《药物设计学》教案 2009年5月修订 第0章药物设计学前言与导论 教学课时2学时 教学主要内容 药物设计学的学科基础:药物发现的历史:药物发现过程:新药R&D中的社会科学:靶点与配基 合理药物设计 讲授提纲及学时分配 《药物设计学》教学大纲和教学进度(5 前言 学科形成的基础(10) 二.国内外有关专著和教材(5) 导论 0.1药物发现历史(5) 02药物发现过程 0.2.1药物发现的定义(5) 0.2.2药物发现的阶段20) 023新药R&D中的社会科学(10y) 0.3药物设计 0.3.1靶点和配基(10) 032合理药物设计(20) 课堂实例 1、以组合化学为基础的高通量筛选和高内涵筛选在药物设计中的应用 2、合理药物设计:基于机理(MBDD)、基于性质(PBDD)和基于结构(SBDD)的药物设计 本章内容的重点 1、药物发现的定义 2、药物发现的途径 、靶点与配基(药物设计的基本原理) 4、合理药物设计的内容 本章内容的难点 1、新药R&D中的社会科学 2、靶点与配基:受体学说与分子识别 合理药物设计在药物设计与发现中的重要性
1 《药物设计学》教案 2009 年 5 月修订 第 0 章 药物设计学前言与导论 教学课时 2 学时 教学主要内容 药物设计学的学科基础；药物发现的历史；药物发现过程；新药 R&D 中的社会科学；靶点与配基 合理药物设计 讲授提纲及学时分配 《药物设计学》教学大纲和教学进度 (5') 前言 一. 学科形成的基础 (10') 二. 国内外有关专著和教材(5') 导论 0.1 药物发现历史 (5') 0.2 药物发现过程 0.2.1 药物发现的定义(5') 0.2.2 药物发现的阶段(20') 0.2.3 新药 R&D 中的社会科学(10') 0.3 药物设计 0.3.1 靶点和配基(10') 0.3.2 合理药物设计(20') 课堂实例 1、以组合化学为基础的高通量筛选和高内涵筛选在药物设计中的应用； 2、合理药物设计：基于机理（MBDD）、基于性质（PBDD）和基于结构（SBDD）的药物设计 本章内容的重点 1、 药物发现的定义 2、 药物发现的途径 3、 靶点与配基（药物设计的基本原理） 4、 合理药物设计的内容 本章内容的难点 1、新药 R&D 中的社会科学 2、靶点与配基：受体学说与分子识别 3、合理药物设计在药物设计与发现中的重要性
思考题 1、药物发现与药物设计的区别在哪里? 2、为什么说社会科学在药物研究开发中发挥了关键作用? 3、合理药物设计包含哪些方法?这些方法分别在药物设计中扮演了什么样的角色? 教学参考书和文献 1、 Patrick g,医药化学,科学出版社,2003 2、叶德泳.计算机辅助药物设计导论,化学工业出版社,2004 3、迟玉明主译.创新药物化学,世界图书出版公司2005 4、 RB Silverman ed. The organic chemistry of drug design and drug action,2ndEd,科学出版社,2007 5. D Triggle and J Taylor ed. Comprehensive Medicinal Chemistry Il, Vol 1, 2, 3, 4, 5, 8, 2006-2007 6. H Smith ed. Smith and williams'Introduction to the Principles of Drug Design and Action, 4th Ed, 2004. 7. ME Wolff ed. Burgers Medicinal Chemistry and Drug Discovery, 6th Ed, 2003, Vol I: Drug Discovery, and Vol ll: Drug Discovery and Drug Development
2 思考题 1、药物发现与药物设计的区别在哪里？ 2、为什么说社会科学在药物研究开发中发挥了关键作用？ 3、合理药物设计包含哪些方法？这些方法分别在药物设计中扮演了什么样的角色？ 教学参考书和文献 1、 Patrick G., 医药化学, 科学出版社, 2003 2、 叶德泳. 计算机辅助药物设计导论, 化学工业出版社，2004 3、 迟玉明主译. 创新药物化学，世界图书出版公司 2005. 4、 RB Silverman ed. The organic chemistry of drug design and drug action, 2nd Ed., 科学出版社, 2007 5、 D Triggle and J Taylor ed. Comprehensive Medicinal ChemistryⅡ, Vol 1,2,3,4,5,8, 2006~2007 6、 HJ Smith ed. Smith and Williams' Introduction to the Principles of Drug Design and Action,4th Ed, 2004. 7、 ME Wolff ed. Burger’s Medicinal Chemistry and Drug Discovery, 6th Ed, 2003, VolⅠ: Drug Discovery, and VolⅡ: Drug Discovery and Drug Development
第一章基于筛选途径的药物发现 教学课时2学时(45分钟计1学时) 教学主要内容 药物设计学课程网站简介:随机筛选/偶然发现:天然来源/合成物的随机筛选与意外发现;药理筛选与意外 发现:组合化学与高通量筛选:高内涵筛选 讲授提纲及学时分配 1.1.药物设计学课程网站简介(5) 1.2.药物发现中的随机筛选与偶然发现(5) 1.3.药理学和药物化学在随机筛选和意外发现的作用(3) 14.天然产物/合成物的偶然发现与随机筛选(32) 药理活性研究的意外发现(30) 1.5.组合化学、高通量筛选与高内涵筛选(10) 1.6课程内容小结归纳(5 课堂实例 1、吗啡、紫杉醇的提取分离与临床应用 2、有效溶栓药物的寻找 3、奥司他韦与多西他赛的发现 4、哌替丁、西地那非的发现 5、氨溴索与乙酰氨基酚的发现 本章内容的重点 1、随机筛选/偶然发现在药物发现中的地位 2、随机筛选与偶然发现的主要来源途径 3、组合化学与高通量筛选的定义 本章内容的难点 1、药物发现的随机筛选与偶然发现途径: 2、组合化学与高通量筛选的定义 思考题 1、除课程讲授的实例外,请列举一个随机筛选/偶然发现药物的案例。 2、为什么说从人体代谢产物中发现新的药物先导物是高效、低风险的药物发现方法? 教学参考书和文献 1、张礼和.导读版:药物化学百科第7册.北京:科学出版社,2007 2. Wermuth, The Practice of Medicinal Chemistry. 3nd ed. 2008, Elsevier 3. Walter Sneader Drug Discovery: A history. 2005, John Wiley Sons Ltd
3 第一章 基于筛选途径的药物发现 教学课时 2 学时(45 分钟计 1 学时) 教学主要内容 药物设计学课程网站简介；随机筛选/偶然发现；天然来源/合成物的随机筛选与意外发现；药理筛选与意外 发现；组合化学与高通量筛选；高内涵筛选 讲授提纲及学时分配 1.1. 药物设计学课程网站简介(5') 1.2. 药物发现中的随机筛选与偶然发现(5') 1.3. 药理学和药物化学在随机筛选和意外发现的作用(3') 1.4. 天然产物/合成物的偶然发现与随机筛选(32') 药理活性研究的意外发现(30') 1.5. 组合化学、高通量筛选与高内涵筛选(10') 1.6 课程内容小结归纳(5') 课堂实例 1、吗啡、紫杉醇的提取分离与临床应用 2、有效溶栓药物的寻找 3、奥司他韦与多西他赛的发现； 4、哌替丁、西地那非的发现 5、氨溴索与乙酰氨基酚的发现 本章内容的重点 1、随机筛选/偶然发现在药物发现中的地位 2、随机筛选与偶然发现的主要来源途径 3、组合化学与高通量筛选的定义 本章内容的难点 1、药物发现的随机筛选与偶然发现途径； 2、组合化学与高通量筛选的定义 思考题 1、除课程讲授的实例外，请列举一个随机筛选/偶然发现药物的案例。 2、为什么说从人体代谢产物中发现新的药物先导物是高效、低风险的药物发现方法？ 教学参考书和文献 1、 张礼和. 导读版:药物化学百科.第 7 册. 北京: 科学出版社, 2007 2、 Wermuth, The Practice of Medicinal Chemistry. 3nd ed. 2008, Elsevier 3、 Walter Sneader. Drug Discovery: A history. 2005, John Wiley & Sons Ltd
第二章基于靶点的药物设计 教学课时2学时 教学主要内容 药物靶点与配基:理想药物靶点的要求:抗溃疡病药物的研究思路:抗肿瘤药物的研究新方法:药物HERG 毒性靶点的筛查 讲授提纲及学时分配 21引言:阿司匹林的发现与其解热镇痛靶点的研究(10) 22药物设计的核心内容—配基与靶点 23胃溃疡药物的研究思路(25) 24抗肿瘤药物的研究新方法(30) 25药物HERG毒性靶点筛查(10) 26本章内容小结与归纳(5) 课堂实例 1、抗溃疡病药物的研究思路 2、抗肿瘤药物的研究新思路 3、药物HERG毒性靶点的筛查 本章内容的重点 1、药物与药物靶点 2、理想药物靶点的要求 3、药物靶点的分类 本章内容的难点 1、理想药物靶点要求的本质 2、药物靶点的类别 思考题 1、药物靶点有哪些分类,你能列举出临床上所使用的可的松类激素、普利类抗高血压药物、沙星类抗菌药 以及西泮类镇静催眠药分别作用于哪些药物靶点类型? 2、为什么要在药物研究开发早期筛查候选药物的HERG毒性以降低药物的后期开发风险? 教学参考书和文献 1、世界卫生组织网站htp!/www.who.int/mediacentre/factsheets/fs2.97/zh/indexhtml 2, Zetter, B.R. Nature Reviews Cancer, 2008, 8: 647
4 第二章 基于靶点的药物设计 教学课时 2 学时 教学主要内容 药物靶点与配基；理想药物靶点的要求；抗溃疡病药物的研究思路；抗肿瘤药物的研究新方法；药物 HERG 毒性靶点的筛查 讲授提纲及学时分配 2.1 引言：阿司匹林的发现与其解热镇痛靶点的研究(10') 2.2 药物设计的核心内容——配基与靶点(10') 2.3 胃溃疡药物的研究思路(25') 2.4 抗肿瘤药物的研究新方法 (30') 2.5 药物 HERG 毒性靶点筛查 (10') 2.6 本章内容小结与归纳 (5') 课堂实例 1、抗溃疡病药物的研究思路 2、抗肿瘤药物的研究新思路 3、药物 HERG 毒性靶点的筛查 本章内容的重点 1、 药物与药物靶点 2、 理想药物靶点的要求 3、 药物靶点的分类 本章内容的难点 1、理想药物靶点要求的本质 2、药物靶点的类别 思考题 1、药物靶点有哪些分类，你能列举出临床上所使用的可的松类激素、普利类抗高血压药物、沙星类抗菌药 以及西泮类镇静催眠药分别作用于哪些药物靶点类型？ 2、为什么要在药物研究开发早期筛查候选药物的 HERG 毒性以降低药物的后期开发风险？ 教学参考书和文献 1、 世界卫生组织网站 http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs297/zh/index.html 2、 Zetter, B.R. Nature Reviews Cancer, 2008, 8: 647
第三章基于性质的药物发现 教学课时2学时 教学主要内容 药物性质的定义及分类、进行基于性质的药物设计的必要性、药物的性质对药代动力学参数的影响:基于 性质的药物药物设计与开发策略:骨架迁越的定义及其在药物设计中的应用 讲授提纲及学时分配 3.1药物性质的定义(3) 3.2进行基于性质的药物研究的必要性(5) 33基于性质的药物设计的定义(2) 34药物性质对药物药代动力学参数/毒性的影响(15) 3.5基于性质的筛选与设计策略(35) 36骨架迁越(25) 37本章归纳和小结(5 课堂实例 1、美国FDA每年审批通过药品个数的下降趋势 2、以芬太尼为设计先导的超短效镇痛药物设计 3、改善药物性质的有力手段——骨架迁越 本章内容的重点 1、基于性质的药物设计的定义 2、五倍率 3、骨架迁越的定义 本章内容的难点 1、五倍率及其在药物研究开发中的意义 2、骨架迁越的定义及其在药物设计中的应用 思考题 1、药物的药代动力学性质将如何影响药物的药效及其毒性? 2、请解释长期服用氢吗啡酮(一种阿片类镇痛药)缓释片患者可能出现与药物耐受性无关戒断症状的原因。 教学参考书和文献 1、章承继,中国药学杂志, 9(38):644 2, Zhao HY, Drug Discovery 2007,12(3/4):149
5 第三章 基于性质的药物发现 教学课时 2 学时 教学主要内容 药物性质的定义及分类、进行基于性质的药物设计的必要性、药物的性质对药代动力学参数的影响；基于 性质的药物药物设计与开发策略；骨架迁越的定义及其在药物设计中的应用 讲授提纲及学时分配 3.1 药物性质的定义 (3') 3.2 进行基于性质的药物研究的必要性(5') 3.3 基于性质的药物设计的定义(2') 3.4 药物性质对药物药代动力学参数/毒性的影响(15') 3.5 基于性质的筛选与设计策略(35') 3.6 骨架迁越(25') 3.7 本章归纳和小结(5') 课堂实例 1、美国 FDA 每年审批通过药品个数的下降趋势 2、以芬太尼为设计先导的超短效镇痛药物设计 3、改善药物性质的有力手段——骨架迁越 本章内容的重点 1、 基于性质的药物设计的定义 2、 五倍率 3、 骨架迁越的定义 本章内容的难点 1、五倍率及其在药物研究开发中的意义 2、骨架迁越的定义及其在药物设计中的应用 思考题 1、药物的药代动力学性质将如何影响药物的药效及其毒性？ 2、请解释长期服用氢吗啡酮（一种阿片类镇痛药）缓释片患者可能出现与药物耐受性无关戒断症状的原因。 教学参考书和文献 1、 章承继，中国药学杂志，2003，9（38）：644 2、 Zhao HY，Drug Discovery Today, 2007, 12(3/4): 149
第四章基于结构的药物设计 教学课时4学时 教学主要内容 基于结构药物设计的基本概念:受体理论和药物受体相互作用:药物的结构与生物活性的关系:基于结构 药物设计的策略:计算机辅助药物设计的作用和意义:三维结构的理论计算方法:分子三维结构测定方法 分子模拟:计算机硬件和软件:基于靶点结构的药物设计:基于配体结构的药物设计 讲授提纲及学时分配 41受体理论和药物受体相互作用(25) 42药物的结构与生物活性的关系(20) 43计算机辅助药物设计的概念(10) 44基于结构药物设计的基本理论和技术(2) 45三维结构的理论计算方法(15) 46分子三维结构的获得(10) 47分子模拟技术(8) 48基于靶点结构的药物设计方法的基本流程(10) 49活性位点分析(10) 410全新药物设计(25) 411基于配体结构的药物设计方法的基本流程(5) 412药效基团模型法(10) 4132 D-QSAR方法(10 4143 D-QSAR方法(20 课堂实例 1、通过计算机辅助药物设计开发出新药的成功案例 2、我院计算机辅助药物设计工作站的硬件配置和所购软件 3、基于唾液酸酶的抗流感病毒药物扎那米韦的发现 4、DHFR抑制剂的设计 5、非甾体类的孕酮受体激动剂的研究 本章内容的重点 1、主要的药物受体相互作用力 2、药效基团、活性构象和药效构象 3、构象空间搜寻方法 4、分子模拟在药物设计中的应用 5、药效基团模型 6、线性自由能相关 7、 CoMFA和 COMSIA 本章内容的难点 1、量子化学、分子力学和分子动力学的概念、计算目的和适用范围 2、全新药物设计方法 药效基团的获取方法 4、药物设计中的数据统计方法
6 第四章 基于结构的药物设计 教学课时 4 学时 教学主要内容 基于结构药物设计的基本概念；受体理论和药物-受体相互作用；药物的结构与生物活性的关系；基于结构 药物设计的策略；计算机辅助药物设计的作用和意义；三维结构的理论计算方法；分子三维结构测定方法； 分子模拟；计算机硬件和软件；基于靶点结构的药物设计；基于配体结构的药物设计 讲授提纲及学时分配 4.1 受体理论和药物-受体相互作用(25') 4.2 药物的结构与生物活性的关系(20') 4.3 计算机辅助药物设计的概念(10') 4.4 基于结构药物设计的基本理论和技术 (2') 4.5 三维结构的理论计算方法(15') 4.6 分子三维结构的获得(10') 4.7 分子模拟技术(8') 4.8 基于靶点结构的药物设计方法的基本流程(10') 4.9 活性位点分析(10') 4.10 全新药物设计(25') 4.11 基于配体结构的药物设计方法的基本流程(5') 4.12 药效基团模型法(10') 4.13 2D-QSAR 方法(10') 4.14 3D-QSAR 方法(20') 课堂实例 1、通过计算机辅助药物设计开发出新药的成功案例 2、我院计算机辅助药物设计工作站的硬件配置和所购软件 3、基于唾液酸酶的抗流感病毒药物扎那米韦的发现 4、DHFR 抑制剂的设计 5、非甾体类的孕酮受体激动剂的研究 本章内容的重点 1、主要的药物-受体相互作用力 2、药效基团、活性构象和药效构象 3、构象空间搜寻方法 4、分子模拟在药物设计中的应用 5、药效基团模型 6、线性自由能相关 7、CoMFA 和 CoMSIA 本章内容的难点 1、量子化学、分子力学和分子动力学的概念、计算目的和适用范围 2、全新药物设计方法 3、药效基团的获取方法 4、药物设计中的数据统计方法
思考题 1、药物与受体相互作用的本质是什么? 2、基于结构的药物设计是否必须知道靶点的三维结构? 3、在药物设计中如何选用不同的策略? 4、试以抗流感病毒药物为例,谈谈可从何入手进行基于结构的药物设计? 教学参考书和文献 1.徐筱杰等.计算机辅助药物分子设计.北京:化学工业出版社,2004 2. Schneider G, Fechner U Computer-based de novo Design of Drug-like Molecules. Nat. Rev. Drug Discov 2005,4:649 3. Rees D C et al. Fragment-based Lead Discovery. Nat Rev. Drug Discov., 2004, 3: 660 4. Van Drie. Computer-aided Drug Design the Next 20 Years. J Comput Aided Mol Des., 2007, 21: 591
7 思考题 1、药物与受体相互作用的本质是什么？ 2、基于结构的药物设计是否必须知道靶点的三维结构？ 3、在药物设计中如何选用不同的策略？ 4、试以抗流感病毒药物为例，谈谈可从何入手进行基于结构的药物设计？ 教学参考书和文献 1. 徐筱杰等. 计算机辅助药物分子设计. 北京: 化学工业出版社, 2004 2. Schneider G, Fechner U. Computer-based de novo Design of Drug-like Molecules. Nat. Rev. Drug Discov., 2005, 4: 649 3. Rees D C et al. Fragment-based Lead Discovery. Nat. Rev. Drug Discov., 2004, 3: 660 4. Van Drie. Computer-aided Drug Design: the Next 20 Years. J. Comput. Aided Mol. Des., 2007,21:591
第五章药物发现的虚拟筛选方法 教学课时2学时 教学主要内容 新药发现中的化学信息和生物信息的处理方法、作用和应用:对接;基于配体相似性的虚拟筛选 讲授提纲及学时分配 51虚拟筛选的概述(3 52化学信息处理方法(12) 53化学信息学资源(5) 54生物信息内容和处理方法(15) 55蛋白质三维结构预测主要方法(5 6生物信息学数据库(5 57基于靶点结构的虚拟筛选——对接(25) 58基于配体相似性的虚拟筛选(20) 课堂实例 1、对接法在新药发现中的应用实例(抗艾滋病药物的发现,抗SARS冠状病毒药物的设计) 2、药效基团模型的建立(D2/D3受体选择性拮抗剂) 本章内容的重点 1、2D和3D分子结构的表达方式 2、同源模建法 3、对接法的方法与流程 4、药效基团的获取方法 本章内容的难点 1、对接操作的一般方法 2、基于药效基团的结构搜寻 思考题 1、基于靶点结枃的虚拟筛选与基于配体相似性的虚拟筛选方法在原理上和方法上有何不同 2、你能说出哪些获取得到药效基团模型的方法?哪些方法与实际情况更为接近? 3、请评价计算机辅助筛选方法的优点和局限性。 教学参考书和文献 1. Oprea T.I. Cheminformatics in Drug Discovery. 2005 Wiley-VCH Verlag gmbH& co KGaA Weinheim 2. Thomas Lengauer. Bioinformatics-From Genomes to Drugs. 2002. Wiley-VCH Verlag gmbH&Co KgaA 3.邵学广.化学信息学.第二版.2005,科学出版社 4. Johann Gasteiger著,梁逸曾等译,化学信息学教程.2005,化学工业出版社。 5. Pevsner j著,孙之荣等译,生物信息学与功能基因组学.2006,化学工业出版社 6. Leroux V and Maigret B, Should structure-based virtual screening techniques be used more extensively in modern drug discovety? Computers and Applied Chemistry, 2007, 24(1): 1
8 第五章 药物发现的虚拟筛选方法 教学课时 2 学时 教学主要内容 新药发现中的化学信息和生物信息的处理方法、作用和应用；对接；基于配体相似性的虚拟筛选 讲授提纲及学时分配 5.1 虚拟筛选的概述 (3') 5.2 化学信息处理方法 (12') 5.3 化学信息学资源 (5') 5.4 生物信息内容和处理方法(15') 5.5 蛋白质三维结构预测主要方法(5') 5.6 生物信息学数据库(5') 5.7 基于靶点结构的虚拟筛选——对接(25') 5.8 基于配体相似性的虚拟筛选(20') 课堂实例 1、对接法在新药发现中的应用实例（抗艾滋病药物的发现，抗 SARS 冠状病毒药物的设计） 2、药效基团模型的建立（D2 / D3 受体选择性拮抗剂） 本章内容的重点 1、2D 和 3D 分子结构的表达方式 2、同源模建法 3、对接法的方法与流程 4、药效基团的获取方法 本章内容的难点 1、对接操作的一般方法 2、基于药效基团的结构搜寻 思考题 1、 基于靶点结构的虚拟筛选与基于配体相似性的虚拟筛选方法在原理上和方法上有何不同？ 2、 你能说出哪些获取得到药效基团模型的方法？哪些方法与实际情况更为接近？ 3、 请评价计算机辅助筛选方法的优点和局限性。 教学参考书和文献 1. Oprea T.I. Cheminformatics in Drug Discovery. 2005 Wiley-VCH Verlag GmbH&Co KGaA Weinheim 2. Thomas Lengauer. Bioinformatics-From Genomes to Drugs. 2002. Wiley-VCH Verlag GmbH&Co KGaA 3. 邵学广. 化学信息学. 第二版. 2005, 科学出版社。 4. Johann Gasteiger 著，梁逸曾等译，化学信息学教程. 2005, 化学工业出版社。 5. Pevsner J.著，孙之荣等译，生物信息学与功能基因组学. 2006，化学工业出版社 6. Leroux V and Maigret B, Should structure-based virtual screening techniques be used more extensively in modern drug discovety? Computers and Applied Chemistry, 2007, 24(1):1
第六章先导化合物优化 教学课时2学时 教学主要内容 模仿药物的概念和研究策略:前药的原理和应用:生物电子等排的概念和修饰方法:拼合原理的概念连接 方法:软药修饰方法 讲授提纲及学时分配 61优化的概念(5) 62基于结构的药物设计中的优化方法(15 63基于性质的药物设计中的优化方法(15) 64模仿药物(0y) 65前药(15) 66生物电子等排(15) 67拼合原理和孪药(10) 68软药(5 课堂实例 1、模仿药物实例 2、前药实例 3、孪药实例 4、软药实例 本章内容的重点 1、前药修饰 2、生物电子等排 3、拼合原理 4、软药修饰 本章内容的难点 1、生物电子等排的类型 2、拼合的结构组成和连接方式 思考题 1、什么是前药?什么是孪药?什么是软药?请各举一例说明 2、设计模仿药物有哪些策略和方法? 3、生物电子等排的原理是什么?请列举一以电子等排方法发现新药的实例 教学参考书和文献 1、陈翠丽,尢启东、李志裕,多靶点配体与药物设计,药学进展,2005,29(8):337 2. Bodor N, Buchwald P Soft drug design: general principles and recentapplication Med Res rev. 2000. 20(1 3. Bodor N, Buchwald P. Drug targeting by retrometabolic design: soft drugs and chemical delivery systems. J Recept Signal Transduct Res, 2001, 21: 287. 4、李安良,生物利用度控制一药物化学原理、方法和应用,化学工业出版社,北京,2004
9 第六章 先导化合物优化 教学课时 2 学时 教学主要内容 模仿药物的概念和研究策略；前药的原理和应用；生物电子等排的概念和修饰方法；拼合原理的概念连接 方法；软药修饰方法 讲授提纲及学时分配 6.1 优化的概念(5') 6.2 基于结构的药物设计中的优化方法(15') 6.3 基于性质的药物设计中的优化方法(15') 6.4 模仿药物(10') 6.5 前药(15') 6.6 生物电子等排(15') 6.7 拼合原理和孪药(10') 6.8 软药(5') 课堂实例 1、模仿药物实例 2、前药实例 3、孪药实例 4、软药实例 本章内容的重点 1、前药修饰 2、生物电子等排 3、拼合原理 4、软药修饰 本章内容的难点 1、生物电子等排的类型 2、拼合的结构组成和连接方式 思考题 1、什么是前药？什么是孪药？什么是软药？请各举一例说明 2、设计模仿药物有哪些策略和方法？ 3、生物电子等排的原理是什么？请列举一以电子等排方法发现新药的实例。 教学参考书和文献 1、 陈翠丽，尢启东、李志裕，多靶点配体与药物设计，药学进展，2005, 29(8): 337 2、 Bodor N，Buchwald P．Soft drug design：general principles and recentapplication．Med Res Rev. 2000. 20(1): 58 3、 Bodor N，Buchwald P．Drug targeting by retrometabolic design：soft drugs and chemical delivery systems．J Recept Signal Transduct Res，2001，21: 287． 4、 李安良，生物利用度控制—药物化学原理、方法和应用，化学工业出版社，北京，2004
综合实例 教学课时2学时 教学主要内容 列举二个本课题组的科硏实例:布置课程考试读书报告:文献网络检索方法简介:绘制分子结构软件简介 讲授提纲及学时分配 7.1美普他酚及衍生物与乙酰胆碱的对接研究(15) 725-HT3受体的结构与功能,拮抗剂的设计(25) 7.3课程考试布置及读书报告要求(5 74读书报告范本分析(10) 7.5一些文献的网络资源及查阅方法(20) 7.6常用的计算机绘制分子结构软件的介绍和演示(15) 课堂实例 1、二个本课题组的科研实例(美普他酚、5-HT3受体拮抗剂) 2、读书报告范本 本章内容的重点 1、从科研实例来分析研究中的思路与方法 2、通过读书报告范本分析,剖析研究论文中的思路、方法和研究结果,明确读书报告的基本要求 本章内容的难点 从机理和靶点知识到药物设计的思考 思考题 自定主题,检索出一篇近年的关于新药发现的研究论文,分析该论文的研究思路、方法和创新点所在。如 果你来继续这项研究,请你提出你的研究目标和方案 教学参考书和文献 1、网络快递——一互联网与药物化学.迟玉明主译.创新药物化学.世界图书出版公司.2005.P205-220 2、化学软件下载及使用方法.王荣民.化学化工信息及网络资源的检索与利用化学工业出版社.200 P216-238 、李梦龙等.化学软件及其应用.化学工业出版社.2004 4、白东鲁,陈凯先.药物化学进展.化学工业出版社.2005
10 综合实例 教学课时 2 学时 教学主要内容 列举二个本课题组的科研实例；布置课程考试读书报告；文献网络检索方法简介；绘制分子结构软件简介 讲授提纲及学时分配 7.1 美普他酚及衍生物与乙酰胆碱的对接研究 (15') 7.2 5-HT3 受体的结构与功能，拮抗剂的设计(25') 7.3 课程考试布置及读书报告要求(5') 7.4 读书报告范本分析(10') 7.5 一些文献的网络资源及查阅方法(20') 7.6 常用的计算机绘制分子结构软件的介绍和演示(15') 课堂实例 1、二个本课题组的科研实例（美普他酚、5-HT3受体拮抗剂） 2、读书报告范本 本章内容的重点 1、从科研实例来分析研究中的思路与方法 2、通过读书报告范本分析，剖析研究论文中的思路、方法和研究结果，明确读书报告的基本要求 本章内容的难点 从机理和靶点知识到药物设计的思考 思考题 自定主题，检索出一篇近年的关于新药发现的研究论文，分析该论文的研究思路、方法和创新点所在。如 果你来继续这项研究，请你提出你的研究目标和方案。 教学参考书和文献 1、 网络快递——互联网与药物化学. 迟玉明主译. 创新药物化学. 世界图书出版公司. 2005. P205-220 2、 化学软件下载及使用方法. 王荣民. 化学化工信息及网络资源的检索与利用.化学工业出版社. 2003. P216-238 3、 李梦龙 等. 化学软件及其应用. 化学工业出版社. 2004 4、 白东鲁, 陈凯先. 药物化学进展. 化学工业出版社. 2005