蛋白质的高级结构 超二级结构和三、四级结构
蛋白质的高级结构 超二级结构和三、四级结构
白质的结构层次 级结构:氨基酸序列及二硫键位置 二级结构:ω螺旋,β折叠 超二级结构 Module 高级结构结构域( domain) 三级结构:所有原子空间位置 四级结构:蛋白质多聚体
一级结构：氨基酸序列及二硫键位置 二级结构：α螺旋，β折叠 超二级结构 Module 结构域（domain） 三级结构：所有原子空间位置 四级结构：蛋白质多聚体 蛋白质的结构层次 高级结构
二级结 Supersecondary structure) 超二级结构是介于蛋白质二级结构和三级 结构之间的空间结构,指相邻的二级结构单元组 合在一起,彼此相互作用,排列形成规则的、在 空间结构上能够辨认的二级结构组合体,并充当 三级结构的构件( block building),其基本形 式有、阝和β等。多数情况下只有非极性 残基侧链参与这些相互作用,而亲水侧链多在分 子的外表面
超二级结构 （Supersecondary structure） 超二级结构是介于蛋白质二级结构和三级 结构之间的空间结构，指相邻的二级结构单元组 合在一起，彼此相互作用，排列形成规则的、在 空间结构上能够辨认的二级结构组合体，并充当 三级结构的构件（block building），其基本形 式有αα、βαβ和βββ等。多数情况下只有非极性 残基侧链参与这些相互作用，而亲水侧链多在分 子的外表面
超二级结构 Supersecondary Structure ·超二级结构类型 形成超二级结构的作用力 形成超二级结构的作用力 β-shet的拓扑学规律
• 超二级结构类型 • 形成αα超二级结构的作用力 • 形成βαβ超二级结构的作用力 • β-sheet 的拓扑学规律 超二级结构 Supersecondary Structure
招二级结构的类利 aa: keratin, myosin βaβ、ββB:拥有/shee蛋白质
超二级结构的类型 ：keratin, myosin, 、：拥有β-sheet的蛋白质
形成起二级结构的作用力 α:α螺旋的侧链位置的20度错位 βαβ:伸展肽链的125度自然扭曲
αα： α螺旋的侧链位置的20度错位 βαβ：伸展肽链的12.5度自然扭曲 形成超二级结构的作用力
ao βoβ R ossman 折叠 (a螺旋处于折 叠片上侧) N C N 白质中的几种超 D发夹 Eβ曲折 C N 希腊钥匙拓扑结构 极少见到
蛋 白 质 中 的 几 种 超 二 级 结 构 Rossman折叠 （α螺旋处于β折 叠片上侧） 发夹 曲折 希腊钥匙拓扑结构
记量级 αa是一种由两股右手α-螺旋彼此缠绕而成 的左手超螺旋( superhelix),重复距离约140A 是α-角蛋白、肌球蛋白、原肌球蛋白 ( protomyosin)和纤维蛋白原 fibrinogen)中的 种超二级结构。由于形成超螺旋,每圈螺旋为 3.5个氨基酸残基(不是3.6),沿轴有一定的倾 斜,重复距离从5.4缩短到5.』A。螺旋之间的相 互作用由侧链的装配控制,螺旋之间可能作用 的侧链是非极性的,它们向着超螺旋内部,避 开与水接触,其他的是极性的,处于分子的表 面,与水接触。超螺旋的稳定性主要由非极性 侧链间的范德华力相互作用的结果
超二级结构 是一种由两股右手-螺旋彼此缠绕而成 的左手超螺旋(superhelix)，重复距离约140 Å。 是-角蛋白、肌球蛋白、原肌球蛋白 (protomyosin)和纤维蛋白原(fibrinogen)中的一 种超二级结构。由于形成超螺旋，每圈螺旋为 3.5个氨基酸残基（不是3.6），沿轴有一定的倾 斜，重复距离从5.4缩短到5.1Å。螺旋之间的相 互作用由侧链的装配控制，螺旋之间可能作用 的侧链是非极性的，它们向着超螺旋内部，避 开与水接触，其他的是极性的，处于分子的表 面，与水接触。超螺旋的稳定性主要由非极性 侧链间的范德华力相互作用的结果
αa超螺旋 70A 名≤ f a
超螺旋
细跑色素C的Cc结构 是一种螺旋束,经常 是由两股平行或反平行排列 的右手螺旋段相互缠绕而成 的左手卷曲螺旋或称超螺旋。 α螺旋束中还发现有三股和 四股螺旋。卷曲螺旋是纤维 状蛋白质如α-角蛋白、肌 球蛋白和原肌球蛋白的主要 结构元件,也存在于球状蛋 白质中
细胞色素C的结构 αα是一种α螺旋束,经常 是由两股平行或反平行排列 的右手螺旋段相互缠绕而成 的左手卷曲螺旋或称超螺旋。 α螺旋束中还发现有三股和 四股螺旋。卷曲螺旋是纤维 状蛋白质如α－角蛋白、肌 球蛋白和原肌球蛋白的主要 结构元件，也存在于球状蛋 白质中