代谢组学技术及应用新策略简介 代谢组学平台 刘慧颖
代谢组学技术及应用新策略简介 代谢组学平台 刘慧颖
Content 代谢组学技术背景 二、代谢组学技术研究方法简介 三、代谢组学平台简介
Content 一、代谢组学技术背景 二、代谢组学技术研究方法简介 三、代谢组学平台简介
、代谢组学技术背景 代谢组学的定义 代谢组学 metabolomics是继基因组学和蛋白质组学之后发展起来的新兴的组学 技术,是系统生物学的组成部分。其对生物体内所有小分子代谢物进行定性定量分 析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,其研究对象大都是分子 量1500以内的小分子物质。 XCMS XCMS2 LC/MS Precursor restricted Metin Sean Identification Precursor un-restricted etlin symmetry seare Unknown Structural Characterization
一、代谢组学技术背景 代谢组学的定义 • 代谢组学(metabolomics)是继基因组学和蛋白质组学之后发展起来的新兴的组学 技术，是系统生物学的组成部分。其对生物体内所有小分子代谢物进行定性定量分 析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，其研究对象大都是分子 量1500以内的小分子物质
与其他组学的关系 基因组学和蛋白质组学告诉你可能发生什么,而代谢组学则告诉你已经发生了什么 Genome DNA Transcriptome RNA Proteome Proteins Metabolome Sugars NucleotidesAmino Lipids (Lipidome)
与其他组学的关系 “基因组学和蛋白质组学告诉你可能发生什么，而代谢组学则告诉你已经发生了什么
组学未来的方向一多组学分析 and exogenous Protein content. activity and presence and Gene regulation ost-translationalfluctuations modification and expression Gene content microbial community Phenotypic Environmental Health and perturbations Janet K. Jansson, eta/ A multi-omic future disease states for microbiome studies. NMICROBIOL 2016 April 26
组学未来的方向—多组学分析
代谢组学技术研究方法简 Consecutive Metabolite LC-MS detection Data Processing Metabolism Analysis Extraction and statistics Pathway Mapping Tissue HILIC Organic-RP oooo Bead Beater
二、代谢组学技术研究方法简介 Consecutive Metabolite LC-MS detection Data Processing Metabolism Analysis Extraction and Statistics Pathway Mapping
代谢组学研究流程 代谢物提取 代谢物检测 数据分析 溶剂提取法 主成分分析 (甲醇,乙腈等) 液质连用(LCMS) 偏最小二乘法 气质连用(GCMS) 正交信号过滤法 毛细管电泳质谱(CEMS) 神经网络法 固相萃取 电感耦合等离子体质谱( ICP-MS) 支持向量机 超临界流体质谱( SFC-MS) 核磁共振 液相色谱串联核磁共振 代谢物鉴定
代谢组学研究流程
、代谢组学平台简介 AB Sciex三重四极杆5500TM LC/MS/MS系统 三重四极杆5500~LC/MS/MS系统 具有超宽的定量线性动态范围,无 可比拟的定量分析灵敏度,特别适 合做最复杂基质样品中超低浓度组 分的定量分析,对小分子化合物进 行定量分析时,可提供无与伦比的 数据准确性和重现性
三、代谢组学平台简介 AB Sciex 三重四极杆5500™ LC/MS/MS 系统 三重四极杆5500™ LC/MS/MS系统 具有超宽的定量线性动态范围，无 可比拟的定量分析灵敏度，特别适 合做最复杂基质样品中超低浓度组 分的定量分析，对小分子化合物进 行定量分析时，可提供无与伦比的 数据准确性和重现性
、代谢组学平台简介 可以检测的样品 体液 组织 细胞 血清 心脏组织 血浆 肝脏组织 癌细胞 尿液 肾脏组织 脂肪细胞 脑脊液 肺脏组织 心肌细胞 胆汁 脑组织 等 等 等
三、代谢组学平台简介 血清 血浆 尿液 脑脊液 胆汁 等 体液 心脏组织 肝脏组织 肾脏组织 肺脏组织 脑组织 等 组织 癌细胞 脂肪细胞 心肌细胞 等 细胞 可以检测的样品
、代谢组学平台简介 测试项目 1×w-RM(532四2v42!如ER3pcm1 on Same M55c 565 亲水代谢组学 脂质组学 花生四烯酸类 NAD通路 55 2045 1065 antpedia
三、代谢组学平台简介 测试项目： 亲水代谢组学 脂质组学 花生四烯酸类 NAD通路