第六章分子细胞遗传学相关实验 实验一 荧光原位杂交技术 一、实验目的 1熟悉荧光原位杂交技术的原理和方法, 2熟悉荧光原位杂交技术的应用。 二、实验原理 经对探针和靶DNA变性处理成单链后,用生物素标记的核苷酸探针与 间期核内或染色体上的靶DNA进行原位杂交,再用荧光标记的生物素亲和 蛋白和抗亲和蛋白的抗体作用,使探针杂交区信号放大发出荧光,可用荧光 显微镜检测,以确定DNA或基因或染色体是否有异常。目前,该技术已厂 泛用于动植物基因组结构研究、临床医学中基因、染色体异常的检测和研究 肿瘤遗传学的研究等方面。 三、器材与试剂 1.器材:荧光显微镜、烤箱、恒温培养箱、冰箱、水浴箱(两个)、Eppendorf 离心机、染缸(至少12个人加样枪(1~20μL,10100μ1,100-1000μ1)、避 光杂交盒、盖玻片、计时器、塑料盖玻片或塑料薄膜、镊子、钻石笔、浮漂。 2.试剂: (1)试剂盒成分 主要成分:探针5人份,探针位置Yq12 I:杂交液60μ1,:BlockingI1200L,Ⅲ:FITC-avidin1200μl V:BlockingⅡ600ul,V:Anti-avidin600μl,M:PW/antifade80μl 试剂盒中未包括的试剂:甲酰胺、氯化钠、柠檬酸三钠、土温20、Rubber Cement、乙醇。 (2)荧光原位杂交相关溶液的配制: 1.70%甲酰胺/2×SSC:35ml甲酰胺,5ml20×SSC,10m1水,混匀。 2.50%甲酰胺/2×SSC:100ml甲酰肢,20ml20×SSC,80ml水,混匀,分 装在4个染缸中。 3.洗脱液:90m120×SSC,加水至450ml,加土温20450μ1,混匀, 每次洗脱倒出150ml,分装在3个染缸中。 4.20×SSC:氯化钠175.3克,柠檬酸钠88.2克,定溶至1000ml蒸馏
1 第六章 分子细胞遗传学相关实验 实验一 荧光原位杂交技术 一、实验目的 1.熟悉荧光原位杂交技术的原理和方法。 2.熟悉荧光原位杂交技术的应用。 二、实验原理 经对探针和靶 DNA 变性处理成单链后,用生物素标记的核苷酸探针与 间期核内或染色体上的靶 DNA 进行原位杂交,再用荧光标记的生物素亲和 蛋白和抗亲和蛋白的抗体作用,使探针杂交区信号放大发出荧光,可用荧光 显微镜检测,以确定 DNA 或基因或染色体是否有异常。目前,该技术已广 泛用于动植物基因组结构研究、临床医学中基因、染色体异常的检测和研究、 肿瘤遗传学的研究等方面。 三、器材与试剂 1.器材:荧光显微镜、烤箱、恒温培养箱、冰箱、水浴箱(两个)、Eppendorf 离心机、染缸(至少 12 个)、加样枪(1~20μl,10~100μl,100~1000μl)、避 光杂交盒、盖玻片、计时器、塑料盖玻片或塑料薄膜、镊子、钻石笔、浮漂。 2.试剂: (1)试剂盒成分 主要成分:探针 5 人份,探针位置 Yq12 Ⅰ:杂交液 60μl ,Ⅱ:BlockingⅠ1200μl, Ⅲ:FITC-avidin 1200μl, Ⅳ:Blocking Ⅱ600μl, Ⅴ:Anti-avidin600μl ,Ⅵ:PI/antifade80μl 试剂盒中未包括的试剂:甲酰胺、氯化钠、柠檬酸三钠、土温 20、Rubber Cement、乙醇。 (2)荧光原位杂交相关溶液的配制: 1.70%甲酰胺/2×SSC:35ml 甲酰胺,5ml 20×SSC,10ml 水,混匀。 2.50%甲酰胺/2×SSC:100ml 甲酰胺,20ml 20×SSC,80ml 水,混匀,分 装在 4 个染缸中。 3.洗脱液:90ml20×SSC,加水至 450ml,加土温 20 450μl,混匀, 每次洗脱倒出 150ml,分装在 3 个染缸中。 4. 20×SSC:氯化钠 175.3 克,柠檬酸钠 88.2 克,定溶至 1000ml 蒸馏
水中(PH7.0),高压灭菌贮存。 5.1×SSC:7.5ml的20×SSC,加水至150ml混匀,分装在3个染缸 中。 6.2×SSC:10m120×SSC加水至100ml混匀,分二次用。 四、内容与方法 (一)划定杂交区在显微镜下观察整个标本,用钻石笔在标本背面 划定一个或几个细胞及染色体好的区域作为杂交区(整个风域不大于 22mm2)。 (二)烤片杂交标本于5560℃烤片2小时(预杂交的标本制片后在 室温放2周即转入-20℃保存,片龄超过1个月的标本烤一个小时即可) (三)变性液及杂交盒的预热将装有70%甲酰胺/2×SSC变性液的染 缸放入75℃水浴中预热,将杂交盒加入少量蒸馏水放入37℃恒温箱。 (四)探针变性重复序列探针:在探针中加入8μ1I液,混匀,稍 离心,插在浮漂上于75℃变性5分钟,立即0℃10分钟。 (五)玻片标本变性 1.将已烤片的标本置于68-70℃的70%甲酰胺2×SSC中变性1-2分钟。 2.立即按顺序将标本经70%、90%、100%冷乙醇系列脱水各5分钟,室 温干燥。 (六)原位杂交将DNA探针滴于己变性并脱水的玻片标本的杂交区 域上,盖上盖玻片,Rubber Cement封片,置于潮湿杂交盒中37C杂交过夜 (约15-17小时)。 (七)洗脱、免疫荧光检测与信号放大杂交次日,提前将配制的4 缸50%甲酰胺/2×SSC和3缸1×SSC放入水浴中预热(42-50℃)。 1.待缸内温度达到洗脱所需温度时将标本从37℃温箱中取出,用手按 住盖玻片去掉封片胶。 2.42-50℃,将玻片直接放入装有50%甲酰胺/2×SSC的染缸中,让盖 玻片自然滑脱,脱落后开始计时,每次5分钟,依次洗涤4次。 3.42-50℃,于1×sC中依次洗涤3次,每次5分钟。 4.肢片移至室温2×SSC平衡,(1分钟即可)。 5.将用过的3缸1×SSC倒掉,换成配好的洗脱液,放入水浴中预热 6.将玻片从2×SSC中取出,竖直立在纸上几下,以去掉多余的液体。 7.加80-100u1Ⅱ液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中37℃ 温有15分钟。 8.取出片子,去膜,直接在原片上加80-100μ1液于标本的杂交区域 上,盖上塑料薄膜,杂交盒中37℃继续温育40分钟。 9.取出标本,去掉塑料薄膜,42-50℃于洗脱液中洗涤3次,每次5分 钟。 2
2 水中(PH7.0),高压灭菌贮存。 5. 1×SSC:7.5ml 的 20×SSC,加水至 150ml 混匀,分装在 3 个染缸 中。 6. 2×SSC:10ml20×SSC 加水至 100ml 混匀,分二次用。 四、内容与方法 (一)划定杂交区 在显微镜下观察整个标本,用钻石笔在标本背面 划定一个或几个细胞及染色体好的区域作为杂交区(整个区域不大于 22mm2)。 (二)烤片 杂交标本于 55~60℃烤片 2 小时(预杂交的标本制片后在 室温放 2 周即转入-20℃保存,片龄超过 1 个月的标本烤一个小时即可)。 (三)变性液及杂交盒的预热 将装有 70%甲酰胺/2×SSC 变性液的染 缸放入 75℃水浴中预热,将杂交盒加入少量蒸馏水放入 37℃恒温箱。 (四)探针变性 重复序列探针:在探针中加入 8μlⅠ液,混匀,稍 离心,插在浮漂上于 75℃变性 5 分钟,立即 0℃10 分钟。 (五)玻片标本变性 1.将已烤片的标本置于68-70℃的70%甲酰胺/2×SSC中变性1-2分钟。 2.立即按顺序将标本经 70%、90%、100%冷乙醇系列脱水各 5 分钟,室 温干燥。 (六)原位杂交 将 DNA 探针滴于已变性并脱水的玻片标本的杂交区 域上,盖上盖玻片,Rubber Cement 封片,置于潮湿杂交盒中 37℃杂交过夜 (约 15-17 小时)。 (七)洗脱、免疫荧光检测与信号放大 杂交次日,提前将配制的 4 缸 50%甲酰胺/2×SSC 和 3 缸 1×SSC 放入水浴中预热(42-50℃)。 1.待缸内温度达到洗脱所需温度时将标本从 37℃温箱中取出,用手按 住盖玻片去掉封片胶。 2. 42-50℃,将玻片直接放入装有 50%甲酰胺/2×SSC 的染缸中,让盖 玻片自然滑脱,脱落后开始计时,每次 5 分钟,依次洗涤 4 次。 3. 42-50℃,于 1×SSC 中依次洗涤 3 次,每次 5 分钟。 4.玻片移至室温 2×SSC 平衡,(1 分钟即可)。 5.将用过的 3 缸 1×SSC 倒掉,换成配好的洗脱液,放入水浴中预热。 6.将玻片从 2×SSC 中取出,竖直立在纸上几下,以去掉多余的液体。 7.加 80-100ulⅡ液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃ 温育 15 分钟。 8.取出片子,去膜,直接在原片上加 80-100μlⅢ液于标本的杂交区域 上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃继续温育 40 分钟。 9.取出标本,去掉塑料薄膜,42-50℃于洗脱液中洗涤 3 次,每次 5 分 钟
10.将玻片从洗脱液中取出,竖直立在纸上几下,以去掉多余的液体。 11.加80-100μ1Ⅳ液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃温育15分钟。 12.将3缸用过的洗脱液倒掉,换成为用过的洗脱液,放入水浴中预 执。 13.加80-100μ1V液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃继续温育40分钟。 14.取出标本,去掉塑料薄膜,置于42-50℃洗脱液中洗涤3次,每次 5分钟。 15。将玻片从洗脱液中取出,竖直立在纸上几下,以去掉多余的液体 16.加80-100μ1Ⅱ液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃温育15分钟。 17.将3缸用过的洗脱液倒掉,换成未用过的洗脱液,放入水浴中预 热。 18.加80-100μ1Ⅲ液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃继续温育40分钟。 19.取出标本,去掉塑料薄膜,置于42-50℃洗脱液中洗涤3次,每次 5分钟。再于室温2×SSC中平衡一下。 20.玻片从中取出,竖直立在纸上晾干,加12-15μ1M液复染,盖上盖 玻片,荧光显微镜下观察结果。 (八)结果判定低倍镜下用看P(红色)的激发块找到红色的染色体 及细胞,换成油镜,用微调调清楚,再更换看FTC(绿色)的激发块观察 绿色信号(不看时随时关上荧光,以防止信号淬灭,看完后请放-20℃避光 保存片子)。 注意事项: 1本方法适用于外周血标本,如羊水或其他标本应做好杂交前预处理 2.片子变性时间由制片后时间长短而定,制片时间越长变性时间越长。 3变性及洗脱时应量取染缸内液体的温度。洗脱过程中片子勿干,以免 增加背景。 4试剂每次使用前应充分混匀,应尽量减少反复冻融次数,一经起用可 放在4℃,FITC-avidin应避光保存。 5加盖玻片时应避免产生气泡(如产生气泡,有气泡的区域将不应视为 杂交区)。 五、作业与思考 1.荧光原位杂交技术的原理是什么? 2熟悉荧光原位杂交技术的主要步骤有哪些? (刘京昇)
3 10.将玻片从洗脱液中取出,竖直立在纸上几下,以去掉多余的液体。 11. 加 80-100μlⅣ液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃温育 15 分钟。 12. 将 3 缸用过的洗脱液倒掉,换成为用过的洗脱液,放入水浴中预 热。 13. 加 80-100μlⅤ液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃继续温育 40 分钟。 14. 取出标本,去掉塑料薄膜,置于 42-50℃洗脱液中洗涤 3 次,每次 5 分钟。 15. 将玻片从洗脱液中取出,竖直立在纸上几下,以去掉多余的液体。 16. 加 80-100μlⅡ液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃温育 15 分钟。 17. 将 3 缸用过的洗脱液倒掉,换成未用过的洗脱液,放入水浴中预 热。 18.加 80-100μlⅢ液于标本的杂交区域上,盖上塑料薄膜,杂交盒中 37℃继续温育 40 分钟。 19. 取出标本,去掉塑料薄膜,置于 42-50℃洗脱液中洗涤 3 次,每次 5 分钟。再于室温 2×SSC 中平衡一下。 20.玻片从中取出,竖直立在纸上晾干,加 12-15μlⅥ液复染,盖上盖 玻片,荧光显微镜下观察结果。 (八)结果判定 低倍镜下用看 PI(红色)的激发块找到红色的染色体 及细胞,换成油镜,用微调调清楚,再更换看 FITC(绿色)的激发块观察 绿色信号(不看时随时关上荧光,以防止信号淬灭,看完后请放-20℃避光 保存片子)。 注意事项: 1.本方法适用于外周血标本,如羊水或其他标本应做好杂交前预处理。 2.片子变性时间由制片后时间长短而定,制片时间越长变性时间越长。 3.变性及洗脱时应量取染缸内液体的温度。洗脱过程中片子勿干,以免 增加背景。 4.试剂每次使用前应充分混匀,应尽量减少反复冻融次数,一经起用可 放在 4℃,FITC-avidin 应避光保存。 5.加盖玻片时应避免产生气泡(如产生气泡,有气泡的区域将不应视为 杂交区)。 五、作业与思考 1. 荧光原位杂交技术的原理是什么? 2.熟悉荧光原位杂交技术的主要步骤有哪些? (刘京昇)