、急性经口毒性试验 4、急性眼刺激性/腐蚀性试验 5、皮肤刺激性/腐蚀性试验 6、皮肤变态反应试验(皮肤致敏试验) (二)第二阶段试验 1、鼠伤寒沙门氏菌回复突变试验(Ames 试验) 2、体外哺乳动物细胞染色体畸变试验 3、体内哺乳动物骨髓细胞染色体畸变试验 4、体内哺乳动物骨髓嗜多染红细胞微核试验 5、哺乳动物精原细胞/初级精母细胞染色体畸变试验,或 精子畸形试验 6、啮齿类动物显性致死试验 7、免疫毒性评价试验方法 8、亚急性吸入(14/28 天)毒性试验 9、亚急性经皮(21/28 天)毒性试验 10、亚急性经口(28 天)毒性试验 (三)第三阶段试验 1、亚慢性吸入毒性试验 2、亚慢性经皮毒性试验 3、亚慢性经口毒性试验 4、致畸试验 5、两代繁殖毒性试验 6、迟发性神经毒性试验 (四)第四阶段试验 1、慢性吸入毒性试验 2、慢性经皮毒性试验 3、慢性经口毒性试验 4、致癌试验,或 慢性毒性/致癌性合并试验 5、毒物代谢动力学试验 6、接触人群调查与观察(参考国内外有关专著或教科书) (五)参考试验 1、皮肤变态反应试验-局部淋巴结法 2、大肠杆菌回复突变试验 3、酵母菌基因突变试验 4、体外哺乳动物细胞正向基因突变试验 5、果蝇伴性隐性致死试验 6、枯草杆菌基因重组试验 7、体外哺乳动物细胞程序外 DNA 合成(UDS)试验 8、体内哺乳动物外周血细胞微核试验 9、体外哺乳动物姊妹染色单体交换(SCE)试验 10、体内哺乳动物骨髓细胞姊妹染色体交换(SCE)试验 11、繁殖/生长发育毒性筛选试验 12、亚急性毒性合并繁殖/发育毒性筛选试验 13、一代繁殖试验 14、神经毒性筛选组合试验
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实验一土壤中产醋酸菌种的分离筛选 一.实验目的: 品1.根据一定的生产目的如抗生素或酶类的生产,建立不同的筛选模型,并从特定的样 如土壤中筛选出高产适宜的菌株。 2.加深对发酵工程上游技术中菌种选育的认识:学会常规选种和育种的方法,树立科 学认真仔细的态度,培养科研协作精神
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第一节微生物的自然分布 第二节产生抗生素菌株的来源 第三节工业微生物的常规分离 第四节有用微生物的筛选
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