复旦大学本科专业课程 药物设计学导论 药学院药物化学教研室 李炜 2016年9月 wei-li@fudan.edu.cn
药物设计学 导论 药学院药物化学教研室 李 炜 2016年9月 wei-li@fudan.edu.cn 复旦大学本科专业课程
教学进度安排20169 (理论课18课时) 课程内容 学时数授课教师 药物设计学导论 2李炜 基于筛选途径的药物发现 6李炜 基于靶点*和性质的药物设计 基于结构的药物发现与药物6叶德泳 发现的虛拟筛选方法 先导化合物优化与综合实例4叶德泳 单周周一上午一、二节8:00-9:40am.;邯郸校区HGx201 10月3日放假停课一次
教学进度安排 2016.9 （理论课18课时） 课程内容 学时数 授课教师 药物设计学导论 2 李 炜 基于筛选途径的药物发现、 基于靶点*和性质的药物设计 6 李 炜 基于结构的药物发现与药物 发现的虚拟筛选方法 6 叶德泳 先导化合物优化与综合实例 4 叶德泳 单周 周一上午一、二节 8:00—9:40 a.m.；邯郸校区HGX201 * 10月3日放假停课一次
理论课教学进度安排20169 45学时(理论27学时实验18学时) 课程内容 学时数授课教师 药物设计学导论 3李炜 基于筛选途径的药物发现、基于9李炜 靶点*和性质的药物设计 基于结构的药物发现与药物发现9叶德泳 的虚拟筛选方法 先导化合物优化与综合实例 3叶德泳 药物剂型与制剂的设计 3蒋晨 理论课到1月7日结束 每周一下午一、二、三节:1:30-4:10pm 张江校区Z2201 *10月3日放假停课一次
理论课教学进度安排 2016.9 45学时（理论27学时/实验18学时） 课程内容 学时数 授课教师 药物设计学导论 3 李 炜 基于筛选途径的药物发现、基于 靶点*和性质的药物设计 9 李 炜 基于结构的药物发现与药物发现 的虚拟筛选方法 9 叶德泳 先导化合物优化与综合实例 3 叶德泳 药物剂型与制剂的设计 3 蒋 晨 理论课到11月7日结束 每周一下午一、二、三节：1:30-4:10 p.m. 张江校区Z2201 *10月3日放假停课一次
实验课进度安排20169 45学时(理论27学时实验18学时) 课程内容 学时数授课教师 Linux基础,Vi使用 付伟 序列比对,蛋白质三维结构演示 周璐 小分子结构构建及能量优化 333333 3 李炜 同源模建 谢琼 药效团模型/分子对接 实验操作考试 实验课从11月14日开始 每周一下午晚上(分班时间待定) 张江校区教学实验楼
实验课进度安排2016.9 45学时（理论27学时/实验18学时） 课程内容 学时数 授课教师 Linux 基础，Vi使用 3 付 伟 周 璐 李 炜 谢 琼 序列比对，蛋白质三维结构演示 3 小分子结构构建及能量优化 3 同源模建 3 药效团模型/分子对接 3 实验操作考试 3 实验课从11月14日开始 每周一下午/晚上（分班时间待定） 张江校区教学实验楼
《药物设计学》课程教材的历史沿革 面向21世纪课程教材1999 普通高等教育“十一五·国家级规划程材 全国高等学校药学类划教材 药物设计学 药物设计学 (第3版) 叶德泳教授 “十一五”国家级规划教材2008 主编 通高等教育+一五国家级暖划截 固等学学类划数材 2015 药物设计学
《药物设计学》课程教材的历史沿革 面向21世纪课程教材 “十一五”国家级规划教材 1999 2008 2015 叶德泳 教授 主编
推荐教辅材料 PRELIMINARY 卫器”+二五”划教材 全国高等医药材建设研究金“+二五”划数材 士围高幕学校药学专业置七轮划教 供药学类专业用 国家料学挂术学式作出助品金都 上海交适大学术出金告 山大徐文方 药物设计学 分子模拟与计算机辅助 交大魏冬青 药物设计 药物设计学 徐文方 (2012 2011,第2版) 魏冬青顾若需 连张涛编著 上海交通大 人民卫生出版社 学出版社 ADVANCED 药物分子设计 一从入门到精通 药物设计策略 Gisbert scheider著 1IGisben 郭宗儒 唐赟译 药物设计策略 (2012) 科学出版社 华东理工大学出版社 2012
推荐教辅材料 PRELIMINARY ADVANCED Gisbert Scheider 著 唐赟 译 （2012 ） 华东理工大学出版社 郭宗儒 药物设计策略 科学出版社 2012 山大徐文方 药物设计学 （ 2011，第 2版） 人民卫生出版社 交大魏冬青 （2012） 上海交通大 学出版社
药物发现的经典 检索方式:复旦图书馆—中国知网—期刊—作者(郭宗儒) 年份(20142016)—刊名(药学学报) 药学学报 Acta Pharmaceutica Sinica2016,51(8)1345-1348 1345 新药发现与研究实例简析 篇名 作者刊名年期被引下数每个药物 口1青蒿素类抗疟药的硏制 郭宗儒药字字报 2016/01 13911学等性质。 □2首创的洛伐他汀和后继药物 郭宗儒药字字报 201501 是 □3基于神经氨酸酶结构和反应机制硏制的抗流感药物郭宗儒药学学报2015121 g2引申出干预 猿枯尝 4药物创新与反向思维 口12化学合成的复杂天然改构药物艾曰布林 郭宗儒药学学报 2015/09 5经久不衰的阿司匹林 口13基于肽类配体研制的依卢多林 郭宗儒药字学报 2015/08 6以经典药物化学方法研发的 14由根皮苷到坎格列净的上市 郭宗儒药学学报 2015/05 7改造沙利度胺而成的新药阿 口15塞来昔布和COX2选择性抑制剂 郭宗儒药字字报 2016/06 8基于天然产物首创的凝血酶 16抑制HV1病毒侵入的首创药物马拉维罗 郭宗儒药学学报 2016/05 9活性与成药性多维优化的马 口17首创的FXa抑制剂利伐沙班 郭宗儒药学学报 2015/10 □10理性设计的西咪替丁 11基于酶结构设计的个体化治 口18首创性和跟进性药物简析 郭宗儒药学学报 2016/08 口19基于作用机制研制的雷特格韦 郭宗儒药学学报 2016/08 □20从ATP到營格瑞洛的结构演化轨迹 郭宗儒药学学报 2016/07
药物发现的经典 检索方式：复旦图书馆——中国知网——期刊——作者（郭宗儒）—— 年份（2014-2016） ——刊名（药学学报）
药物设计的基本原理 靶点( Target)学说 种有效的药物应符合以下两项要求 1.作用于靶点(与机体内的某一种或多种 靶点发生相互作用)(药效学要求) 2.暴露于靶点(药物到达靶点、达到适宜 的浓度Cm并维持足够的时间AUC)(药 代动力学要求) ·药物靶点的分类:受体、酶、离子通道、 细胞因子、核酸、脂质、糖蛋白
药物设计的基本原理 —— 靶点（Target）学说 • 一种有效的药物应符合以下两项要求： 1. 作用于靶点（与机体内的某一种或多种 靶点发生相互作用）（药效学要求） 2 .暴露于靶点（药物到达靶点、达到适宜 的浓度Cmax并维持足够的时间AUC）（药 代动力学要求） • 药物靶点的分类：受体、酶、离子通道、 细胞因子、核酸、脂质、糖蛋白…
药物设计的基本原理 分子识别, Molecular Recognition (锁钥原理,互补性) 定义:药物通过分子 普鲁卡因 间作用力(可逆)与 靶点相结合,某些药H2N . C2H5 O一CH2CH2 物可形成共价键(不 可逆)。 键合类型:离子键、 受体 氢键、范德华力、偶范德华力 静电引力 极-偶极作用、共价键、 偶极-偶极作用 疏水 卤键、阳离子-T 相互作用 结合动力学:k0n/k6f
H2N C O O CH2CH2 N C2H5 C2H5 H 药物设计的基本原理 ——分子识别，Molecular Recognition (锁钥原理，互补性) • 定义：药物通过分子 间作用力（可逆）与 靶点相结合，某些药 物可形成共价键（不 可逆）。 • 键合类型：离子键、 氢键、范德华力、偶 极-偶极作用、共价键、 卤键、阳离子-π • 结合动力学：kon/koff 普鲁卡因 受体 范德华力 偶极-偶极作用 静电引力 疏水 相互作用
药物设计的基本原理 相似性 Similarity 定义:相似的化学结构具有相近或相关的 活性 ·经典药物化学的基石:生物电子等排、药 效团、构效关系、肽拟似物、过渡态类似 物、酶自杀性底物、优势结构 OH HO Aspirin Dopamine HO O CH3 nH HO OH O NN Piroxicam HO Apomorphine N H N-CH S.CH3
药物设计的基本原理—— 相似性 Similarity • 定义：相似的化学结构具有相近或相关的 活性 • 经典药物化学的基石：生物电子等排、药 效团、构效关系、肽拟似物、过渡态类似 物、酶自杀性底物、优势结构…… HO HO N CH3 Piroxicam Aspirin Apomorphine Dopamine HO HO NH2 S N OH CH3 O O N H O N OH O O CH3 O