第十章微生物的分类和鉴定 微生物分类学( microbial taxonomy) 微生物系统学( microbial systematics 分类学的三个任务:分类、鉴定、命名 目的:熟知物种多样性;开发和利用物种资源。 ●第一节通用分类单元 ●第二节微生物在生物界的地位 ●第三节各大类微生物的分类系统纲要 ●第四节微生物的鉴定
第十章 微生物的分类和鉴定 微生物分类学(microbial taxonomy) 微生物系统学(microbial systematics) 分类学的三个任务:分类、鉴定、命名 目的:熟知物种多样性;开发和利用物种资源。 ⚫ 第一节 通用分类单元 ⚫ 第二节 微生物在生物界的地位 ⚫ 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 ⚫ 第四节 微生物的鉴定
第一节通用分类单元 种以上的系统分类单元 (一)七级分类单元 界 Kingdom(拉: Regnun) 门 Phylum(拉: phylum)或(拉: Divisio) 纲Cass(拉: Classis 目 Order(拉:Ozo) 科Fami!y(拉: familia) 属 Genus(拉:Gens) 种 Species(拉: species)
第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 (一)七级分类单元 界 Kingdom (拉:Regnum) 门Phylum(拉:phylum)或(拉:Divisio) 纲Class(拉:Classis) 目Order(拉:Ordo) 科Family(拉:Familia) 属Genus(拉:Genus) 种Species(拉:Species)
(二)种的概念: 种是一个基本分类单位,它是一大群表型特征高度相 似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差 异的菌株的总称。 ●在微生物中,—个种只能用该种内的一个典型菌株 type strain)来作具体标本,故这一典型菌株就是该种 的模式种( (type species ●种的定义应建立在遗传物质即DNA鉴定的基础上,把 DNA同源性的大小作为划分种的标准 ●新种( species nova,pnov或 nov sp.):是权威性的 分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过 的微生物
(二)种的概念: ⚫ 种是一个基本分类单位,它是一大群表型特征高度相 似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差 异的菌株的总称。 ⚫ 在微生物中,一个种只能用该种内的一个典型菌株 (type strain)来作具体标本,故这一典型菌株就是该种 的模式种(type species)。 ⚫ 种的定义应建立在遗传物质即DNA鉴定的基础上,把 DNA同源性的大小作为划分种的标准。 ⚫ 新种(species nova, sp.nov或nov sp.):是权威性的 分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过 的微生物
三)种的分类地位举例 三种微生物的分类地位举例 分类单元 海扇脊螺旋体 灰色链霉菌 八孢裂殖酵母 界门 原核生物界 原核生物界 真菌界 薄壁菌门 厚壁菌门 真菌门 亚门 子囊菌亚门 暗细菌纲 枝形细菌纲 半子囊菌纲 纲目科属种 螺旋体目 放线菌目 内孢霉目 螺旋体科 链霉菌科 内孢霉科 脊螺旋体属 链霉菌属 裂殖酵母属 海扇脊螺旋体 灰色链霉菌 八孢裂殖酵母 分类系统伯杰氏手册(1984)伯杰氏手册(1984) Ainsworth(1971)
(三)种的分类地位举例 ⚫ 三种微生物的分类地位举例: 分类单元 海扇脊螺旋体 灰色链霉菌 八孢裂殖酵母 界 原核生物界 原核生物界 真菌界 门 薄壁菌门 厚壁菌门 真菌门 亚门 ―― ―― 子囊菌亚门 纲 暗细菌纲 枝形细菌纲 半子囊菌纲 目 螺旋体目 放线菌目 内孢霉目 科 螺旋体科 链霉菌科 内孢霉科 属 脊螺旋体属 链霉菌属 裂殖酵母属 种 海扇脊螺旋体 灰色链霉菌 八孢裂殖酵母 分类系统 伯杰氏手册(1984) 伯杰氏手册(1984) Aingsworth(1971)
学名 学名=属名+种名加词+(首次定名人)+现名定名人+定 名年份 (必要,用斜体排字) (可省略,均用正体排字) 举例: 金黄葡莓菌 Staphylococcus aureus rosenback 猪霍乱沙门氏菌 Salmonella cholerae-suis(Smith) Weldin, 1927 Bacillus cholerae-suis Smith, 1894 蜡状芽孢杄菌荧光变种 bACillus cereus var, fluorescens Laubach variety
二、学名 学名= 属名+种名加词 +(首次定名人)+现名定名人+定 名年份 ( 必要,用斜体排字) (可省略,均用正体排字) 举例: 金黄葡萄菌 : Staphylococcus aureus Rosenback 猪霍乱沙门氏菌 : Salmonella cholerae-suis (Smith) Weldin,1927 Bacillus cholerae-suis Smith,1894 蜡状芽孢杆菌荧光变种: 把Bacillus cereus var. fluorescens Laubach variety
有关学名的其他知识: 1)属名 2)种加词 3)学名的发音一拉丁文画
有关学名的其他知识: 1)属名 2)种加词 3)学名的发音 — 拉丁文
拉丁语 拉丁语是公元前八世纪时居住在地中海阿平宁半岛上的拉丁 民族的语言。 ●拉丁民族在建成罗马城之后,将其版图扩展至几乎整个欧洲, 印度,非洲。这就是历史上的罗马帝国 ●罗马帝国的国语就是拉丁语。 ●从公元前八世纪到公元476年罗马帝国的崩溃,拉丁语曾被 应用了一千多年,在科学、宗教与文化方面,尤其是诗歌文 学方面给人类留下了大量不朽著作,从而深刻的影响着当今 的欧洲文化
拉 丁 语 ⚫ 拉丁语是公元前八世纪时居住在地中海阿平宁半岛上的拉丁 民族的语言。 ⚫ 拉丁民族在建成罗马城之后,将其版图扩展至几乎整个欧洲, 印度,非洲。这就是历史上的罗马帝国。 ⚫ 罗马帝国的国语就是拉丁语。 ⚫ 从公元前八世纪到公元476年罗马帝国的崩溃,拉丁语曾被 应用了一千多年,在科学、宗教与文化方面,尤其是诗歌文 学方面给人类留下了大量不朽著作,从而深刻的影响着当今 的欧洲文化
●随着罗马帝国的灭亡,拉丁语渐渐地向两个方向演变和发 展 (1)拉丁语和西班牙、意大利、法兰西、罗马尼亚以及葡 萄牙等国土语相结合而演变成这些国家的国语,即现代拉 丁语系的语言。 ●(2)拉丁文在中世纪还继续存在,并且在文艺复兴时期又 保留了下来,一直到十八世纪,它作为欧洲各国人民一种 国际上通用的学术语言。当时(十六世纪未期以前)还没 有一个欧洲国家具有发达而又普遍的本国语言能够在外交、 法律、宗教等事务中与拉丁文的优势相抗衡
⚫ 随着罗马帝国的灭亡,拉丁语渐渐地向两个方向演变和发 展: ⚫ (1) 拉丁语和西班牙、意大利、法兰西、罗马尼亚以及葡 萄牙等国土语相结合而演变成这些国家的国语,即现代拉 丁语系的语言。 ⚫ (2) 拉丁文在中世纪还继续存在,并且在文艺复兴时期又 保留了下来,一直到十八世纪,它作为欧洲各国人民一种 国际上通用的学术语言。当时(十六世纪末期以前)还没 有一个欧洲国家具有发达而又普遍的本国语言能够在外交、 法律、宗教等事务中与拉丁文的优势相抗衡
大写小写名称发音 a a ABCD abcd [be] [b Itse] k][ts Ide d ●Ee[e][e Ff [ef [f G Ige] gI h [ha] [ h Jj Jota lj KLMN 1[el]凹 m em][ n en
大写 小写 名称 发音 ⚫ A a [a] [a] ⚫ B b [be] [b] ⚫ C c [tse] [k] [ts] ⚫ D d [de] [d] ⚫ E e [e] [e] ⚫ F f [ef] [f] ⚫ G g [ge] [g] ⚫ H h [ha] [h] ⚫ I I [i] [i] ⚫ J j [jota] [j] ⚫ K k [ka] [k] ⚫ L l [el] [l] ⚫ M m [em] [m] ⚫ N n [en] [n]
Pp pe lp Qq[ku]队k][kv ●Rr sS es] s[ ●Tt Ite u u ve ●Yy[ psion] Zeta [z
⚫ O o [o] [o] ⚫ P p [pe] [p] ⚫ Q q [ku] [k] [kv] ⚫ R r [er] [r] ⚫ S s [es] [s] [z] ⚫ T t [te] [t] ⚫ U u [u] [u] ⚫ V v [ve] [v] ⚫ X x [iks] [ks] ⚫ Y y [ipsilon] [i] ⚫ Z z [zeta] [z]