Wen PowderCe!l漠拟XRD谱图 http:/www.ccp14.ac.uk/ccp/web-mirrors/powdcell/a_v/v_1/powder/e_cell.html 1打文件 左上角第一个图标,选中任一个文件,打开。或者File一一New,新建一个 SJTU 文件 2.填写晶体数据 (l)左上角第二个图标(edit initial data),单击打开structure data窗口; (2)lattice constants中,space-group里面填写晶体所属的晶型结构数字代 码: (3)第三行中,填写晶胞单位长度a、b、c(注意填写时单位为A-区别 nm); (4)下面的表格中,依次填写: ①name:该位置原子的名称(字符可自选,一般用元素代号): ②Z:表示原子序数,后面的ion自动显示,也可改为各种价态,如 AI3+; ③Wyck:表示该原子的位置,(字符可自选): ④x、y、z:原子所在位置的具体坐标,以a、b、c为单位; ⑤其余的不需要填写,OK即可。 SOF:site occupation factor,说明该位置有多少几率为这种原子。 B(temp):the isotropic temperature factor Biso,.各向同性温度因子。 左下角的t:偏移矢量。如若将(0.5,0.5,0.5)偏移至原点,可输入=(-0.5,- 0.5,-0.5) 注:下面的+atom和-atom可以添加/删除一行
PowderCell 模拟 XRD 谱图 http://www.ccp14.ac.uk/ccp/web-mirrors/powdcell/a_v/v_1/powder/e_cell.html 1.打开文件 左上角第一个图标,选中任一个文件,打开。或者 File——New,新建一个 文件。 2.填写晶体数据 (1)左上角第二个图标(edit initial data),单击打开 structure data 窗口; (2)lattice constants 中,space-group 里面填写晶体所属的晶型结构数字代 码; (3)第三行中,填写晶胞单位长度 a、b、c(注意填写时单位为 A-区别 nm); (4)下面的表格中,依次填写: ①name:该位置原子的名称(字符可自选,一般用元素代号); ②Z:表示原子序数,后面的 ion 自动显示,也可改为各种价态,如 Al3+; ③Wyck:表示该原子的位置,(字符可自选); ④x、y、z:原子所在位置的具体坐标,以 a、b、c 为单位; ⑤其余的不需要填写,OK 即可。 SOF:site occupation factor,说明该位置有多少几率为这种原子。 B(temp):the isotropic temperature factor Biso,各向同性温度因子。 左下角的 t:偏移矢量。如若将(0.5,0.5,0.5)偏移至原点,可输入 t=(-0.5,- 0.5,-0.5)。 注:下面的+atom 和-atom 可以添加/删除一行。 SJTU Hongyuan Wen
Wen initial data D:\ICSD\Mullite lattice constants space-group No 55 setting 1 Pb am atoms in cell 15.7 (24 pos) Hong 7.5460 7.6940 2.8830 90.0000 90.0000 90.0000 cell vot 167.384A density:3.168 g/cm 1elma8g:319.321 mass abs coef:70.515 cm/g name ion Wyck x SOF B [temp) SITU i13A3+2a 0.000000.000000.000001.0000 1.6100 13AI3+ 4h 0.648700.15890 0.500000.5000 1.6100 14Si4+ 0.3690 1.6100 A 13A3+4h 0.760400.292700.500000.1310 1.6100 0 802. 男 0.857500.077300.500001.0000 1.6100 5 0 802. 4g 0.627300.279400.000001.0000 1.6100 6 0 8 02- 2d 0.00000 0.500000.500000.6070 1.6100 +atom atom comment Help Cancel OK 3.查看下方的XRD谱线(powder pattern) (l)更改角度区间。单击选中powder pattern窗口,diffraction experiment,,在2-theta range中更改模拟显示的XRD谱线角度区间; (2)更改谱线中峰上的显示文字。右上角快捷键中,最下面一个,单击,选 中所要显示的数据类型。 方二:鼠标置于【powder pattern】窗口,右键-【Lable】,选择想要的标 签。 (3)导出理论XRD谱线 【Diffraction】-【Export data】-输入名称,选择位置,得到*xy文件。 可用txt打开,即为理论XRD衍射图。 4旋转棋拟晶体结构视图 选中结构图窗口,右边快捷键从上到下依次为:X、y、z轴旋转。 5.保存文件 (I)【File】-【save】-【NONAME】-输入名称,选择位置,得到*.cel文 件: (2)【Diffraction】-【Export data】输入名称,选择位置,得到*.xy文 件。可用xt打开,即为理论XRD衍射图。 6.修改结构图中的原子大小及图案 【Options】-【Structure Representation】,弹出窗口,在元素周期表中选择
3.查看下方的 XRD 谱线(powder pattern) (1)更改角度区间。单击选中 powder pattern 窗口,diffraction—— experiment,在 2-theta range 中更改模拟显示的 XRD 谱线角度区间; (2)更改谱线中峰上的显示文字。右上角快捷键中,最下面一个,单击,选 中所要显示的数据类型。 方二:鼠标置于【powder pattern】窗口,右键-【Lable】,选择想要的标 签。 (3)导出理论 XRD 谱线 【Diffraction】-【Export data】】-输入名称,选择位置,得到*.x_y 文件。 可用 txt 打开,即为理论 XRD 衍射图。 4.旋转模拟晶体结构视图 选中结构图窗口,右边快捷键从上到下依次为:x、y、z 轴旋转。 5.保存文件 (1)【File】-【save】-【NONAME】-输入名称,选择位置,得到*.cel 文 件; (2)【Diffraction】-【Export data】】-输入名称,选择位置,得到*.x_y 文 件。可用 txt 打开,即为理论 XRD 衍射图。 6.修改结构图中的原子大小及图案 【Options】-【Structure Representation】,弹出窗口,在元素周期表中选择 SJTU Hongyuan Wen
Wen 需要更改的的元素修改size和Color,OK。 structure representation options X He bonds B C N D F Ne SJTU Ho NaMg Al Si P S CI Ar K Ca Sc Ti v Cr Mn Fe Co Ni Cu Zn Ga Ge As Se Br Kr pecial bonds Rb Sr Y Zr Nb Mo Te Ru Rh Pd Ag Cd In Sn Sb Te J Xe Cs Ba La Hf Ta w Re Os Ir Pt Au Hg TI Pb Bi Po At Rn Fr Ra Ac Ku Ce Pr Nd Pm Sm Eu Gd Tb Dy Ho Er Tm Yb Lu Th Pa U Np Pu Am Cm Bk Cf E:FmMd No Lr symbol radius useds定e color perspective H 0.32 032 1.00 Hs 0.32 0.32 H. 2.08 203 size factor D 0.32 032 0.50 0.32 0.32 size =rad.for all ?Help Cancel OK 7.标定XRD谱图,观察其有几种物质,各物质所占比例 (1)载入可能的物质。【File】-【Load】,依次导入各物质,格式最好为 【*.cel】: (2)导入XRD谱图,格式为【*XY】 【Diffraction】-【Load Powder Pattern】,读入文件。 注:【*XY】文件共两列,第一列为角度,第二列为强度。可以直接删除 【*.asc】文件的前几行,并重命名得到。 (3)拟合。 方一:【Refinement】-【Start】; 方二:上方最后一个按钮【Start Refinement】。 拟合后,窗口上方会出现各物质的比例。 8查看键长、键角等 【Structure】-【Info】-任选一个,弹出【Structure and space group information】窗口,可在子窗口中选择各类数据。 也可【select】-选择需要的原子等,在上述窗口中查看与之相关的各类数 据
需要更改的的元素,修改 size 和 Color,OK。 7.标定 XRD 谱图,观察其有几种物质,各物质所占比例 (1)载入可能的物质。【File】-【Load】,依次导入各物质,格式最好为 【*.cel】; (2)导入 XRD 谱图,格式为【*.X_Y】。 【Diffraction】-【Load Powder Pattern】,读入文件。 注:【*.X_Y】文件共两列,第一列为角度,第二列为强度。可以直接删除 【*.asc】文件的前几行,并重命名得到。 (3)拟合。 方一:【Refinement】-【Start】; 方二:上方最后一个按钮【Start Refinement】。 拟合后,窗口上方会出现各物质的比例。 8.查看键长、键角等 【Structure】-【Info】-任选一个,弹出【Structure and space group information】窗口,可在子窗口中选择各类数据。 也可【select】-选择需要的原子等,在上述窗口中查看与之相关的各类数 据。 SJTU Hongyuan Wen
Wen 9.谱线对比及峰位图 在【Powder Pattern】窗口,右键-【difference】,即可出现下图的效果。 右键:sum】,即可出现fit之后理论总谱图与实际谱图的对比。 SJTU Hon Anatase 73.7 203ed0 b) 10.画有取向的XRD谱图 【Diffraction】-【Experiment】-【phase options】子窗口。 (l)【preferred orientation.】内,model可选: ①none:无取向 ②plate:面,之后可选择【plane】内的HKL,【parameter】内的两个参数- XRD谱图不一样。 ③needle:针; ④March-Dollse:该函数可计算择优取向; (2)【Experiment】内, ①【source】可选X-ray,neutron中子; 11.查看模拟谱图的20、HKL及相对强度 方一:【Diffraction】-【HKL-list】可查看。 方二:上方快捷键。 可选择只显示强度大于多少的衍射峰【>**】。 12.复制数据 Powdercell内的数据可以复制所有的数据,如模拟的衍射图谱、20、HKL 及相对强度等。 复制前打开所需复制数据的窗口,【Diffraction】-【Copy to clipboard】
9.谱线对比及峰位图 在【Powder Pattern】窗口,右键-【difference】,即可出现下图的效果。 右键-【sum】,即可出现 fit 之后理论总谱图与实际谱图的对比。 10.画有取向的 XRD 谱图 【Diffraction】-【Experiment】-【phase options】子窗口。 (1)【preferred orientation】内,model 可选: ①none:无取向 ②plate:面,之后可选择【plane】内的 HKL,【parameter】内的两个参数- XRD 谱图不一样。 ③needle:针; ④March-Dollse:该函数可计算择优取向; (2)【Experiment】内, ①【source】可选 X-ray,neutron 中子; 11.查看模拟谱图的 2θ、HKL 及相对强度 方一:【Diffraction】-【HKL-list】可查看。 方二:上方快捷键。 可选择只显示强度大于多少的衍射峰【I≥***】。 12. 复制数据 Powdercell 内的数据可以复制所有的数据,如模拟的衍射图谱、2θ、HKL 及相对强度等。 复制前打开所需复制数据的窗口,【Diffraction】-【Copy to clipboard】。 SJTU Hongyuan Wen
wen l3.Experiment各参数介绍 (1)汇总 radiation (i.e.X-rays or neutrons) node material (i.e.wavelength) S.TTU Ho consideration of anomalous dispersion:反常色散 Kal/Ka2 doublet (Lal/La2 for W) diffraction geometry variable or fixed slit system 20 range and step width (2)geometry衍射几何 Bragg-Brenteno几何,平板状样品,分为0-20mode和0-0mode两种; Debye-.Scherres几何,细条状样品。 (3)variable slit::可变狭缝,一般不选。不选则为fixed slit固定狭缝。 14.导出模拟XRD谱图数据 (I)建立XRD谱图; (2)【Diffraction】-【Export Data】-【选择相应的文件】,弹出【Save powder data】窗口,选择文件类型为【*xy】,保存。用txt打开即可,可导入 origin绘图
13. Experiment 各参数介绍 (1)汇总 radiation (i.e. X-rays or neutrons) anode material (i.e. wavelength) consideration of anomalous dispersion:反常色散 Ka1/ Ka2 doublet (La1/ La2 for W) diffraction geometry variable or fixed slit system 2θ range and step width (2)geometry 衍射几何 Bragg-Brenteno 几何,平板状样品,分为 θ-2θ mode 和 θ-θ mode 两种; Debye-Scherres 几何,细条状样品。 (3)variable slit:可变狭缝,一般不选。不选则为 fixed slit 固定狭缝。 14. 导出模拟 XRD 谱图数据 (1) 建立 XRD 谱图; (2) 【Diffraction】-【Export Data】-【选择相应的文件】,弹出【Save powder data】窗口,选择文件类型为【*.x_y】,保存。用 txt 打开即可,可导入 origin 绘图。 SJTU Hongyuan Wen