e 第十章微生物的分类和鉴定
第十章 微生物的分类和鉴定 1
第一节通用分类单元 · Category( taxon,分类单位 Domain(域 Phy lum, Division(门) ass (纲) 0rder(目 Family(科) Genus(属) spec les(种)
第一节 通用分类单元 • Category （taxon, 分类单位） –Domain （域） - Phylum，Division（门） - Class （纲） - Order （目） - Family (科） - Genus (属） - species (种） （ 4
各级分类单元 All organisms 域 二 Eukarya Archaea Bacteria Domain 界 Kingdom Fungi None assigned for archaea None assigned for bacteria Ascomycota Euryarchaeota Proteobacteria Phylum Hemiascomycetes Methanococc 纲 Gammaproteobacteria Class 目 Order Saccharomycetales Methanococcales Enterobacteriales 科 Family Saccharomycetaceae Methanococcaceae Enterobacteriaceae Methanothermococcus 属 Genus Saccharomyces Escherichia 种 Species S cerevisiae M nawensis E. coli Bakers yeast Methanococcus E. coli
各级分类单元 Fungi Eukarya Ascomycota Hemiascomycetes Saccharomycetales Saccharomycetaceae Saccharomyces S. cerevisiae Baker’s yeast Species Genus Family Order Class Phylum Kingdom Domain All organisms M. okinawensis Methanothermococcus Methanococcaceae Methanococcales Methanococci Euryarcheota None assigned for archaea Archaea Methanococcus E. coli E. coli Escherichia Enterobacteriaceae Enterobacteriales Gammaproteobacteria Proteobacteria None assigned for bacteria Bacteria 门 域 纲 目 科 属 种 界 5
种( species)的概念 微生物的种( specIes,简写sp.,又译 物种)是一个基本分类单元,它是一大群 表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与 同属内其他物种有明显差异的菌株的总称 具有该种的许多典型性状的模式菌株才是具体的“种
种（species）的概念 微生物的种（species，简写sp.，又译 物种）是一个基本分类单元，它是一大群 表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与 同属内其他物种有明显差异的菌株的总称。 6 具有该种的许多典型性状的模式菌株才是具体的“种
e 菌株( strain) 菌株又称品系(在非细胞型的病毒中则称毒株或株),表示任何由 个独立分离的单细胞(或单个病毒粒子)繁殖而成的纯遗传型群体及其 切后代。 菌株( strain)=纯培养物( pure culture) 克隆( clone) 典型菌株( type strain)-一或模式种 一个种的具体代表,称为典型菌株。具有该种的许多典型性状。 注意:典型菌株一般由两个以上国家的菌种保藏机构保藏,以便备查 考、索取和购买
菌株又称品系（在非细胞型的病毒中则称毒株或株），表示任何由一 个独立分离的单细胞（或单个病毒粒子）繁殖而成的纯遗传型群体及其 一切后代。 菌株（strain） 菌株 (strain) = 纯培养物 (pure culture) = 克隆 (clone) 典型菌株（type strain）-----或模式种 一个种的具体代表，称为典型菌株。具有该种的许多典型性状。 注意：典型菌株一般由两个以上国家的菌种保藏机构保藏，以便备查 考、索取和购买。 7
e sp. Vs spp Bac//ussp.(一种芽孢杆菌) Baci//vssp.(若干种芽孢杆菌) Strain(菌株) Escher ichia coli K12 Type strain(典型菌株) Rh zob ium dae jeanense l61
• sp. vs spp. –Bacillus sp. （一种芽孢杆菌） –Bacillus spp. (若干种芽孢杆菌） • Strain (菌株) –Escherichia coli K12 • Type strain (典型菌株） Rhizobium daejeanense L61T 8
e 双名法( binominal nomenclature) 属名( generic name) 双名法{十 种名加词( specific epithet) 学名=属名+种名加词+(首次定名人)+现名定名人+现名定名年份 排斜体字 排正体字(一般省略)
双名法（binominal nomenclature） 双名法 属名（generic name） 种名加词（specific epithet） 9
e 学名社俗名比铉 俗名 学名 (common name) (Scientific name 结核分枝杆菌 结核杆菌 ( Mycobacterium tuberculosis 铜绿假单胞菌 绿脓杆菌 (Pseudomonas aeruginosa) 金黄色葡萄球菌 金葡菌 Staphylococcus aureus) 红色面包霉 粗糙脉孢菌( Neurospora crassa) 白念菌 白色假丝酵母( Candida albicans) 12
学名和俗名比较 12
命名法 Nomenclature) Approved List of Bacterial Name (International Journal of Systematic Bacteriology 1980, 30: 255-429 在 Approved List之前,没有固定的规律来描述新的种 eg,链霉菌( Streptomyces)属曾同时包含超过3,000种 统一的系统 理事会: International committee on systematic bacteriology(cSB) (系统细菌学国际委员会) 规则:细菌命名法的国际法规 官方杂志 International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB) International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM)(From 2000) 13
命名法（Nomenclature） • Approved List of Bacterial Name (International Journal of Systematic Bacteriology 1980, 30:255-429) – 在 Approved List之前，没有固定的规律来描述新的种 e.g., 链霉菌（Streptomyces ）属曾同时包含超过3,000 种 • 统一的系统 • 理事会：International committee on systematic bacteriology (ICSB) （系统细菌学国际委员会） • 规则：细菌命名法的国际法规 • 官方杂志 – International Journal of Systematic Bacteriology （IJSB） – International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology （IJSEM） (From 2000) 13
微生物命名( Nomenclature)流程 分类学的提议 (新的分类单位,新的组合) IJSEM中发表 其它杂志发表 作者委托JsEM Notification List Validation List in IJSEM in IJSEM 14
微生物命名（Nomenclature）流程 分类学的提议 (新的分类单位，新的组合) IJSEM中发表 其它杂志发表 Notification List in IJSEM Validation List in IJSEM 作者委托 IJSEM 14